| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 641,446 | Δ17,325 bp | [uspG]–crcB | 18 genes [uspG], ybdR, yldA, rnk, rna, citT, citG, citX, citF, citE, citD, citC, dpiB, dpiA, dcuC, pagP, cspE, crcB |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 641446 | 658770 | 17325 | 57 [0] | [0] 58 | [uspG]–crcB | [uspG],ybdR,yldA,rnk,rna,citT,citG,citX,citF,citE,citD,citC,dpiB,dpiA,dcuC,pagP,cspE,crcB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 641445 | 0 (0.000) | 57 (0.580) | 56/492 | 0.3 | 100% | coding (423/429 nt) | uspG | universal stress protein G |
| ? | NC_000913 | 658771 = | 0 (0.000) | intergenic (‑833/‑176) | crcB/tatE | F(‑) channel protein/twin arginine protein translocation system ‑ TatE protein | |||||
TGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCGGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATTATAGATCCCTTTGGCGTCACCATTGCGGCAGCGTCAGAAATGCCTGCACTCATTATGGCGGAAGTGACGCCCGAACGTGTGCGTCAGGTGCGCGCGCAACTGCCCGTCTTAAACAACCGTCGCTTTGCGCCGCCGCAATTATTATGATGTTTTTTTACTCGGCGCTTGATTCACCTTGTTACAGATTGCTATTGTGTGCGCGCGTCGAATGACCGTTAATATTCTCTGGTTTTTAAGGCGCGTTCTGTTGCCGGTTATATGTCAAGAAGGTATCTATGGGTGAGATTAGTATTACCAAACTGCTGGTAGTTGCGGCGCTGGTCGTTCTGCTGTTTGGGACTAAGAAGTT > NC_000913/658521‑659020 | ggcgtgttcgcagcgggtcactgtacgacggttccgtacaagcagatcatcatcgccactggcgaaggtgccaaagcctctctgagtgcttttgactacctgattcgcaccaaaactgcataagaagaagtacgattcacctgcaattgcttagccgccggggtcaaacctggcggcttttttatggcattaaaaagccccgccgggatggctccgggccgggcgggatacttattctggcacttaacgcc > 2:639951‑M2/251‑251 (MQ=255) gtgttcgcagcgggtgactgtacgacgggtccgcacaagcagatcatcatcgccactagcgaaggtgccaaagcctctctgagtgcttttgactacctgattcgcaccaaaactgcataagaagaagtaagattcacctgcaattgattagccgccggggtcaaacctggcggcttttttatggacttaaaacgccccgccgggctggccccgggcagggcgggatacttattctggcaattaacgcCTGc > 2:592844‑M2/248‑251 (MQ=255) gcagcgggtgactgtacgacggttccgtacaagccgatcatcatcgccactggcgaaggtgccaaagcctctctgagtgcttttgactacctgattcgcaccaaaactgcataagaagcagtaagattcacctgcaattgcttagccgccggggtcaaacctggcggcttttttatggcattaaaaagccccgccgggatggctccgggcagggcgggatacttattctggcaattaacgcCTGCCCGTCt > 2:126968‑M2/242‑251 (MQ=255) gcgggtgcctgtacgacggttccgtacaagcagatcatcatcgccacgggcgaaggtgccaaagcctctctgagtgcttttgactacctgattcgcaccaaaactgcataagaagaagtaagattcacctgcaattgcttagccgccggggtcaaacctggctccttttttatggcattaaaaagccccgccgggatggctccgggcagggcgggatacttattctggcaattaacgcCTGCCCGTCTTaa < 1:297473‑M2/13‑1 (MQ=255) 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gacggttccgtacaggcagctcatcatcgccactggcgaaggtcccaaagcctctctgagtgcttttgactacctgattcgcacaaaaacggcataagaagaagtaagtttcacctgcaattgcttagccgccggggtcaaacctggcggcttttttatggcattaaaaggccccgccgggatggctccgggcagggcgggatacttattctggcaagtaacgcCTGCCCGTCTTAAACAACCGTCGCttt < 1:573967‑M2/27‑1 (MQ=255) cggttccgtacaagcagatcatcatcgccactggcgaaggtgccaaagcctctctgagtgcttttgactacctgattcgcaccaaaactgcataagaagaagtaagattcacctgcaattgcttagccgccggggtcaaacctggcggcttttttatggcattaaaaagccccgccgggatggctccgggcagggcgggatacttattctggcaattaacgcCTGCCCGTCTTAAACAACCGTCGCTTTgc < 1:156936‑M2/29‑1 (MQ=255) ggttccgtacaagcagatcatcatcgccactggcgaaggtgccaaagcctctctgagtgcttttgactacctgattcgcaccaaaactgcataagaagaagtaagattcacctgcaattgcttagccgccggggtcaaacctggcggcttttttatggcattaaaaagccccgccgggatggctccgggcagggcgggatacttattctggcaattaacgcCTGCCCGTCTTAAACAACCGTCGCTTTgcg > 1:757437‑M2/222‑251 (MQ=255) 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tattctggcaattaacgcCTGCCCGTCTTAACCCACCGTCGCTTTGCGCCGCCGCAATTATTATGATGTTTTTTTACTCGGCGCTTGATTCACCTTGTTACAGATTGCTATTGTGTGCGCGCGTCGAATGACCGTTAATATTCTCTGGTTTTTAAGGCGCGTTCTGTTGCCGGTTATATGTCAAGAAGGTATCTATGGGTGAGATTAGTATTACCAAACTGCTGGTAGTTGTGGCGCTGGTCGTTctgct < 2:647295‑M2/232‑1 (MQ=255) taacgcCTGCCCGTCTTAAACAACCGTCGCTTTGCGCCGCCGCAATTATTATGATGTTTTTTTACTCGGCGCTTGATTCACCTTGTTACAGATTGCTATTGTGTGCGCGCGTCGAATGACCGTTAATATTCTCTGGTTTTTAAGGCGCGTTCTGTTGCCGGTTATATGTCAAGAAGGTATCTATGGGTGAGATTAGTATTACCAAACTGCTGGTAGTTGCGGCGCTGGTCGTTCTGCTGTTTGGGACTa > 1:619808‑M2/7‑249 (MQ=255) aacgcCTGCCCGTTTTAAACAACCGTCGCTTTGCGCCGCCGCAATTATTATGATGTTTTTTTACTCGGCGCTTGATTCACCTTGTTACAGATTGCTATTGTGTGCGCGCGTCGAATGACCGTTAATATTCGCTGGTTTTTAAGGCGCGTTCTGTTGCCGGTTATATGTCAAGAAGGTATCTATGGGTGAGATTAGTATTACCAAACTGCTGGTAGTTGCGGCGCTg < 2:499947‑M2/221‑1 (MQ=255) aacgcCTGCCCGTCTTAAACAACCGTCGCTTTGCGCCGCCGCAATTATTATGATGTTTTTTTACTCGGCGCTTGATTCACCTTGTTACAGATTGCTATTGTGTGCGCGCGTCGAATGACCGTTAATATTCTCTGGTTTTTAAGGCGCGTTCTGTTGCCGGTTATATGTCAAGAAGGTATCTATGGGTGAGATTAGTATTACCAAACTGCTGGTAGTTGCGGCGCTg > 1:499947‑M2/6‑226 (MQ=255) aacacCTGCCCGTCTTAAACAACCGTCGCTTTGCGCCGCCGCAATTATTATGATGTTTTTTTACTCGGCGCTTGATTCACCTTGTTACAGATTGCTATTGTGTGCGCGCGTCGAATGACCGTTAATATTCTCTGGTTTTTAAGGCGCGTTCTGTTGCCGGTTATATGTCAAGAAGGTATCTATGGGTGAGATTAGTATTACCAAACTGCTGGTAGTTGCGGCGCTGGTCGTTCTGCTGTTTGGGACTa > 2:324666‑M2/6‑248 (MQ=255) cTGCCCGTCTTAAACAACCGTCGCTTTGCGCCGCCGCAATTATTATGATGTTTTTTTACTCGGCGCTTGATTCACCTTGTTACAGATTGCTATTGTGTGCGCGCGTCGAATGACCGTTAATATTCTCTGGTTTTTAAGGCGCGTTCTGTTGCCGGTTATATGTCAAGAAGGTATCTATGGGTGAGATTAGTATTACCAAACTGCTGGTAGTTGCGGCGCTGGTCGTTCTGCTGTTTGGGACTAAGAAGtt > 1:66866/1‑250 (MQ=255) | TGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCGGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATTATAGATCCCTTTGGCGTCACCATTGCGGCAGCGTCAGAAATGCCTGCACTCATTATGGCGGAAGTGACGCCCGAACGTGTGCGTCAGGTGCGCGCGCAACTGCCCGTCTTAAACAACCGTCGCTTTGCGCCGCCGCAATTATTATGATGTTTTTTTACTCGGCGCTTGATTCACCTTGTTACAGATTGCTATTGTGTGCGCGCGTCGAATGACCGTTAATATTCTCTGGTTTTTAAGGCGCGTTCTGTTGCCGGTTATATGTCAAGAAGGTATCTATGGGTGAGATTAGTATTACCAAACTGCTGGTAGTTGCGGCGCTGGTCGTTCTGCTGTTTGGGACTAAGAAGTT > NC_000913/658521‑659020 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |