| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,105,376 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+83/‑34) | csgC → / → ymdA | curlin chaperone/uncharacterized protein YmdA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1105380 | 0 (0.000) | 44 (0.720) | 40/492 | 0.2 | 100% | intergenic (+87/‑34) | csgC/ymdA | curlin chaperone/uncharacterized protein YmdA |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
GAAGCAAGAAAAGACCCTTTCATTGCCTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATGGCCAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCAGCACCCAGTCATCACCCGTAGAAATGAACTGCCCACAGAATGGTTCTATTCCGGGCAAAACCTACTCCAGCAAAG > NC_000913/1105128‑1105621 | attgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAc < 1:62472‑M2/2‑1 (MQ=255) gcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTc > 2:361482‑M2/246‑251 (MQ=255) tacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgcacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCa > 1:209475‑M2/243‑249 (MQ=255) gccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGAt > 1:294415‑M2/240‑251 (MQ=255) 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gCCTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCCGGCCGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttcc > 2:488508‑M1/1‑229 (MQ=255) ctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcctccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatattttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctacggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaacctagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCCGTGAGGa > 2:466441‑M2/223‑250 (MQ=255) ggctgctacaccatggtgcagggcaacgagggagaccgtcataccagattcaaagacatgatgaaaaaatgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgagtttctccgtccctaaaacatcaataatctgttctccaatgactagtctaaaaactaggattaagactatcacttatttaagggatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAggaatt > 1:400869‑M2/221‑249 (MQ=255) 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atccccggttcaaagctctgctgaacaatttctatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccctccctaagacatcaaccatctgttctccaatgactagtctaaaatctagtattaagactatcacttatttaagggatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGGTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTc < 1:83400‑M2/71‑1 (MQ=255) tcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAgtttg > 2:100301‑M2/172‑251 (MQ=255) gATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAATAATGGCCGCTCTCTTTAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttacagacatctgttatcacttaactcattccaagcccgctgccgcagatattaccgtgg > 2:109611‑M1/1‑174 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |