| Read alignment evidence... | |||||||||||
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GTTTCGAAGATATCAAAGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACC‑ACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACA‑TGCCGAAGTACACGCGTTG‑CGTAT‑GGCGGGTG‑AA‑AAA‑G‑CC‑AAAGGTG‑CGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATC‑ATGGTCG‑TACGCCA‑CCGTGCTGTGACGCACTCA‑TCGCCGCTGGCG‑TAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGAC‑TTTACCG‑TCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAGCGGATGCGCACCGGCTTTCCTT > NC_000913/433399‑433896 | gTTTCGAAGATATCAAAGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACC‑ACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACA‑TGCCGAAGTACACGCGTTG‑CGTAT‑GGCGGGTG‑AA‑AAA‑G‑CC‑AAAGGt < 1:236985/251‑1 (MQ=255) gAAGATATCAAAGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACC‑ACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACA‑TGCCGAAGTACACGCGTTG‑CTTAT‑GGCGTGTG‑AA‑AAA‑G‑CC‑AAAGGTG‑CGAc < 1:611886/251‑1 (MQ=255) aaGATATCAAAGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACC‑ACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACA‑TGCCGAAGTACACGCGTTG‑CGTAT‑GGCGGGGG‑AA‑AAA‑G‑CC‑AAAAGGG‑CGAcc > 1:53004/1‑251 (MQ=255) gATATCAAAGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACC‑ACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACA‑TGCCGAAGTACACGCGTTG‑CGTAT‑GGCGGGTG‑AA‑AAA‑G‑CC‑AAAGGGG‑CGACCGc > 1:183147/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |