| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,498,768 | 9486 bp→CCC | [pyrS]–fryB | [pyrS], pyrR, ypdC, fryA, ypdE, ypdF, fryC, fryB | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2498768 | 2508253 | 9486 | 48 [0] | [0] 47 | [pyrS]–fryB | [pyrS],pyrR,ypdC,fryA,ypdE,ypdF,fryC,fryB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2498767 | 0 (0.000) | 46 (0.760) +CCC |
44/486 | 0.1 | 100% | coding (97/1698 nt) | pyrS | sensor histidine kinase PyrS |
| ? | NC_000913 | 2508254 = | 0 (0.000) | intergenic (‑12/+207) | fryB/glk | putative PTS enzyme IIB component FryB/glucokinase | |||||
AACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATC‑AGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGAACTGTTGCACAAGTCGGCGCACTCCCCAAAAGAATTGCTCGCCGTTACCGCCATTTTCTCGCTGTTCGCCCTGTTCAGCACCTGGTCCGGCGTTCCCGTAGAAGGCTCGCTGGTGAACGTACGTATTATCGCGGTGATGTCCGGCGGGATTCTGTTTGGCCCGTGGGTAGGCATCATTACCGGCGTGATTGCGGGTATTCACCGGTATTTAATTGATATCGGCGGCGTGACGGCGATCCCCTGCT > NC_000913/2498518‑2499013 | aaCCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATC‑AGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCACCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTcgcg < 2:157806/250‑1 (MQ=255) aGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATC‑AGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttc > 1:368516‑M1/1‑243 (MQ=255) aGTGCATTATCAAGAGATGAATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATC‑AGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATATGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCATGTTTCGCGccccggtt > 1:368966‑M1/1‑243 (MQ=255) gagaTGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTTGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATC‑AGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagggatagttgac < 2:118423‑M1/251‑22 (MQ=255) 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ttAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATC‑AGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttccgtgatagttgacgggtgaaattatgaacgggcaaaacaaatcgccgttccccg > 2:97111‑M1/1‑189 (MQ=255) gTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATC‑AGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgc > 1:339881‑M1/1‑178 (MQ=255) ttcaccaaaaaCGGCCTGCTGGTATTC‑AGCCTTCAGTTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatt < 2:255670‑M1/245‑77 (MQ=255) ttCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATC‑AGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcattt > 1:169008‑M1/1‑174 (MQ=255) aaaaCGGCCTGCTGGTCATC‑AGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggag < 1:356389‑M1/251‑85 (MQ=255) aaaCGGCCTGCTGGTCATC‑AGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGGCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTTTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgagcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttaatgggg > 1:240764‑M1/1‑166 (MQ=255) gctgGTCATC‑AGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCCCCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggagaattaatc < 1:362164‑M1/249‑93 (MQ=255) gctgGCCATC‑AGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCCGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCCTCCGTATCCGCCTGTTTTCCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaatttttaacgtgcaaacccactcgccgttaccagtcaaataatgcatttactgggaaattaatccc > 2:300669‑M1/1‑157 (MQ=255) catc‑aGCCTTTATGTTCCCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCCCCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggagaattaatcccgctgta < 2:257331‑M1/251‑101 (MQ=255) catc‑aGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCCCGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTCCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttattggagaattaatcccgctgta < 2:368516‑M1/251‑101 (MQ=255) catc‑aGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggagaattaatcccgctgt > 1:486136‑M1/1‑151 (MQ=255) atc‑aGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggagaattaatcccgctgtac > 1:316783‑M1/1‑150 (MQ=255) c‑aGCCTCCAGGTTTCCATTCATAGAGGTTTAACCCTTATGCAGAGCCCCCCGTGCACGAAATTTTCAACATGCTGTGGGCGGTCTTCGACCGGGCAGCTTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTACCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggagaattaatcccgctgtacg < 2:436137‑M1/250‑103 (MQ=255) aGCCTTAAGGTTACCTATCATAGAGGATTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGACTGTTCTTTCTCATACGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggagaattaatcccgctgtacgg > 1:37327‑M1/1‑147 (MQ=255) ggTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggagaattaatcccgctgtacggaagtgggac > 1:273967‑M1/1‑139 (MQ=255) tAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttacccgacaaataatgcatttactggagaattaatcccgctgtacggaagtgtgacgcaggtcgaccttgtgaggg > 2:111325‑M1/1‑119 (MQ=255) ccTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggagaattaatcccgctgtacggaagtgtgacgcaggtcgaccttgtgaggggaca < 1:65976‑M1/251‑137 (MQ=255) tATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggagaattaatcccgctgtacggaagtgtgacgcaggtcgcccttgtgaggggaccca > 2:88022‑M1/1‑112 (MQ=255) tATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggagaattaatcccgctgtacggaagtgtgacgcaggtcgaccttgtgaggggacaca < 1:458010‑M1/250‑139 (MQ=255) gagTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCGGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggagaattaatcccgctgtacggaagtgtgacgcaggtcgaccttgtgaggggacacaaagaaaa < 2:107990‑M1/251‑146 (MQ=255) cACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCCGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgggtgaaattatgaacctgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcctttactggagaaataatcccgctgtacggacgggtgacgcaggtagaccttgtggaggggcccacagacaaatt > 2:266571‑M1/1‑102 (MQ=255) aCCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTTTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttggcgggtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagccaaataatgcatttactggagaattaataccgctgtacggcagtgtgacgcaggtcgaccttgtgaggggaaacaaagaaaaattg > 2:176907‑M1/1‑101 (MQ=255) gCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggagaattaatcccgctgtacggaagtgtgacgcaggtcgaccttgtgaggggacacaaagaaaaattgaataaa > 1:191244‑M1/1‑95 (MQ=255) atTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatgcatttactggagaattaatcccgctgtacggaagtgtgacgcaggtcgaccttgtgaggggacacaaagaaaaattgaataaactgtatgatt < 1:433677‑M1/251‑166 (MQ=255) 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cgcgccccgttcagtgatagttgacgagtgaaattatgaacgtgcaaaacaaatcgccgttaccagacaaataatggatttactggagaattaatcccgctgtacggaagtgtgacgcaggtcgaccttgtgaggggacacaaagaaaaattgaataaactgtatgatttaaaagattatcgggagagttacctcccgatataaaaggaaggatttacagaatgtgacctatggtctggcgtaaatgtgc < 2:410025‑M1/250‑247 (MQ=255) | AACCAGAAGTGCATTATCAAGAGATGCATTGCTAATACACCATTTATCTATCAATCCCCTTTTAAAATTGTGGTTTTTCCTCAAAAACGGCCTGCTGGTCATC‑AGCCTTCAGGTTACCTATCATAGAGGTTTAATCCTTATTCAGAGTCACCCGTGCACGAAATATTCAACATGCTGCTGGCGGTCTTCGATCGGGCAGCGTTAATGCTTATCTGCCTGTTCTTTCTCATCCGTATCCGCCTGTTTCGCGAACTGTTGCACAAGTCGGCGCACTCCCCAAAAGAATTGCTCGCCGTTACCGCCATTTTCTCGCTGTTCGCCCTGTTCAGCACCTGGTCCGGCGTTCCCGTAGAAGGCTCGCTGGTGAACGTACGTATTATCGCGGTGATGTCCGGCGGGATTCTGTTTGGCCCGTGGGTAGGCATCATTACCGGCGTGATTGCGGGTATTCACCGGTATTTAATTGATATCGGCGGCGTGACGGCGATCCCCTGCT > NC_000913/2498518‑2499013 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |