| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,279,050 | Δ82,373 bp | [ghxP]–[cadC] | 72 genes [ghxP], yjcE, yjcF, actP, yjcH, acs, ytcB, nrfA, nrfB, nrfC, nrfD, nrfE, nrfF, nrfG, gltP, yjcO, fdhF, mdtP, mdtO, mdtN, ytcA, yjcS, alsK, alsE, alsC, alsA, alsB, alsR, rpiB, yjdP, phnP, phnO, phnN, phnM, phnL, phnK, phnJ, phnI, phnH, phnG, phnF, phnD, phnC, yjdN, yjdM, rdcA, rdcB, proP, pmrR, basS, basR, eptA, adiC, adiY, adiA, melR, melA, melB, yjdF, fumB, dcuB, dcuR, dcuS, yjdI, yjdJ, ghoS, ghoT, lysU, dtpC, cadA, cadB, [cadC] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4279050 | 4361422 | 82373 | 47 [2] | [0] 45 | [ghxP]–[cadC] | [ghxP],yjcE,yjcF,actP,yjcH,acs,ytcB,nrfA,nrfB,nrfC,nrfD,nrfE,nrfF,nrfG,gltP,yjcO,fdhF,mdtP,mdtO,mdtN,ytcA,yjcS,alsK,alsE,alsC,alsA,alsB,alsR,rpiB,yjdP,phnP,phnO,phnN,phnM,phnL,phnK,phnJ,phnI,phnH,phnG,phnF,phnD,phnC,yjdN,yjdM,rdcA,rdcB,proP,pmrR,basS,basR,eptA,adiC,adiY,adiA,melR,melA,melB,yjdF,fumB,dcuB,dcuR,dcuS,yjdI,yjdJ,ghoS,ghoT,lysU,dtpC,cadA,cadB,[cadC] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4279049 | 2 (0.030) | 45 (0.760) | 42/490 | 0.5 | 97.8% | coding (571/1350 nt) | ghxP | guanine/hypoxanthine transporter GhxP |
| ? | NC_000913 | 4361423 = | 0 (0.000) | coding (512/1539 nt) | cadC | DNA‑binding transcriptional activator CadC | |||||
CTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTACACAGATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAACCGGCACCATTAATTTATAGCCGCGCTTTGGTACAGTAGCGA > NC_000913/4361183‑4361666 | tgggtgccgtgttcctgatgggtgtgctgtttacggtaatttctgccacgggtatccgtagctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACg > 1:93607‑M2/241‑250 (MQ=255) gggtgccgtgttcctgatgggtgtgctgtttacggtaatttctgccacgggtatccgtagctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgctctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGac < 1:484704‑M2/12‑1 (MQ=255) gttccgtgttcctgatgggtgtgctgtttacggtaatttctgccccgggtatccgtagctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGacaa < 1:441843‑M2/14‑1 (MQ=255) ggtgtgctgtttacggtaatttctgccacgggtatccgtagctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGaaaaa > 1:344026‑M2/221‑243 (MQ=255) ggtgtgctgtttacggtaatttctgccacgggtatccgtagctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGaaaaa < 2:344026‑M2/23‑1 (MQ=255) tgtaatttctgccacgggtatccgtagctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTg > 2:233060‑M2/207‑251 (MQ=255) aatttctgcaacgggtatccgtagctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaatcccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGaa < 1:120790‑M2/47‑1 (MQ=255) atttctgccacgggtatccgtagctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATc > 1:270650‑M2/203‑251 (MQ=255) atttctgccacgggtatccgtagctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATc < 2:111996‑M2/49‑1 (MQ=255) tctgccacgggtatccgtagctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGt < 2:93607‑M2/51‑1 (MQ=255) acgggtatccgtagctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCCTACCCAAAAGGTAGTAAATCGTTTGCttt > 2:107561‑M2/194‑251 (MQ=255) ggtatccgtagctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTa > 1:200070‑M2/191‑250 (MQ=255) gtagctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTgggg > 1:98521‑M2/184‑250 (MQ=255) gtacctggattttgcgcaacttgcctcacggcgtggcgcacgggacggggcttggtatcggtctgttcctgctgctccttgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATAACTAATGACAACAGGAAAAAAAACCATCCCCAAACGGGAGCGCATCGTTGGCTTTTAATtggggg > 2:235146‑M2/184‑250 (MQ=255) agctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaagcccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGAt < 2:51153‑M2/69‑1 (MQ=255) agctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGAtt > 1:268296‑M2/182‑251 (MQ=255) agctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGAtt < 1:127588‑M2/70‑1 (MQ=255) gctggattttgcgcaacttgcctcacggtgcggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctggtcattgccgataacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttccctgtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAACAAACCATAc > 1:514659‑M2/181‑212 (MQ=255) ctggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggcgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGt > 1:533741‑M2/180‑251 (MQ=255) ggattttgcgcaacttgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGtt < 1:133021‑M2/73‑1 (MQ=255) tgcctcacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgtgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCg < 2:70837‑M2/87‑1 (MQ=255) cacggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgtgcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGtttt < 2:489495‑M2/94‑1 (MQ=255) acggtgtggcgcacggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCCTttaactggggattgttcagggccggaatggccacagct > 1:107678‑M2/157‑233 (MQ=255) acggcacggggattggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgaattcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACt > 1:557970‑M2/145‑251 (MQ=255) tggtatcggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATAGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGgaga > 2:75944‑M2/132‑250 (MQ=255) cggtctgttcctgctgctcattgccgctaacggtgtcggtctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCtgt < 2:233430‑M2/125‑1 (MQ=255) ctggtgattaaaaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGc > 1:110666‑M2/86‑250 (MQ=255) aaacccgcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAAACGCCCCTGGTATAGGGGGGGGCGAAGGTAGCATTAtttccgtt > 2:393147‑M2/75‑248 (MQ=255) ccgcttgatgttctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggggtttttgtccctggtaggtcATCCCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATCCCCAAAAGGTAGTGACTCGTTGGTTTTTAACTGGGGATTGTTCGGGTGGCTTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGCCTGTGGGAGGGAGAATCTGGGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCct < 1:144350‑M2/181‑1 (MQ=255) gcttgatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCctct > 1:219671‑M2/69‑251 (MQ=255) gatggtctgcccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGGGAAGATAGCATTATTTTCTCTCCCTcttctt > 2:457452‑M2/65‑251 (MQ=255) ccgttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGATAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTAcc > 1:526503‑M2/55‑250 (MQ=255) gttgcgctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTAcc > 1:34099‑M2/53‑248 (MQ=255) gctgggtgacttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCGTTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAAcc > 2:126119‑M2/48‑251 (MQ=255) gcgggttgacttcgcgacctccccggtggttatgtcactggtagttcATACCTAACGAAAACAGAAAAAAAAACCATCCCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGTTTTTAACGGGGGATTGTTCAGGTGGCGTG‑GGGGTTTTTGGAATTTTAAGACTGTGGGAGGGAAAATCTGTGTCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAAcc < 2:200070‑M2/204‑1 (MQ=255) gactccgccaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATCCCAAACGAAAACAGAAAAAAAAACCATCCCCAAAAGGTAGTGATTCGTTTGTTTTTAACTGGGGTTTGTTCAGGTGGCGTT‑GGGGTTTTTTGAATGTTAAGACGGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAACCGGCAcc < 2:110666‑M2/210‑1 (MQ=255) cttcgcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAACCGGCACCAtt > 1:174080‑M2/39‑251 (MQ=255) gcgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAACCGGCACCATTAAtt > 2:398676‑M2/35‑251 (MQ=255) cgaccttcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAACCGGCACCATTAAttt > 1:154578‑M2/34‑251 (MQ=255) tcccggtggttatgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATCCCAAAAAGGTAGTAAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTTTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTAAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCGGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAACCGGCGCCATTAATTTATAGc < 1:88817‑M2/223‑1 (MQ=255) atgtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAACCGGCACCATTAATTTATAGCCGCGCTTTGgtc > 1:376689‑M2/17‑250 (MQ=255) gtcccgggtaggtcATACCTAACGACAACAGAAAAAAAACCCATCCCCAAAAGGTAGTGATTGGTTTGCTTTTAACGGGGGATTGTCCAGGGGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGCCTGGGGGAGGGAGAATTTGTGGCAGAAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAACCGGCACCATTAATTTATAGCCGCGCTTTGGTAc < 1:457452‑M2/236‑1 (MQ=255) gtcactggtaggtcATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAACCGGCACCATTAATTTATAGCCGCGCTTTGGTAc > 1:181926‑M2/15‑250 (MQ=255) actggaagttcATACCTACCGACAACAGAAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTGGTGATTCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGG‑GTTGGGGGTGTTTTGATTGTAAAGACTGGGGGAGGGAAATTCTGTGGCAGGATCCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAACCGGCACCATTAATTTATAGCCGCGCTTTGGTACAGTa < 2:34099‑M2/240‑1 (MQ=255) gtaggtcATCCCTAACGACAACAGAAAAAAAAACCATACCCAAAAGTTAGTGAATCGTTTGTTTTTAACTGGGGATTGTTCGGGTGGCTTT‑GCGGTTTTTTGATTTTTAAGATTGTGGGGGGGAGAATCTGGGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAACCGGCACCATTAATTTATAGCCGCGCTTTGGTACAGTAGCGa < 1:67569‑M2/244‑1 (MQ=255) | CTCGGTTCATCAATGTTGTAGTTGATTTTGTCATGCACCATAAAGGTGGAGAAGGTGTTAAGTGATGTCGCCACCAAATCACCCACGCCTATCGCGTAAGAGAGCTGATACGGGGAACTCCAGCTGTTACAACTTTTATTTACCATATTAATGTCAATATCGCGTGGATTGAGCAAAATACGCGATTTGCTCATAGGAAGACGTGTATCAAGACTTGAAAACGCTACCAGTGCTACACAGATACCTAACGACAACAGGAAAAAAAACCATACCCAAAAGGTAGTGAATCGTTTGCTTTTAACTGGGGATTGTTCAGGTGGCGTT‑GCGGTGTTTTGAATGTTAAGACTGTGGGAGGGAGAATCTGTGGCAGGAACCGCCTCTGGTATAGGGGGAGGCGAAGATAGCATTATTTCCTCTCCCTCTTCTTCGCTGTACCAGATAACCGGCACCATTAATTTATAGCCGCGCTTTGGTACAGTAGCGA > NC_000913/4361183‑4361666 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |