| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,411,645 | 9722 bp→A | yhdJ–[yhdY] | yhdJ, yhdU, envR, acrE, acrF, yhdV, yhdX, [yhdY] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3411645 | 3421366 | 9722 | 39 [0] | [0] 39 | yhdJ–[yhdY] | yhdJ,yhdU,envR,acrE,acrF,yhdV,yhdX,[yhdY] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3411644 | 0 (0.000) | 39 (0.640) +A |
38/490 | 0.3 | 100% | intergenic (+77/‑9) | fis/yhdJ | DNA‑binding transcriptional dual regulator Fis/DNA adenine methyltransferase |
| ? | NC_000913 | 3421367 = | 0 (0.000) | coding (43/1104 nt) | yhdY | putative ABC transporter membrane subunit YhdY | |||||
TCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATCGCGATCGTTGAACGCTAAGGAGTCATGATGACAAAAGTATTGCTGTCTCATCCCCCGCGCCCGGCGAGCCATAACTCAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCTTTACCCACACGACCAAC > NC_000913/3421122‑3421613 | gtcaggatgtgaatgacctctatgagctggtactggctgaagtagaacagcccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAAc > 1:436858‑M2/246‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |