Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 2,985,842 | Δ47,769 bp | yqeG–[idi] | 39 genes yqeG, yqeH, yqeI, yqeJ, yqeL, yqeK, ygeG, ygeH, ygeI, insD4, insC4, ygeQ, glyU, actS, xdhA, xdhB, xdhC, ygeV, ygeW, ygeX, ygeY, hyuA, yqeA, yqeB, yqeC, mocA, ygfK, ssnA, ygfM, xdhD, xanQ, guaD, ghxQ, ygfS, ygfT, uacT, yqfG, yqfH, [idi] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 2985842 | 3033610 | 47769 | 59 [0] | [0] 59 | yqeG–[idi] | yqeG,yqeH,yqeI,yqeJ,yqeL,yqeK,ygeG,ygeH,ygeI,insD4,insC4,ygeQ,glyU,actS,xdhA,xdhB,xdhC,ygeV,ygeW,ygeX,ygeY,hyuA,yqeA,yqeB,yqeC,mocA,ygfK,ssnA,ygfM,xdhD,xanQ,guaD,ghxQ,ygfS,ygfT,uacT,yqfG,yqfH,[idi] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2985841 | 0 (0.000) | 59 (0.810) | 55/492 | 0.1 | 100% | intergenic (‑249/‑6) | yqeF/yqeG | putative acyltransferase/putative transporter YqeG |
? | NC_000913 | 3033611 = | 0 (0.000) | coding (547/549 nt) | idi | isopentenyl‑diphosphate Delta‑isomerase |
GCACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAAGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑TTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCAGATAATGTCTAATATTTGGTCTAAAGAAGAAACTCTGTGGAGTTTCGCGCTCTACGGCACAGCCGTTGGTGCAGGCACGCTCTTCCTTCCTATTCAGTTAGGTTCGGCAGGGGCTGTGGTCCTGTTTATTACTGCTCTGGTCGCCTGGCCTTTAACATATTGGCCACATAAAGCCTTGTGCCAGTTCATCCTCTCATCAAAAACATCAGCAGGTGAAGGGATAACGGGCGCGGTAACACAC > NC_000913/2985602‑2986083 | gCACCAATTAACCGTGCAATAGTAATTGATTTTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAATGATTTTTATCACAAAAGACATTTGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGCCTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGCAGATAGGGCGTTAATCTCCCATCCTTAACCTGGTTTATGGAAAATTGCCATCCATT‑CTCTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaacccc > 2:351044‑M1/1‑240 (MQ=255) aaTTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAAATGGCACGTAGGGTTTGCAAACACTAACCCAACAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATAGCACTCCATT‑CTGTTTAGTTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgac > 1:147196‑M1/1‑235 (MQ=255) aaTTAACAGTGCAATAGTAAATGATAGTTCATTACAGTTAACTTACTTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGAAGATATGGCGTTAATCTCCCATACTTAAACTGGTTTATGGTAAATTGCCATCAATT‑ATGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgac > 2:574244‑M1/1‑235 (MQ=255) aaCAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttg > 2:129602‑M1/1‑231 (MQ=255) cAGTGCAATAGTAGATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacctttgcc > 2:328037‑M1/1‑229 (MQ=255) tGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGCAATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGTTGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggg > 2:218226‑M1/1‑226 (MQ=255) aaTAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggtt > 2:348374‑M1/1‑223 (MQ=255) aTGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTATTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGATTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGAAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcat > 1:460898‑M1/1‑215 (MQ=255) aTTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTCAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataac > 2:337287‑M1/1‑212 (MQ=255) gTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgt < 2:304532‑M1/250‑42 (MQ=255) ttAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgta > 1:247284‑M1/1‑208 (MQ=255) ttAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgta > 2:407945‑M1/1‑208 (MQ=255) aaTTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGGGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatg > 1:573249‑M1/1‑206 (MQ=255) aCAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGTCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAAGAGAGGGGAAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaacaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataccgtaatgcttt > 2:298335‑M1/1‑202 (MQ=255) aGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGGGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACCTAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttatt > 2:546541‑M1/1‑200 (MQ=255) aTCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttatttta < 1:158482‑M1/250‑55 (MQ=255) aaTTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggac < 1:531940‑M1/251‑61 (MQ=255) aaaaaaaGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgcc < 1:302312‑M1/251‑69 (MQ=255) aaaaaaaGTGATTTTGATCACAAAGGAAATNTGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTTGCATGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCACATACTTAACCTGGTTTATGGTAAAGTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgc < 2:254154‑M1/250‑68 (MQ=255) aGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaac > 2:245560‑M1/1‑177 (MQ=255) ttttATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTGGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTGGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatgtgccggggttgggagcataacggaatgcttattttaccggacgcatcgccgagaacagaat < 2:151537‑M1/250‑80 (MQ=255) tttATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaata > 1:138005‑M1/1‑170 (MQ=255) tCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtc > 1:468811‑M1/1‑166 (MQ=255) cacaAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcg > 1:377806‑M1/1‑165 (MQ=255) aGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggat > 1:461611‑M1/1‑160 (MQ=255) gAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatgg > 1:249261‑M1/1‑158 (MQ=255) atatGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAGCTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtat < 1:374582‑M1/251‑97 (MQ=255) atatGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaacccagacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatctccgggaacagcatcacgtcgcggctggtat > 2:9319‑M1/1‑155 (MQ=255) atGCCTGAGCTGCAGTAAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCAGCAATAGAGGGGTATATAGGGCGTTAATCGCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATG‑CTGTTTAATTTGGAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtata < 2:362424‑M1/250‑98 (MQ=255) atGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACAGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgccattttccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccggaaacagaataccttcgcggttcgtatgg > 2:385194‑M1/1‑153 (MQ=255) gCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTATCCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATC‑CGGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccgggggtgtgagaataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggct < 1:559324‑M1/251‑101 (MQ=255) agcagcAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCta < 2:429262‑M1/148‑3 (MQ=255) agcagcAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCta > 1:429262‑M1/1‑146 (MQ=255) gcagTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgc > 1:475774‑M1/1‑142 (MQ=255) agTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGTTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaaca < 1:564669‑M1/251‑112 (MQ=255) gTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaatccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacag < 2:105661‑M1/251‑113 (MQ=255) aCATAACTGGCACGTAGGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattacc < 2:43528‑M1/251‑120 (MQ=255) gtagggtttgCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaagaacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgatac < 1:372279‑M1/247‑133 (MQ=255) aaCCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgacaccaattcccagacctgc < 2:487123‑M1/249‑149 (MQ=255) aCCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgt > 1:239613‑M1/1‑100 (MQ=255) tAGAGGGGGAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGGAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgccatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgtttgtgaaccacattacaatacgttcgatcccaattcccagacctgctgcaggcggta > 2:48462‑M1/1‑91 (MQ=255) ggggTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagcca < 1:496966‑M1/251‑165 (MQ=255) aTAGTGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggggaacagcattaccatacggtcggaaacaattcccagaccttctatcggcggtaatgcatgtttc > 2:430954‑M1/1‑80 (MQ=255) gTTAATTTCCCATACGTAACCTGTGTTATGGTAAATTGCCCTCCATG‑CTGTTTAATTGGTATATGATACGTTCtaaaaaaaccccgaacttggccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtgtggctgtgggtgaacagcatgaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagccatgttccagtgcggt < 2:447945‑M1/251‑179 (MQ=255) tAATCTCCCATCCTTAACCTGGGTTATGGTAAATTGCCCTCCATTCTTG‑TTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacagttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagccatgttccagtgcggtg < 2:506814‑M1/250‑180 (MQ=255) tctcCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtnggcggtaagccatgttccagtgcggtgacgg > 2:289717‑M1/1‑68 (MQ=255) cccATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgcgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggaatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgccgggggtaagcccggttccagtgcggcgacgcaat > 1:248330‑M1/1‑65 (MQ=255) gctTAGCCTGTTTTATGGTAAATTGCCCCCCATT‑CTGTTGAATGTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatctccgggaacagaataacggcgcggatggtatggctgttggtgatcagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagccatgttccagtgcggtgacgtaatcttc < 2:192499‑M1/249‑191 (MQ=255) ggTTTATGGTAAATTGCCCGCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgccgtcggcggtaagccatgttccagtgcggtgacgtaatcttcctcgtagaac > 2:418762‑M1/1‑51 (MQ=255) ttGCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagccatgttccagtgcggtgacgtaatcttcatcgtagaacatcgcttcgtcgt > 1:471738‑M1/1‑38 (MQ=255) gCCCTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagccatgttccagtgcggtgacgtaatcttcatcgtagaacatcgcttcgtcgtca < 2:214978‑M1/251‑216 (MQ=255) cccTCCATT‑CTGTTTTATTTGTGGATGATTCGTTCtaaaaaaaccccgccagttgccggtgttgtgagcataacgtaatgcttattttgccggacgcatcgccgggaacagaataacgtctcggatggtatggctggtggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagccatgttccagtgcggtgacgtaatcttcatcgtagaacatcgcttcttcgtca < 2:581292‑M1/250‑216 (MQ=255) cTCCATT‑CTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagccatgttccagtgcggtgacgtaatcttcatcgtagaacatcgcttcgtcgtcaccc > 1:507255‑M1/1‑33 (MQ=255) gTTTAATTTGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagccatgttccagtgcggtgacgtaatcttcatcgtagaacatcgcttcgtcgtcacctgcgtct < 1:60864‑M1/248‑225 (MQ=255) ttGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagccatgttccagtgcggtgacgtaatcttcatcgtagaacatcgcttcgtcgtcacctgcgtctttcgcggca > 1:40361‑M1/1‑17 (MQ=255) tGTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagccctgttccagtgcggggacgtaatcttcatcggagaacatcnctttgtcgtcacctgcggctttcgcggccac > 2:284655‑M1/1‑16 (MQ=255) gTAGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagccatgttccagtgcggtgacgtaatcttcatcgtagaacatcgcttcgtcgtcacctgcgtctttcgcggcaacc > 1:56498‑M1/1‑15 (MQ=255) aGATGATACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagccatgttccagtgcggtgacgtaatcttcatcgtagaacatcgcttcgtcgtcacctgcgtctttcgcggcaacct < 1:245560‑M1/250‑238 (MQ=255) gatACGTTCtaaaaaaaccccgacatttgccggggttgtgagcataacgtaatgcttattttaccggacgcatcgccgggaacagaataacgtcgcggatggtatggctgttggtgaacagcattaccatacggtcgataccaattcccagacctgctgtcggcggtaagccatgttccagtgcggtgacgtaatcttcatcgtagaacatcgcttcgtcgtcacctgcgtctttcgcggcaacctgatcc > 1:463414‑M1/1‑9 (MQ=255) | GCACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAAGGTTTGCAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATT‑TTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCAGATAATGTCTAATATTTGGTCTAAAGAAGAAACTCTGTGGAGTTTCGCGCTCTACGGCACAGCCGTTGGTGCAGGCACGCTCTTCCTTCCTATTCAGTTAGGTTCGGCAGGGGCTGTGGTCCTGTTTATTACTGCTCTGGTCGCCTGGCCTTTAACATATTGGCCACATAAAGCCTTGTGCCAGTTCATCCTCTCATCAAAAACATCAGCAGGTGAAGGGATAACGGGCGCGGTAACACAC > NC_000913/2985602‑2986083 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |