New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 1135349 = | 129 (1.320) | 3 (0.030) | 3/490 | 6.0 | 2.3% | coding (621/783 nt) | flgG | flagellar basal‑body rod protein FlgG |
? | NC_000913 | = 3089244 | 128 (1.310) | coding (961/1395 nt) | galP | galactose:H(+) symporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GCTGTTTAAAGAGAACAGCAACTTCCGCCGCGCGGTGTTCCTTGGCGTACTGTTGCAGGTAATGCAGCAATTCACCGGGATGAACGTCATCATGTATTACGCGCCGAAAATCTTCGAACTGGCGGGTTATACCAACACTACCGAGCAAATGTGGGGGACCGTGATTGTCGGCCTGACCAACGTACTTGCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCA > NC_000913/3089003‑3089492 | cTGTTTAAAGAGAACAGCAACTTCCGCCGCGCGGTGTTCCTTGGCGTACTGTTGCAGGTAATGCAGCAATTCACCGGGATGAACGTCATCATGTATTACGCGCCGAAAATCTTCGAACTGGCGGGTTATACCAACACTACCGAGCAAATGTGGGGGACCGTGATTGTCGGCCTGACCAACGTACTTGCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCtt > 1:596421/1‑251 (MQ=255) cTGTTTAAAGAGAACAGCAACTTCCGCCGCGCGGTGTTCATTGGCGTACTGTTGCAGGCAATGCAGCAATTCACCGGGATGAACGTCATCATGTATTACGCGCCGAAAATCTTCGAACTGGCGGGTTATACCAACACTACCGAGCAAATGTGGGGGACCGGGATTGTCCGCCTGACCAACGCACTTGCCACCTTTATCGAAATCGGCCTTGTTTACCGCTGGGGACGTAAACCaaccctaaccatgggcgt > 2:76464/1‑242 (MQ=255) cTGTTTAAAGAGAACAGCAACTTCCGCAGCGCGGTGTTCCTTGGCGTACTGTTGCCGATAATGCAGCAATTCACCGGGATGAACGTCATCATGTATTACGCGCCGAAAATCTTCGCACTGGCGGGTTATACCAAAACTACCGAGCAAATGTGGGGGGCCGGGATTTTCTGCCTGACCAACGTACTTGCCACCTTTATAGCCAACGGCCGTGTTGCCCGCTGGGGGCGGAAACCAACGCCAACGCTggggtt > 2:448036/1‑248 (MQ=255) gTTTAAAGAGAACAGCAACTTCCGCCGCGCGGTGTTCCTTGGCGTACTGTTGCAGGTAATGCAGCAATTCACCGGGATGAACGTCATCATGTATTACGCGCCGAAAATCTTCGAACTGGCGGGTTATACCAACACTACCGAGCAAATGTGGGGGACCGTGATTGTCGGCCTGACCAACGTACTTGCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCtt < 1:11191/249‑1 (MQ=255) gTTTAAAGAGAACAGCAACTTCCGCCGCGCGGTGTTCCTTGGCGTACTGTTGCAGGTAATGCAGCAATTCACCGGGATGAACGTCATCATGTATTACGCGCCGAAAATCTTCGAACTGGCGGGTTATACCAACACTACCGAGCAAATGTGGGGGACCGTGATTGTCGGCCTGACCAACGTACTTGCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTcc < 1:507750/251‑1 (MQ=255) ttAAAGAGAACAGCAACTTCCGCCGCGCGGTGTTCCTTGGCGTACTGTTGCAGGTAATGCAGCAATTCACCGGGATGAACGTCATCATGCATTACGCGCCGAAAATCTTCGAACTGGCGGGGTATACCCACACTACCGAGCAAATGTGGGGGACCGTGATTGTCGGCCTGACCAACGTACTTGCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGAAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTg > 1:247232/1‑251 (MQ=255) tAAAGAGAACAGCAACTTCCGCCGCGCGGTGTTCCTTGGCGTACTGTTGCAGGTAATGCAGCAATTCACCGGGATGAACGTCATCATGTATTACGCGCCGAAAATCTTCGAACTGGCGGGTTATACCAACACTACCGAGCAAATGTGGGGGACCGTGATTGTCGGCCTGACCAACGTACTTGCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTg < 1:157628/250‑1 (MQ=255) aaGAGAACAGCAACTTCCGCCGCGCGGTGTTCCTTGGCGTACTGTTGCAGGTAATGCAGCAATTCACCGGGATGAACGTCATCATGTATTACGCGCCGAAAATCTTCGAACTGGCGGGTTATACCAACACTACCGAGCAAATGTGGGGGACCGTGATTGTCGGCCTGACCAACGTACTTGCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTg > 1:676496/1‑251 (MQ=255) gataccatcAACTTCCGCCGCGCGGTGTTCCTTGGCGTACTGTTTCAGGTAATGCAGCAATTCCCCGGGATGAACGTCATCATGTATTACGCGCCGAAAATCGGCGAACTGTCATGTTATACCAACACTACCGAGCAAATGTGGTGGACCGTGATTGTCGGCCTGACCAACGTACTCGCCACCTTTATCGCAAGCGGCCTTGTTGTCCGCTGGGGACGTAAACCAACTCTCACGCTGGGCTTCCTGGTGAt < 2:605060/243‑1 (MQ=255) aagaACAGCAACTTCCGCCGCGCGGTGTTCCTGGGCGTACTGTTGCAGGTAATGCAGCAAGTCACCGGGATGAACGTTATCATGTATTACGCGACGAAAATCTTCGAAGTGGCGGGTTATACCAACACTACCGAGCAAATGTGGGGGACCGTGATTGTCGGCCTGACCAACGTACTTGCCACCTTTAGCGCAATCGGCCTTGGTGACCGCTGGGGACGTAAACCACCGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGAt < 2:438404/250‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |