| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,410,081 | 13624 bp→ATGC | yjfI–[ulaF] | 18 genes yjfI, yjfJ, yjfK, yjfL, yjfM, yjfC, aidB, yjfN, bsmA, yjfP, ulaR, ulaG, ulaA, ulaB, ulaC, ulaD, ulaE, [ulaF] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4410081 | 4423704 | 13624 | 65 [0] | [0] 70 | yjfI–[ulaF] | yjfI,yjfJ,yjfK,yjfL,yjfM,yjfC,aidB,yjfN,bsmA,yjfP,ulaR,ulaG,ulaA,ulaB,ulaC,ulaD,ulaE,[ulaF] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4410080 | 0 (0.000) | 65 (1.080) +ATGC |
57/484 | 0.0 | 100% | intergenic (+74/‑53) | rlmB/yjfI | 23S rRNA 2'‑O‑ribose G2251 methyltransferase/DUF2170 domain‑containing protein YjfI |
| ? | NC_000913 | 4423705 = | 0 (0.000) | coding (6/687 nt) | ulaF | L‑ribulose‑5‑phosphate 4‑epimerase UlaF | |||||
TCGGGCATATCGTCGCGGTACATGTGAAAGACACCAAACCTGGCGTCTTCAAAAACGTGCCGTTTGGCGAAGGTGTAGTGGATTTCGAACGTTGTTTCGAAACGCTCAAACAGAGTGGCTATTGCGGGCCGTACCTGATTGAGATGTGGAGCGAAACGGCGGAAGACCCGGCGGCAGAAGTGGCGAAAGCGCGTGATTGGGTGAAAGCGCGCATGGCGAAAGCGGGCATGGTGGAGGCGGCATAATGCAAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATAT‑GAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAACTCTACCGTCGTTACC > NC_000913/4423456‑4423955 | accggacgcctggcgctggtgatgggtgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcaa < 1:372122‑M2/2‑1 (MQ=255)accggacgcctggcgctggtgatgggtgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgca > 1:105030‑M2/250‑250 (MQ=255)accggacgcctggcgctggtgatgggtgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtgtcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcaa < 2:133583‑M2/2‑1 (MQ=255) gcctggcgctggtgatgggtgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgcccggcatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagacttatgtaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAACGCTaa > 2:198943‑M2/243‑250 (MQ=255) gtgatgggtgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTAt < 1:437518‑M2/20‑1 (MQ=255) tgcggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGcc > 1:468673‑M2/224‑251 (MQ=255) ggaaggtgaaggtatgcgtcgcctgactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAAc < 2:328127‑M2/31‑1 (MQ=255) gactcgtgaacattgcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCt < 2:405941‑M2/54‑1 (MQ=255) gaacatttcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttagttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggagggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaattcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTTAAGCCAACATGGAGCTTCCGCGCTACGGGCTGGTGAcc < 1:352351‑M2/61‑1 (MQ=255) gcgatgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagatacttacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTg > 2:14611‑M2/183‑251 (MQ=255) ctgagttgatcagcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaagttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgcaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAACTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACTTTTACCTgggg > 2:91527‑M2/180‑251 (MQ=255) agcatcccgatggctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAgcg > 1:372771‑M2/169‑251 (MQ=255) atcccgatgtctggaagcgtttcttccctgaacgtttcggttgcgaccggaatttgcttatttgaagcggtgcgccagcgcagctaatttctcagaattatgaaaagccatccagatttggatggtttttttttgtctatagctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCCGCGCt > 2:438229‑M2/166‑250 (MQ=255) 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ctggtaagataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATAT‑GAGCGGCCAGGTGGGGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGc > 2:253442‑M2/24‑250 (MQ=255) tggtaagataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATAAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGCTATGGTGGTGGTTGATCT‑GAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACCGCGCCGCAt > 2:321438‑M2/23‑251 (MQ=255) ggtaagataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATAT‑GAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCAtc > 1:51955‑M2/22‑251 (MQ=255) 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ataattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGCTATGGTGGTGGTTGATAT‑GAGCGGCTAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAAc > 1:480590‑M2/16‑251 (MQ=255) aaattacgtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATAT‑GAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAAct < 1:216523‑M2/237‑1 (MQ=255) gtaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTAAGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGCGGTTGATAT‑GAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACCGCGCCCCATCTCGAACTCTGCcgt > 2:303408‑M2/8‑251 (MQ=255) gaatgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATAT‑GAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAACTCTACcgtc < 1:79002‑M2/245‑1 (MQ=255) atgcAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATAT‑GAGCGGCAAGGGGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAACTCTACcgtcgt > 1:436295‑M2/5‑251 (MQ=255) cAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATAT‑GAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCtt < 2:86044‑M2/212‑1 (MQ=255) cAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATAT‑GAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCtt > 1:86044‑M2/2‑213 (MQ=255) aaaGCTAAAACCGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGCCCTTTACCTAGGTCAACGACAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGCTCTAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGAGGCGGTTGATATTGAG‑GGCACGGTGGGGGGAGGGGAGGATCGCCCGTCTTCCGACACAGCGGCGCATCTCGCACTCGACcgtcgtaccc > 2:470732/1‑247 (MQ=255) aaaGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATAT‑GAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAACTCTACCGTCGTTAcc > 1:463029/1‑251 (MQ=255) | TCGGGCATATCGTCGCGGTACATGTGAAAGACACCAAACCTGGCGTCTTCAAAAACGTGCCGTTTGGCGAAGGTGTAGTGGATTTCGAACGTTGTTTCGAAACGCTCAAACAGAGTGGCTATTGCGGGCCGTACCTGATTGAGATGTGGAGCGAAACGGCGGAAGACCCGGCGGCAGAAGTGGCGAAAGCGCGTGATTGGGTGAAAGCGCGCATGGCGAAAGCGGGCATGGTGGAGGCGGCATAATGCAAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGAACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATAT‑GAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAACTCTACCGTCGTTACC > NC_000913/4423456‑4423955 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |