| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,417,058 | Δ10,734 bp | yfcC–[argT] | yfcC, yfcD, yfcE, yfcF, yfcG, folX, yfcH, rpnB, hisP, hisM, hisQ, hisJ, [argT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2417058 | 2427791 | 10734 | 55 [0] | [0] 55 | yfcC–[argT] | yfcC,yfcD,yfcE,yfcF,yfcG,folX,yfcH,rpnB,hisP,hisM,hisQ,hisJ,[argT] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2417057 | 0 (0.000) | 55 (0.900) | 51/490 | 0.1 | 100% | intergenic (+166/‑24) | pta/yfcC | phosphate acetyltransferase/putative transporter YfcC |
| ? | NC_000913 | 2427792 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+265) | argT/ubiX | lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic binding protein/flavin prenyltransferase | |||||
CTTTCAGTGAGGGGATCAGCGCGTCAAAGTCACTGGCAACCCAGGTACATTTCACCTGCATCCGTTTGCACATCTCGTTACCGAGATCGATATCAAAGCCAACAAAATCACCTTTAGCATCTTTCGATGAGAACGGTGCGTAGGTGGTATCGGTTCCGATACGTACCGTCTCCGGTAGCGCCGCATAGCTGGAAGCCGCTGTGGAGAGACCGACTAACAAAGACAGAGCGAGAATCGACTTCTTCATACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCGAGGATTTGATCGCGGTTGCAAAATTGCCCTG > NC_000913/2427545‑2428037 | gacctgtcccgtggcgcactggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACAt < 1:354129‑M2/4‑1 (MQ=255) gtggcgcactggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAg < 1:69735‑M2/14‑1 (MQ=255) ggcgcactggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTg < 1:244712‑M2/16‑1 (MQ=255) cgcactggttgacgatatcgtctacaccatcncgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGaa < 2:245127‑M2/18‑1 (MQ=255) 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atcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTAtgt > 1:141741‑M2/218‑251 (MQ=255) catcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTAttgtg > 1:435016‑M2/207‑251 (MQ=255) ccgcgctgcctgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcaacatccgcagctttgcgctgcggatatcttaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTAttgtgtt < 2:341860‑M2/47‑1 (MQ=255) cgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCACGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTAttgtgttgtg > 2:435478‑M2/202‑251 (MQ=255) gctcagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgctctgctgatatctgaaccggaaataatcactattgccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgcggcatcaatgaattgcgccatctcactttgcattcttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCGTTCAt < 2:390560‑M2/69‑1 (MQ=255) acagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGc > 1:367529‑M2/180‑250 (MQ=255) 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acttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTTCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTg > 1:288399‑M2/16‑209 (MQ=255) acttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTTCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTg < 2:288399‑M2/194‑1 (MQ=255) ttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGAATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCGAGGATTTGATCGCGGTTGCAAAATTGCCCTg > 1:344346‑M2/6‑251 (MQ=255) gttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAg > 1:197817‑M2/4‑205 (MQ=255) gttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAg < 2:197817‑M2/202‑1 (MQ=255) | CTTTCAGTGAGGGGATCAGCGCGTCAAAGTCACTGGCAACCCAGGTACATTTCACCTGCATCCGTTTGCACATCTCGTTACCGAGATCGATATCAAAGCCAACAAAATCACCTTTAGCATCTTTCGATGAGAACGGTGCGTAGGTGGTATCGGTTCCGATACGTACCGTCTCCGGTAGCGCCGCATAGCTGGAAGCCGCTGTGGAGAGACCGACTAACAAAGACAGAGCGAGAATCGACTTCTTCATACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCGAGGATTTGATCGCGGTTGCAAAATTGCCCTG > NC_000913/2427545‑2428037 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |