| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,228,275 | 0 | T | C | 39.2% | 64.8 / 14.2 | 51 | intergenic (‑1005/‑707) | yohF/yohP | putative oxidoreductase YohF/putative membrane protein YohP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (18/13); new base C (8/12); total (26/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.58e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCCGGGTTTTGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTCAGCCACCTGCAT > NC_000913/2228027‑2228519 | gcCGGGTTTTGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑Tcc < 1:602208/251‑1 (MQ=255)gcCGGGTTTTGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑Tc < 1:230131/250‑1 (MQ=255)gcCGGGTTTTGCTGGCATGAATATCGGTTTCCACACTTTCAACGGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAAGGGTGTTCTGCTCTTTTGCGATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑Tcc < 2:100720/251‑1 (MQ=255) gggTTTTGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACCCCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGTTCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGcc < 2:19436/251‑1 (MQ=255) tGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGAtt < 1:166850/250‑1 (MQ=255) gCTGGCAGTAATATCGGTGTCCACACCTTCAACTGAAGAATTAATCCCGTTCTGATATAGGTGGCGATCGGGCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTGGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACGCCCAGTTCAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑c < 2:240058/250‑1 (MQ=255) ggCATTAATATCGGTTTCCAAACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGATACGCTGCCCGCCAGACATTAGCGGGGTTGCCCCCGGTT‑CCGCCCCCCG‑‑GC‑TTTTAA‑CC‑TAACCAGG‑CGGGCAA‑GAA‑CC‑TCCCCCCCACT‑Ctttt > 1:222125/1‑250 (MQ=255) aTTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTcccc < 1:662616/251‑1 (MQ=255) atCGGTTTCCACTCCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGatat < 1:662511/251‑1 (MQ=255) gtccaaacttccagcTGAACAAGTAATCCCGTTCTGAATTATCTGGCGGTCGGTCGCTATAATGGTGTTCTGCGCTGTTTCTATTTGCTTCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGTTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑Cgata < 2:498002/236‑3 (MQ=255) cccTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGc < 2:230977/250‑1 (MQ=255) acCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCCGCCAGCAATTGGCGGGGTTGGTCGCG‑TT‑TCGCCGCCCC‑CGC‑TTT‑AAACCG‑ACCCAGG‑CGGGGAG‑GAA‑AC‑TCCCCCCGATT‑TTTTCCCC‑CGATAT‑CTCGATGcccac > 1:205868/1‑248 (MQ=255) aaCTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTTCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑CGC‑TTTTAA‑CC‑TACCCCGG‑CGGGGAG‑GAA‑CC‑CCCGCCCCATT‑CTTTTCCC‑CGATAT‑Cgaggttcccaccccccc > 1:595540/1‑237 (MQ=255) cGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTGCTCGCG‑TT‑CCCCCCCCCC‑TGCCTTT‑AA‑C‑GTACCCAAG‑CGGGCAGGAAA‑CC‑CCCCCCCGTTT‑TTTTCCCC‑A‑ATAT‑CCAGAAGCC‑AGCCCCCC‑G‑GTAAACC‑aaaaataacc > 1:668953/1‑245 (MQ=255) tCTGATATTGCTGGCGATCGGTCGCGATAAGGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCGGAAAGACCTTGTTTACCGCCGCCGGGGTTTGCCACCCCCAGTACGGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCCCGCG‑TC‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTCCCCAGG‑GGGGCAG‑TAC‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTCCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑Gtt < 1:375948/250‑1 (MQ=255) ataGCTGGCTATGGGTCGCGATATTGGTTTTCTGTTCTTTTTCTTTTTGCGGCAAGACGGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCCCCCCCAGTACAGGCGGGCTCCGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGTTTTGCGCGCG‑TC‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AC‑CCGTCCCCAGG‑CGGGCAG‑TAC‑CC‑CCCGCCCGATT‑CTTCCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑c < 1:386763/251‑1 (MQ=255) ggCTGGCGATGGGCCGCGATAAGGGTTTTCTGCTCTTTTTCTATTGGCTGCAAGCCCGTGTTTACCCCCGCCGGGTTTTGCCACCCCCAGTACGGGGGGGCTCCGCGGCCAGCCAGAAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TC‑CCGCCCCCCG‑TGC‑TTT‑AC‑CCGTCCCCGGG‑CGGGCAG‑TAC‑CC‑CCCGCCCGATT‑CTTCCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑a < 1:171314/250‑1 (MQ=255) ggCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑TCGCCCCCCC‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCACG‑CGGGGAG‑TAAACC‑CCCCCCCCTTT‑TTTTCCCC‑‑GAAAT‑CCAGATGCCCACCCCCCC‑G‑TTAACCC‑AAAATAACC‑GTTggggaacaccgg > 1:153263/1‑241 (MQ=255) gCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTTCTCGCG‑TT‑TCCCCCCCCG‑TGC‑TTT‑TA‑ACGTAACCCGG‑CGGGGAG‑GAA‑CC‑TCCGCCCGGTT‑CTTTCCCC‑CGAGAT‑CCAGAAGCC‑CGCCCGCC‑G‑TTTAGCCCAAAAGTAC‑‑GTTGGTGTA‑CC‑ACCGGc > 1:113653/1‑251 (MQ=255) gATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTGCTCGCG‑TT‑TCGCCGCCCC‑TGC‑TTTTAA‑CGGT‑CCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑CCCGCCCGCTT‑CTTTTCCC‑CGATATTCG‑GATGGC‑ACCCCGCC‑G‑CTCAACC‑AAAAATACCCGTTG‑TGTAACC‑ACGGGcg > 1:564562/1‑250 (MQ=255) tGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTGCTCGCG‑GT‑CCGCCCCCCC‑TGC‑TTT‑TA‑CCCTACCCCGG‑CGGGCCG‑TAAACC‑CCCCCCCCATT‑‑TTTCCCC‑CCATTT‑CGAGATGCC‑CGCCCCCCCG‑TTAGCCC‑AAAAG‑ACC‑CTTTGGGTA‑CC‑CCCGGCCGGGCGTACCCGC‑GGcc > 1:369343/1‑251 (MQ=255) tATTTGCTGAAAGCCCTTGTTTCACCCCGCGTGGGTTTGCACCTCCCAGTCCGGGCGGGCTACGCTGCCGGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCCCGCT‑TC‑CCGCCCCCCG‑TGT‑TTT‑AA‑CCGT‑CCCAGGGCGGGAAG‑TAC‑CC‑CCCGCCCGATT‑CTTCCCCC‑AAATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAAc < 1:367288/250‑1 (MQ=255) gcAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTTCTCGCG‑GT‑CCGCCGCCCG‑CGC‑TTT‑TA‑CCCTACCCAGG‑CGGGGCG‑GAA‑AC‑TCCCCCCGGTT‑CTTTTCCC‑CGAAAT‑TGAGATGCC‑CGCCCCCC‑GGTTAACCC‑AAAAG‑ACC‑GGTGGGGTA‑AC‑ACGGGGCGGGTGTACCCGC‑GGGCGGGTCGTTCAGAGC‑AAAAGGccccctt > 1:558059/1‑248 (MQ=255) gtgtTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TTTCCCCCCCCCG‑‑GC‑TTT‑AA‑CCCGACCCCGG‑CGGGGCG‑TAA‑AC‑CCCCCCCCCTT‑CTTTCCCC‑CGAAAT‑CGAGATGCC‑CGCCCGCC‑CCTTAA‑CC‑AAAAAGAAC‑GTTGGGGTA‑CCCACGGGCCGGCCGTCCCCGC‑GCCCGG‑TCGTTCAGAGCCAAAGGCCCCCATTAA‑CCCtc > 1:611990/1‑250 (MQ=255) taccccccccggggTTTGCCCCCCCCAGTACAGGCGGGCTCGGCTCCCCGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCCCGCG‑TC‑CCCCCGCCCG‑TGC‑TTA‑CA‑CCTAACCCGGG‑CGGGCAG‑CAA‑CC‑CCCGCCCGTTT‑CTTCCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑ACCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGcc < 2:253756/239‑1 (MQ=255) aaCGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTTCCCGCG‑GT‑CCCCCGCCCGCGGT‑TTT‑AA‑CC‑TACCCCGG‑CGGGCCG‑TAA‑CC‑CCCGCCCCCTT‑CTTTTCCC‑CCAGAA‑CGAGGTGGC‑AGCCCGCC‑G‑TTTAACC‑CAAACAGCC‑GATTGTGGG‑CC‑ACCGGCCGGGCGTACCCTC‑GGCCGGGGCGGTCCGAGC‑AAACGGCCCCCCTTA‑GCCTTCTTCCgc > 1:362390/1‑250 (MQ=255) ccccccccAGTGCAGGCGGGATACGCGGCCGCCCAGCAATTGGGGGTTTTCCTCGCG‑TT‑CCGCCCCCCG‑TTC‑TTT‑AC‑CCTTCCCCGGG‑GGGGAAG‑TAC‑CC‑CCCCCCCGTTT‑CTTCCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGAGCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCa < 1:700026/246‑1 (MQ=255) cTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑GGA‑TTT‑AA‑ACGTACCCAGG‑CGGGAAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑C‑TTCAGAC‑AAAAGTAAC‑GTTGGTGTA‑AC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGGTTAGAGC‑AAACGGCCCCCTTAA‑GCCCTTTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAggcggtc > 1:115320/1‑245 (MQ=255) tACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTGCTCCCG‑TT‑CCGCCGCCCC‑TGC‑CTT‑AA‑CCGCACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTTCCC‑CGATAT‑CGAGGTGCC‑AGCCCGCC‑G‑CTCAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGGGTA‑AC‑ACGGGCCCGGCGGCCCCGCCGGCGGGA‑CGTTCAGGGC‑AAACGGGCCCCTTAACGCCT‑CTGCCGACAATTTTTTCCGACCCCTCTCCGCCGaaaaaccgactt > 2:591494/1‑243 (MQ=255) ccagccagCAATTGGCGGAGTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑ACGTACCCCGG‑CGGGCCG‑GAA‑CC‑CCCGCCCCATT‑CTTTCCCC‑CGCTAT‑CGAGATGCC‑AACCCCCC‑G‑CTAAGCC‑CAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑AC‑ACGGGCCGGGCGTACCTGC‑GGGCGGGACGTTCAGAGC‑AAAAGGCCCCCTTAA‑GCCCTTTGCCGACATTTTTTGGCGCCCCCTATCCCCCGCAAAGTCTATCTGCGGAcc > 2:208318/1‑251 (MQ=255) agccagcATTTGGCGGTTTGGCTCGCG‑TT‑CCCCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AC‑CCGTCCCCGGG‑GGGGCAG‑TAC‑CC‑CCCCCCCGATT‑CTTCCCCA‑AGATAC‑CGAGAGGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCAt < 1:379285/251‑1 (MQ=255) agccagcAATTGGCGGGTTTGCCCGCG‑TT‑CCCCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGGACCTGC‑GGCCGGGACGGTCCGAGC‑AAACGGCCCCCTTAA‑GCCTTCTGCCGACCTTTTTTGCCGCTCCCTATCCGCCGAAAAATCGATCTGCGGACCAt > 1:172964/1‑251 (MQ=255) cGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGCAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCaa > 2:464824/1‑250 (MQ=255) ggttttGCTCCCT‑TT‑CCGCCCCCCG‑TGT‑TTT‑AA‑CCGCACCCAGG‑CGGGCAG‑TAC‑CC‑CCCCCCCGATT‑CTTCCCCC‑AGATAC‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACt < 1:464824/248‑1 (MQ=255) cgcg‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCCCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGcc > 1:459763/1‑251 (MQ=255) ccccccgccCG‑TCC‑TTT‑AC‑CCCTCCCCGGG‑CGGGCAG‑AAC‑CC‑CCCCCCCGATT‑CTTCCCCC‑AGATAG‑CGGGATGCC‑ACCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGc < 1:425461/247‑1 (MQ=255) cgccccCCG‑TGT‑TTA‑AA‑CCGTGCCCAGG‑CGGG‑AA‑TAA‑CCCTCC‑CCCGTTTTCTTTCCCA‑ATATAG‑AGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCtt < 1:550875/251‑1 (MQ=255) cccgccCG‑TGT‑TTT‑AC‑CCTCACCCAGG‑CGGGCAG‑TAC‑CC‑CCCCCCCGTTT‑CTTCCCCC‑AGATAC‑CGAGAGCCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTc < 1:663393/250‑1 (MQ=255) ccccccgg‑TGC‑TTT‑AC‑CCGTCCCCGGG‑CGGGCAG‑TAC‑CC‑CCCGCCCG‑TT‑CTTTCCCCCAGATAT‑CGAGAGGCC‑GGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTc < 1:208318/244‑1 (MQ=255) ccG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGCTT‑CTTTCCCC‑AGGTAT‑CGCGTTGCC‑AAACCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAATACC‑GTTGGAGAA‑CC‑ACGGGCCGGGCGTACCTGC‑GCCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GGCGTCTGCCGGCATTTTTTGCGGCTGCATATCGCCCGAACAGGCGATCTGCCGACCATCCTGAAGGGCAATTGCCTTCGCCTGGGCTTCagctg > 1:689704/1‑250 (MQ=255) cG‑TGC‑TTTCAA‑CCGTCCCGTGG‑CGGACGG‑TAC‑CC‑CCCGCCCGTTT‑CTTCCCCC‑AGATTC‑CGAGAGCCC‑ACCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCagcta < 1:380588/251‑1 (MQ=255) g‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCCTATCCGCCGAAAAGTCGATATGCGGACCATCCTGAGTCGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCagctagc > 2:720149/1‑251 (MQ=255) gC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTg > 1:463120/1‑251 (MQ=255) ttt‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGa > 1:619322/1‑250 (MQ=255) taaa‑CCTTACCCGGG‑GGGGCAG‑AAC‑CC‑CCCGCCCGTTT‑CTTCCCCA‑AGATAT‑GGAGAGGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGaa < 1:45065/248‑1 (MQ=255) a‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATgcg > 2:70819/1‑251 (MQ=255) a‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACCNCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATgcg > 2:345785/1‑251 (MQ=255) cccAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AACCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTTC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTTGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTc > 1:733614/1‑251 (MQ=255) ggCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGGGGCAACTGCCTTCTCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTCAGCCACCt > 2:514587/1‑251 (MQ=255) aG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGACCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑g > 2:479099/1‑130 (MQ=255) acaccc‑TCCGCCTTATT‑CTTCCCCA‑AGATAC‑CGATAGGCC‑GGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTCAGCCACCTGCat < 1:686654/247‑1 (MQ=255) | GCCGGGTTTTGCTGGCATTAATATCGGTTTCCACACCTTCAACTGAAGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCTACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCG‑TT‑CCGCCGCCCG‑TGC‑TTT‑AA‑CCGTACCCAGG‑CGGGCAG‑TAA‑CC‑TCCGCCCGATT‑CTTTCCCC‑AGATAT‑CGAGATGCC‑AGCCCGCC‑G‑TTAAGCC‑AAAAGTACC‑GTTGGTGTA‑CC‑ACGGGCCGGTCGTACCTGC‑GGCCGGATCGTTCAGAGC‑AAACGGCCCCATTAA‑GCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTCAGCCACCTGCAT > NC_000913/2228027‑2228519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |