| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,101,395 | Δ11,672 bp | wbbL–rfbB | wbbL, insH7, wbbL, wbbK, wbbJ, wbbI, wbbH, glf, rfbX, rfbC, rfbA, rfbD, rfbB | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2101395 | 2113066 | 11672 | 57 [0] | [1] 59 | wbbL–rfbB | wbbL,insH7,wbbL,wbbK,wbbJ,wbbI,wbbH,glf,rfbX,rfbC,rfbA,rfbD,rfbB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2101394 | 0 (0.000) | 56 (0.580) | 50/488 | 0.4 | 100% | intergenic (‑126/+2) | gnd/wbbL | 6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating/interrupted rhamnosyltransferase WbbL |
| ? | NC_000913 | 2113067 = | 0 (0.000) | intergenic (‑6/+367) | rfbB/galF | dTDP‑glucose 4,6‑dehydratase 1/UTP:glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase, low activity | |||||
AGCCAGGTGCATCACTGCATCCGGCTGATGCTGAGCAAAAATCCGTGCCATTGCAGGTGCATCGCAAATATCCGCATGTTCAAAAACATAGCGTTCAGAATCAGAAACATCAGCAAGTGATTCCCGGTTTCCGGCGTACGTTAATTTATCGACATTAACAACACTATCCTGCGTATTATTTATAATGTGACGAACTACAGCTGAACCAATAAATCCTGCGCCACCAGTAACAAGTATTTTCACTTAATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCATGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAACCCTACTGCTAACTCGTTGTT > NC_000913/2112819‑2113317 | tcttccgtcttctcacgggaacggttgaaaatagagacggtataaccacggctttcgatgttgagcgcaaggttgcgtcccatcactgccataccgactacgccgatctgttgcttggacattacatactcctgtcaggtgtgatcaccgcgctgaatgctcgcggcctggaatgttcgcaaataagtatacaaagtacttattaaagtataaatagcttatccatgcttatatgcttacggctttatt < 1:148084‑M2/1‑1 (MQ=255) tccgtcttctcacgggaacggttgaaaatagagacggtataaccacggctttcgatgttgagcgcaaggttgcgtcccatcactgccataccgactacgccgatctgttgcttggacattacatactcctgtcaggtgtgatcaccgcgctgaatgctcgcggcctggaatgttcgcaaataagtatacaaagtacttattaaagtataaatagcttatccatgcgtatatgcttacggctttattta < 2:475055‑M2/3‑1 (MQ=255) tccgtcttctcacgggaacggttgaaaatagagacggtataaccacggctttcgaggttgagcgcaatgttgcgtcccatcactgccataccgactacgccgatctgttgcttggacattacatactcctgtcaggtgtgatcaccgcgctgaatgctcgcggcctggaatgttcgcaaataagtatacaaagtacttattaaagtataaatagcttatccatgcttatatgcttacggctttatttatt < 2:455221‑M2/5‑1 (MQ=255) ccgtcgtcgcccgggaacggttgaaaatagagtcggtataaccccggctttcgatgttgagcgcaaggttgcgtcccataactgcaataccgactacgccgatctgttgcgtggacattacatacgcctggcaggggtgatcaccgcgctgaatgctcgcggcctggaatgttcgcaaataagtatacaaagtactgattaaagtataaatagcttatccatggttatatgcttacggctttatTTATTcc < 2:628002‑M2/7‑1 (MQ=255) 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cacgggaacggttgaaaatagagacggtataaccacggcttgcgatgttgagcgcaaggttgcgtcccatcactgccataccgactacgccgatctgttgcttggacattacatactcctgtcaggtgtgatcaccgcgctgaatgctcgcggcctggaatgttcgcaaataagtatacaaagttcttattaaagtataaatagcttatccatgcttatatgcttacggctttatTCATTCCATATTAc < 2:665732‑M2/14‑1 (MQ=255) ggaacggttgaaaatagagccggtctaaccacggctttcgatgttgagcgcaaggttgcgtcccatcactgccataccgactacgccgatctgttgcttggacattacatactcctgtcaggtgtgatcaccgcgctgaatgctcgcggcctggaatgttcgcaaataagtatacaaagtacttattaaagtataaatagcttatccatgcttatatgcttacggctttatTTATTCCATATTACTTCaga < 2:282985‑M2/20‑1 (MQ=255) cggttgaaaatagagacggtataaccacggctttcgatgttgagcgcaaggttgcgtcccatcactgccataccgactacgccgatctgttgcttggacattacatactcctgtcaggtgtgatcaccgcgctgaatgctcgcggcctggaatgttcgcaaataagtatacaaagtacttattaaagtataaatagcttatccatgcttatatgcttacggctttatTTATTCCATATTACTTCAGAGCAt < 2:216586‑M2/24‑1 (MQ=255) 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ttcttacgtttttttttATTCCTTATTTCTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCTGTTTGATTAATAGGGATATTAATGCCCGCTACCGCCCCTTGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTAGGATGTGACGTGCGTTACCCACGCGCGCATAACCCGAAAAGTTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCTCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAACCCTa < 2:750101/236‑1 (MQ=255) ggcttacggctttatTTATTCCTTATTACTCCAGAGCTTGATGGGAAATAAGCGTCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGTCTTTACAGCTACCAGATCATTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCTCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAACCCTa < 2:669897‑M2/235‑1 (MQ=255) acggctttatTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAACCCTACTGCt < 1:625443‑M2/240‑1 (MQ=255) cggctttatTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCGAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAACCTTTGAATAAAACCCTACTGCTa > 1:309861‑M2/10‑250 (MQ=255) ttatTTATTCCATATTACTGCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAACCCTACTGCTAACTc < 1:538824‑M2/245‑1 (MQ=255) ttATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAACCTTTGAATAAAACCCTACTGCTAACTCgttttt > 2:447749/1‑248 (MQ=255) ttATTCCAGATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACCCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCGTGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAACCCTACTGCTAACTCgttgt < 2:76765/250‑1 (MQ=255) | AGCCAGGTGCATCACTGCATCCGGCTGATGCTGAGCAAAAATCCGTGCCATTGCAGGTGCATCGCAAATATCCGCATGTTCAAAAACATAGCGTTCAGAATCAGAAACATCAGCAAGTGATTCCCGGTTTCCGGCGTACGTTAATTTATCGACATTAACAACACTATCCTGCGTATTATTTATAATGTGACGAACTACAGCTGAACCAATAAATCCTGCGCCACCAGTAACAAGTATTTTCACTTAATTTATTCCATATTACTTCAGAGCATGCTGTGAAATAAGCGGCTCTCAGTTTGATTAATAGAGGTATTAATGCACGCTACCGCCCCTGGCTTTACAGCTACCAGAGCACTGCATGCATGCCTATGATGTGACGAGCGTTACCCACTCGCGCTAAACCCGAAAAATTCAAACGCTAATTGTCTTACCAATCCGCTCTGGAAACAAGGAAAATCCTGGAAAACTTTGAATAAAACCCTACTGCTAACTCGTTGTT > NC_000913/2112819‑2113317 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |