| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 2,417,058 | Δ10,734 bp | yfcC–[argT] | yfcC, yfcD, yfcE, yfcF, yfcG, folX, yfcH, rpnB, hisP, hisM, hisQ, hisJ, [argT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 2417058 | 2427791 | 10734 | 75 [0] | [1] 76 | yfcC–[argT] | yfcC,yfcD,yfcE,yfcF,yfcG,folX,yfcH,rpnB,hisP,hisM,hisQ,hisJ,[argT] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 2417057 | 0 (0.000) | 75 (0.770) | 65/490 | 0.2 | 100% | intergenic (+166/‑24) | pta/yfcC | phosphate acetyltransferase/putative transporter YfcC |
| ? | NC_000913 | 2427792 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+265) | argT/ubiX | lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic binding protein/flavin prenyltransferase | |||||
CGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCCCACTTTGCATACTTACCACTTTGTTTTGTGCAAGGGAATATTTGCGCTATGTCCGCAATCACTGAATCCAAACCAACAAGAAGATGGGCAATGCCCGATACGTTGGTGATTATCTTTTTTGTTGCTATTTTAACCAGCCTTGCCACCTGGGTAGTTCCGGTGGGGATGTTTGACAGTCAGGAAGTGCAGTATCAGGTTGATGGTCAAACAAAAACACGCAAAGTCGTAGATCCACACTCATTTCGCATTCTGACTAACGAAGCAGGC > NC_000913/2416810‑2417299 | cGACCTGTACCGTAGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATACTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCTCACTTTGCATACTTCCCACTTTGTTac > 2:607596‑M1/1‑248 (MQ=255) gccctggTTTACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACGGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCTCACATTGCATACTTCCCACTTTGTTacataaccctcaagtgaaa < 2:79152‑M1/248‑20 (MQ=255) cACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCTCACTTTGCATACTTCCCACTTTGTTacataaccctcaagtgaaaa < 2:23824‑M1/251‑21 (MQ=255) aCTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGCTATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCTCACTTTGCATACTTCCCACTTTGTTacataaccctcaagtgaaaat > 2:426694‑M1/1‑230 (MQ=255) 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acCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCTCACTTTGCATACTTCCCACTTTGTTacataaccctcaagtgaaaatggcttttttatgttgtgtattg < 1:555700‑M1/251‑44 (MQ=255) cgcgCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCTCACTTTGCATACTTCCCACTTTGTTacatatccctcaagtgaaaatggcttttttatgttgtgtattgtgtt < 2:321469‑M1/250‑48 (MQ=255) gACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGATTTTTATTCTCTTAATGTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCTCACTTTGCATACTTCCCACTTTTTTacataaccctcaagtgaaagtggcttttttatgttgtgtattgtgttgtgtgtt > 1:861‑M1/1‑197 (MQ=255) 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atcCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCTCACTTTGCATACTTCCCACTTTGTTacataaccctcaagtgaaaatggcttttttatgttgtgtattgtgttgtgtgtttgcaggctctttcatgcaggtcttatgccatcttgacgac > 2:78071‑M1/1‑156 (MQ=255) gCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCTCACTTTGCATACTTCCCACTTTGTTacataaccctcaagtgaaaatggcttttttatgttgtgtattgtgttgtgtgtttgcaggctctttcatgcaggtcttatgccatcttgacgacaacagtaa < 2:658946‑M1/251‑103 (MQ=255) ttGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCTCACTTTGCATACTTCCCACTTTGTTacataaccctcaagtgaaaatggcttttttatgttgtgtattgtgttgtgtgtttgcaggctctttcatgcaggtcttatgccatcttgacgacaacagtaacat > 1:623818‑M1/1‑146 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |