Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_000913 | 2,030,451 | Δ10,928 bp | [yedA]–[zinT] | [yedA], [vsr], dcm, yedJ, drpB, rseX, hchA, hprS, hprR, hiuH, msrP, msrQ, [zinT] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 2030451 | 2041378 | 10928 | 89 [0] | [0] 89 | [yedA]–[zinT] | [yedA],[vsr],dcm,yedJ,drpB,rseX,hchA,hprS,hprR,hiuH,msrP,msrQ,[zinT] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2030450 | 0 (0.000) | 89 (0.910) | 75/492 | 0.1 | 100% | coding (912/921 nt) coding (469/471 nt) |
yedA vsr |
putative transporter YedA DNA mismatch endonuclease Vsr |
? | NC_000913 | 2041379 = | 0 (0.000) | coding (5/651 nt) | zinT | metal‑binding protein ZinT |
TCGATTATCGCCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2030205‑2030450 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAACCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGCGGAT > NC_000913/2041379‑2041623 tcgcTTATCGCCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGAGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATT > 1:106351/5‑251 TCGATTATCGCCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATT > 1:106365/1‑251 atgATCGCCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGT < 1:50997/248‑1 aacgcgtgTATGTATTTAATCCGTGATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACACTTACGTTAACCCGATGGTCGCGGTCTTGCTGGGTGCGGGACGGAGGGTAGAAAGACGTTTGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCATAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAAGATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTAGTCAGGACGCATCACGATTCGTCGTTACAAACTG < 1:741336/243‑1 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TATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGT < 1:481872/250‑1 ATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTT < 1:87131/250‑1 GTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTT < 1:280113/251‑1 TTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGG < 2:122252/250‑1 TAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGAGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGATGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGATTTAGGTG > 2:266779/1‑251 ATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTC > 1:474009/1‑251 ATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGATACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGGCTTGCTGGGTACGGGCCTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGACTGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAACTATCTCTTCCCGGCAAACCCCGTAGATGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTC > 2:268242/1‑251 CCGTAATGTCAGGCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCGTGCTGGGGACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCT < 2:474009/250‑1 CCGTAATGGCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTT < 1:760331/251‑1 AATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATT > 1:523467/1‑251 AATGTCAGGCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTGAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTAT < 2:269781/250‑1 gGTCAGTCCGGCTCGCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCTGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGTCTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTTGTACTGGTCCCGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGTTGCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGT < 2:534791/250‑1 GTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTT > 2:123400/1‑251 CCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGAGTCTTTATTGTTAGCGCT > 2:593556/1‑251 cggaTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGCGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCCCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCCCGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCCGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGTCTGGTGCTTTAGGTGTCTTTATTTTTAGCGCTC > 2:244224/5‑251 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CACCAGATACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGATCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCCTCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTTTTTATTGTTAGCACTCCCGCCTTTTC > 2:593826/1‑251 ACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCG > 1:144900/1‑251 CGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCA < 1:594120/251‑1 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ACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTG > 1:730238/1‑251 CTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAANCCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGG > 2:376493/1‑251 gtcgCGTTGGGAAAATAGCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCTCGATTCGTCTTTACCAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCAGCACTCTCACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTGTTGATGATTCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAA < 2:94216/247‑1 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CCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTG < 1:87441/251‑1 CGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTG > 1:152390/1‑250 gAGTTGCGTCAGTTATTCAGGACGCATCACGACGAGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCGGTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCACCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGACAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACGGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTAGCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACC < 1:142254/250‑1 GTTATTCAGGACGCATCACGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAGCCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGA > 1:486037/1‑154 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGATTCGTCTTTACAAACTGGCTGTTGCTTTAGGTGTCTTTATTGTTAGCGCTCCTGCCTTTTCGCATGGTCATCACTCACACGGCAAACCCTTAACAGAGGTCGAACAAAAAGCTGCTAATGGTGTTTTTGATGATGCCAATGTACAAAACCGAACGCTCAGTGACTGGGATGGAGTCTGGCAATCCGTTTATCCTTTACTGCAAAGTGGCAAACTTGACCCCGTCTTTCAGAAGAAAGCGGAT > NC_000913/2041379‑2041623 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |