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aaGGCGATGAGTGTGATCCGTTCCGCGTGGAACGGCGGGATGGTGGCTTGT‑GGTGGCGTGCGGTTGCGCTCTGCG‑ATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCA‑TGATGGCAGACCGCTTAGTTTAACGATTTGCGGTTGAAGGGGCCGGTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGATCATAAATGCGCTCAAGCAGTTTAGCAGTGACAATCTCCtt < 2:397728/251‑1 (MQ=255) ggATTATTGTGATCCTTACCGCGTTGATCGGCGGGATGGTGGCTTGT‑GGTGGCGTGCTGTTGCGCTATGCG‑ATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCA‑TGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTTGAAGGTGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGACCATAAATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAAGCTCCTTCGgc < 1:472741/250‑1 (MQ=255) cGATTATTGTGATCCTTTCCGCGTTGATCGGCGGGATGGTGGCTTGT‑GGGGGCGTGCTGTTGCGCTATGCG‑ATGGCATCCAGAAAAAAGGATGCCA‑TGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTTGAAGGTGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGGTCATGCAGCGCAGACCATAAATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGgc > 1:2182/1‑251 (MQ=255) gATTATTGTGATCCTTTCCGCGTTGATCGGCGGGATGGTGGCTTGT‑GGTGGCGTGCTGTTGCGCTATGCG‑ATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCA‑TGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTTGAAGGTGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGACCATAAATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGgcg < 1:426900/251‑1 (MQ=255) tattGTGATCCTTTCCGCGTTGATCGGCGGGATGGTGGCTTGT‑GGTGGCGTGCTGTTGCGCTATGCG‑ATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCA‑TGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTTGAAGGTGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGACCATAAATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCt < 1:150070/250‑1 (MQ=255) aTCCTTTCCGCGTTGATCGGCGGGATGGTGGCTTGT‑GGTGGCGGGCTGTTGCGCTATGCG‑ATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCA‑TGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTTGAAGGGGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGACCATAAATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGc > 1:574961/1‑251 (MQ=255) 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gTTGATCGGCGGGATGGGGGCTTGT‑GGTGGCGTGCTGTTGCGCCCTGCG‑ATGGAATCCAGAAAACAGGATGCCA‑TGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGGTGAAGGTGCCGTTCGGCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGGTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGAACATGCAGCGCAGACCCTAAAAGCGCTCAATCAGTTCCGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCCTAGCAACAATTttcc > 1:337481/1‑251 (MQ=255) ttGAGCGGCGGGATGGTGGCGTGT‑GGTGGCGTGCTGTTGCGATATGCG‑ATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCA‑TGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTTGAAGGTGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCTGC‑AACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGACCATAAATGCGCTCAATCAATTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTttc < 2:447516/249‑1 (MQ=255) gcggGATGGTGGCTTGT‑GGTGGCGTGCTGTTGCGCTATGCG‑ATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCA‑TGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTTGAAGGTGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGACCATAAATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc < 2:116843/251‑1 (MQ=255) cggGATGGTGGTTTGT‑GGTGGCGTGCTGTTGCGCTATGCG‑ATGGCATCCAGACAACAGGATGCCA‑TGCTGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTTGAAGGTGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGACCATAAATGCGCTCAATAAGTTCAGCAGTGAAACTCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc > 2:332104/1‑250 (MQ=255) gggATGGTGGCTTGT‑GGTGGCGTGCTGTTGCGCTATGCG‑ATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCA‑TGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTTGAAGGTGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGACCATAAATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgca > 1:461877/1‑250 (MQ=255) gagggtggCTTGT‑GGGTGCGTGCTGTGGCGCTATGCG‑ATGGCATCCAGAAATCAGGATGCTA‑TGATGGCAGACCACGTAGTTTAACGATTTGCGGTTGAAGGTGCCGGTCGTCCGGGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGACCATAAAGGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCGTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgtaatg < 2:346420/248‑1 (MQ=255) agggtggCTTGT‑GGTGGCGTGCTGTTGCGCTATGCG‑ATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCA‑TGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTTGAAGGTGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGACCATAAATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTGCCCgcaatgc < 2:210299/249‑1 (MQ=255) gtggCTTGT‑GGTGGCGTGCTGTTGCGCTATGCG‑ATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCA‑TGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTTGAAGGTGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAAACCATAAATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgccatgcaat > 1:453177/1‑251 (MQ=255) | TCGGTGCAGACGGTATTGAACGCAAACTGGAAATAGAAAAAGCGGTCACTGACGTTGCGGAACTGAACGGTGAATTACGTAATCGGCAGTATCTTGTCGAGCAATTAACAAAAGCACATGTCAACGATGTGAATTTTACGCCGTTTAAATATCAGTTAAGCCCGTCATTGCCAGTGAAAAAAGACGGTCCGGGTAAGGCGATTATTGTGATCCTTTCCGCGTTGATCGGCGGGATGGTGGCTTGT‑GGTGGCGTGCTGTTGCGCTATGCG‑ATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCA‑TGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTTGAAGGTGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGG‑CGTTCCGGC‑AACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGACCATAAATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCGCAATGCAAT > NC_000913/619071‑619557 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |