| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,101,395 | Δ11,672 bp | wbbL–rfbB | wbbL, insH7, wbbL, wbbK, wbbJ, wbbI, wbbH, glf, rfbX, rfbC, rfbA, rfbD, rfbB | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2101395 | 2113066 | 11672 | 53 [0] | [0] 52 | wbbL–rfbB | wbbL,insH7,wbbL,wbbK,wbbJ,wbbI,wbbH,glf,rfbX,rfbC,rfbA,rfbD,rfbB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2101394 | 0 (0.000) | 52 (0.850) | 47/488 | 0.1 | 100% | intergenic (‑126/+2) | gnd/wbbL | 6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating/interrupted rhamnosyltransferase WbbL |
| ? | NC_000913 | 2113067 = | 0 (0.000) | intergenic (‑6/+367) | rfbB/galF | dTDP‑glucose 4,6‑dehydratase 1/UTP:glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase, low activity | |||||
ACTTCTTCCGTCTTCTCACGGGAACGGTTGAAAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATATTACGGGTGAAAAACTGATGAAATTCGATCAAAGTTGCGATTTGATAAAATACGTTTTCTGGCTAAATATCTAAAAGTACTTTTTAAGTGCCATCTGAAGGCTTTTGAAAAAAAACTTCGATTGTCATGATGAGCATAATGTATCGCATGAAAAGCGGGAACATAATGAAGTCTGACACCAGCCAGGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAA > NC_000913/2101144‑2101622 | aCTTCTTCCGTCTTCTCACGGGAACGGTTGAAAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCACATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTtat > 2:49995/1‑251 (MQ=255) tcCGTCTTCTCACGGGAACGGTTGAAAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttatt < 1:427951‑M1/250‑6 (MQ=255) ccGTCTTCTCACGGGAACGGTTGAAACTAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAACGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattcc > 1:425569‑M1/1‑244 (MQ=255) cACGGGAACGGTTGAAAAGAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatatta < 1:190270‑M1/248‑14 (MQ=255) ggAACGGTTGAAAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttc > 2:310186‑M1/1‑231 (MQ=255) ggTTGAAAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatg < 1:44496‑M1/251‑26 (MQ=255) aaaTAGAGACGGTATAACCACGGCTTACGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGAATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtg > 1:45108‑M1/1‑220 (MQ=255) agaCGGTATAACCACGGCTTTCGATGGTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattcatattacttcagagcatgctgtgaaataagc < 2:421188‑M1/251‑38 (MQ=255) aCGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGGCTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagttt > 1:271893‑M1/1‑201 (MQ=255) gATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTCCATACTCCTGTCAGGAGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGACTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaat > 2:406044‑M1/1‑192 (MQ=255) ttGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggt > 2:70554‑M1/1‑188 (MQ=255) gcAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaat < 1:82537‑M1/251‑70 (MQ=255) gTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctacc > 1:4220‑M1/1‑172 (MQ=255) attacGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCATGTCAGGTGTGCTCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctaagtttgattaatagagatattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctac > 2:133506‑M1/3‑152 (MQ=255) aCGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATCCTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccag < 1:19783‑M1/251‑103 (MQ=255) gTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTTTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactg < 1:35154‑M1/248‑110 (MQ=255) gCTTGGACATTACATACTCCTGTCAAGTGTGNTCACCGCGTTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAATTAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATATCTTATCCAGGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcgcctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgct < 2:240880‑M1/251‑116 (MQ=255) ggccattACATACTCCTGTAAGGTTGGAGCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgcttcctcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcc < 2:275430‑M1/248‑120 (MQ=255) tACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatga < 1:348079‑M1/250‑125 (MQ=255) gTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTACCCATGTTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctcgcagtttgattaatagaggtattaatgcacgcgaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagc < 2:425569‑M1/249‑135 (MQ=255) ccaCCGCGCTGAACGATCGTGGCCTGGAATGTACGCAAATAATTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAAGAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagagggattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgtgacccacgcgc < 2:295465‑M1/250‑148 (MQ=255) cccgCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAATTACTTATTAAAGTTTAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgc < 1:229015‑M1/250‑150 (MQ=255) tGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaaccc > 1:333022‑M1/1‑95 (MQ=255) tGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaaccc > 2:273845‑M1/1‑95 (MQ=255) ggCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattca > 2:72583‑M1/1‑84 (MQ=255) tGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgc > 1:352440‑M1/1‑80 (MQ=255) ggAATGTTCGCAAATAATTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTTTATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgc < 1:400360‑M1/250‑172 (MQ=255) gAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgct > 2:174480‑M1/1‑78 (MQ=255) ttCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattactagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgt > 2:354146‑M1/1‑73 (MQ=255) ttCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctgtctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaccccgaaaacttcaaacgctaattgt > 1:106823‑M1/1‑73 (MQ=255) cGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtc < 1:384037‑M1/250‑180 (MQ=255) gCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtctt > 2:127345‑M1/1‑70 (MQ=255) agaagtATACACAGTTCTTATTAACGTATAAATATCTTTTCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaactaagcgtctctcagtttgctgactagaggtattaatgcacgctaccgcccctggcttttcagctacccgagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagctttacccacgcgcgctaaacccgaaaaattcaaactctaattgtcttacca < 2:171549‑M1/249‑186 (MQ=255) aTAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccacttgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtcttacc > 2:10188‑M1/1‑66 (MQ=255) aTAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtcttacc > 1:83510‑M1/1‑66 (MQ=255) ataCAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtcttaccaatccgc > 2:482408‑M1/1‑60 (MQ=255) taCAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctcattgtcttaccaatccgcc > 1:450468‑M1/1‑59 (MQ=255) aCAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaatt < 1:49997‑M1/222‑165 (MQ=255) aCAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaatt > 2:49997‑M1/1‑58 (MQ=255) aCTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtcttaccaatccgctctggaaac > 1:196927‑M1/1‑51 (MQ=255) tattaAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattatttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtcttaccaatccgctctggaaaca > 1:431153‑M1/1‑48 (MQ=255) attaAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGATTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaacttcaaacgctnattgtcttaccaatccgctctggaaacaagg > 2:222978‑M1/1‑47 (MQ=255) ataAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtcttaccaatccgctctggaaacaaggaaaatcct > 2:393360‑M1/1‑39 (MQ=255) aTAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtcttaccaatccgctctggaaacaaggaaaatcctggaa < 1:70554‑M1/251‑217 (MQ=255) cTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattaattcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtcttaccaatccgctctggaaacaaggaaaatcctggaaaact > 1:414828‑M1/1‑31 (MQ=255) tATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtcttaccaatccgctctggaaacaaggaaaatcctggaaaactt < 1:49995‑M1/250‑222 (MQ=255) aTCCATGCTTATATGCTTGCGGCTTTAAttattccatcttacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagttagattaatagagatattaatgcaagctaccacccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatggtgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattccaacgctcattgtcttaccaatccactctggaaacaaggaaactcctggaaaaatttg > 2:410270‑M1/1‑28 (MQ=255) tCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccttattccttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcattttgattaatagaggtattaatgctcgctaccgcccctggatttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtcttaccaatccgctctggaaacaaggaaaatcctggaaaactttg < 1:56845‑M1/250‑224 (MQ=255) aTGCTTATATGCTTACGGCTTTATttattccatattacttcagaacatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtcttaccaatccgctcatgaaacaaggaaaatcctggaaaactttgaat > 2:24684‑M1/1‑24 (MQ=255) tACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtcttaccaatccgctctggaaacaaggaaaatcctggaaaactttgaataa < 1:347381‑M1/239‑229 (MQ=255) tACGGCTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgacgagcgttacccactcgcgctaaacccgaaaaattcaaacgctaattgtcttaccaatccgctctggaaacaaggaaaatcctggaaaactttgaataa > 2:347381‑M1/1‑11 (MQ=255) cTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgac < 2:346771‑M1/136‑131 (MQ=255) cTTTATttattccatattacttcagagcatgctgtgaaataagcggctctcagtttgattaatagaggtattaatgcacgctaccgcccctggctttacagctaccagagcactgcgtgcatgcctatgatgtgac > 1:346771‑M1/1‑6 (MQ=255) | ACTTCTTCCGTCTTCTCACGGGAACGGTTGAAAATAGAGACGGTATAACCACGGCTTTCGATGTTGAGCGCAAGGTTGCGTCCCATCACTGCCATACCGACTACGCCGATCTGTTGCTTGGACATTACATACTCCTGTCAGGTGTGATCACCGCGCTGAATGCTCGCGGCCTGGAATGTTCGCAAATAAGTATACAAAGTACTTATTAAAGTATAAATAGCTTATCCATGCTTATATGCTTACGGCTTTATATTACGGGTGAAAAACTGATGAAATTCGATCAAAGTTGCGATTTGATAAAATACGTTTTCTGGCTAAATATCTAAAAGTACTTTTTAAGTGCCATCTGAAGGCTTTTGAAAAAAAACTTCGATTGTCATGATGAGCATAATGTATCGCATGAAAAGCGGGAACATAATGAAGTCTGACACCAGCCAGGCTAAGCCTCAAGCACAGGTCAATATCTTCACAGTACATAA > NC_000913/2101144‑2101622 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |