| Read alignment evidence... | |||||||||||
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ccACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCC‑GTTGCTGCCGGGGATAGGTGG‑ACCGGGGGGCT‑GAGCGGAATTATTCTGCTCAATA‑CGGAAGA‑TGGCTAACGTGGGGGTCAAGCGG‑CTATTCATCC‑AGTCCGATTTCAGA‑CCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGGGATTGGAGCCAGATA‑TTTGCCTGAACTGTCACGATCATTTTTCGGGTGGGAAATTGA‑GGTGTAACTGGCGTAGGGCGGCCAGTTGTCATTGAtt > 1:195511/1‑250 (MQ=255) aCCGCTTTATAGGCGGTTTCGCC‑GTTGCTGCCGGGGATAGGTGT‑ACCGGTGGACT‑GAGCGACATTATCCTGCTCAATA‑CGGAAGA‑TGGCTAACGTGGTGGTCAGGCGG‑CTATTCATCC‑AGTCCGATTTCAGA‑CCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGATA‑TTTGCCTGAACGGTCACGATCATTTTGCGGCTGGAAAATAGA‑GGTGTAGCTGGCGTATGTCGACCAGTTGTCATTGATGTc < 2:157547/251‑1 (MQ=255) aCCGCTTTATAGGCGGTTTCGCC‑GTTGCTGCCGGGGATAGGTGT‑ACCGGTGGACT‑GAGCGACATTATCCTGCTCAATA‑CGGAAGA‑TGGCTAACGTGGTGGTCAGACGG‑CTATTCATCC‑AGTCCGATTTCAGA‑CCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGATA‑TTTGCCTGAACTGTCACGATCATTTTGCGGCTGGAAAATAGA‑GGTATAGCTGGCGTAGGTCGACCAGTTGTCATTGATGTc < 1:219627/251‑1 (MQ=255) 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tataGGCGGTTTCGCC‑GTTGCTGCCGGGGATAGGTGT‑ACCGGTGGACT‑GAGCGACATTATCCTGCTCAATA‑CGGAAGA‑TGGCTAACGTGGTGGTCAGACGG‑CTATTCATCC‑AGTCCGATTTCAGA‑CCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGATA‑TTTGCCTGATCTGTCACGATCATTTTGCGGCTGGAAAATAGA‑GGTATAGCTGGCGTAGGTCGACCAGTTGTCATTGATGTCa < 1:560299/245‑1 (MQ=255) cGCC‑GTTGCTGCCGGGGATAGGTGT‑ACCGGTGGACT‑GAGCGACATTATCCTGCTCAATA‑CGGAAGA‑TGGCTAACGTGGTGGTCAGACGG‑CTATTCATCC‑AGTCCGATTTCAGA‑CCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGATA‑TTTGCCTGAACTGTCACGATCATTTTGCGGCTGGAAAATAGA‑GGTATAGCTGGCGTAGGTCGACCAGTTGTCATTGATGTCAAACACCAGACCAGCGTaa < 1:548999/251‑1 (MQ=255) gCC‑GTTGCTGCCGGGGATAGGTGT‑ACCGGTGGACT‑GAGCGACATTATCCTGCTCAATA‑CGGAAGA‑TGGCTAACGTGGTGGTCAGACGG‑CTATTCATCC‑AGTCCGATTTCAGA‑CCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGATA‑TTTGCCTGAACTGTCACGATCATTTTGCGGCTGGAAAATAGG‑GGTATAGCTGGCGTAGGTCGACCAGTTGTCATTGATGTCAAACAACAGACCAGCGTa > 2:423262/1‑249 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |