| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,498,768 | 9486 bp→CCC | [pyrS]–fryB | [pyrS], pyrR, ypdC, fryA, ypdE, ypdF, fryC, fryB | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2498768 | 2508253 | 9486 | 50 [0] | [0] 50 | [pyrS]–fryB | [pyrS],pyrR,ypdC,fryA,ypdE,ypdF,fryC,fryB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2498767 | 0 (0.000) | 49 (0.680) +CCC |
43/486 | 0.3 | 100% | coding (97/1698 nt) | pyrS | sensor histidine kinase PyrS |
| ? | NC_000913 | 2508254 = | 0 (0.000) | intergenic (‑12/+207) | fryB/glk | putative PTS enzyme IIB component FryB/glucokinase | |||||
GTCGCGTGATTCGAAACGTTCGTTATCTTCCGGGGTAACTGCCACGGAGTGGATGATGATGGTCGCTTCGGCGATATCCTGCGCCGTCAGGCGATTCTGGATACCGTCCGCGCCCTGGGTTTCAATTTTCACTTCATAACCGGCTTCTACCGCCGCTTCTTCCAGCGCCTGAGCGGCCATAAAGGTGTGAGCCAGGCCCATCGGGCAGGCACATAAGGCAATCAGTTTCTTACTCATCGTTAATTCCTCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAA > NC_000913/2508006‑2508503 | gaagtgcattatcaagagatgcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttttcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGt > 2:173174‑M2/249‑251 (MQ=255)gaagtgcattatcaagagatgcattgctaatacaccatttatctatcaagccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGt > 1:303302‑M2/249‑251 (MQ=255) cattatcaaaagatgcattgctaatacaccatttatatatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcatgatctttctcatcctgatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTg > 1:108930‑M2/243‑251 (MQ=255) attatcaagagatgcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatcgaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgacatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcacccgtatacgcctgtttcgcccccCGTTcaggg > 1:519980‑M2/242‑248 (MQ=255) 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atacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcctcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttcttcagagtcacccgtgcacgcaatattccacatgctgctggcggtcttcgatcgggccgcgttaatgcttatcttcccgttctttctcatccgtatccgcctttttcccgcccCGTTCCGTTGTAGTTGACGAGTGAAATtattt > 2:474670‑M2/220‑249 (MQ=255) ctctttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggactgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagagttaatgcttatctgcctggtctttctcatccgtatccgtctgtttcacgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACg > 1:275977‑M2/215‑249 (MQ=255) ccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGGGTGAAATTATGAACGTg > 1:275994‑M2/215‑251 (MQ=255) ccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGt < 1:171322‑M2/53‑1 (MQ=255) ccttttaaaattttggtttttcctcaaaaacggcatgctgttcatcagccttcagtttacctatcatagaggtttaatccttattcagggtcacccttgcacgaaatattcaacatgctgctgccggtcttcgatcgggcagctttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTa < 1:250637‑M2/55‑1 (MQ=255) ccgtttaaaattttggtttttcctcaaaaccnccctgctggtcatcggccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcccccgtgcacgaaatatccaacatgctgctggcggtcttcgatcggtcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTa < 2:270494‑M2/55‑1 (MQ=255) aaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGAc < 1:196937‑M2/61‑1 (MQ=255) aaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgaacgggcagcgttaatgcttatatgcctgttctttctcatccgtattcgcctgtttcgcccccCGTTCAGGGATAATTGACGCGTGAAATTATGAACGTGCAAAACCACTCGCCGTGACCAGAc > 2:146241‑M2/190‑250 (MQ=255) tgtgttttttcccaaaaaacggcctgtgggtcatcagccttcatgttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgtttatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAaat < 2:347703‑M2/65‑1 (MQ=255) tttcctcaaaaacggcttgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCAt < 1:20207‑M2/72‑1 (MQ=255) cctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGTGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTa > 2:163098‑M2/176‑250 (MQ=255) aaacggcctgctggtcatcagccttcagtttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGgaga < 1:423511‑M2/82‑1 (MQ=255) gttggtcatcagctgtcaggttacctatcatataggtttaagccttatgcagagtcacccgttcccgaaatattcaccatgctgctggcggtctccgatcgggcagctttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATccc < 2:4349‑M2/91‑1 (MQ=255) gctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATc < 1:208868‑M2/89‑1 (MQ=255) gctggtcatcagccttcaggttacctaacatagaggtttaatccttattcagattcacccgtgcccgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccttatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATccc < 2:13445‑M2/91‑1 (MQ=255) 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aatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAgggg > 1:173503‑M2/122‑251 (MQ=255) ttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGGGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGacac > 1:470878‑M2/117‑250 (MQ=255) attcagagtctcccgggcacgaaatattcaacatgctgctggcggtctgcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCATGTCGACCTTGTTAGGGGACACaa < 1:163098‑M2/136‑1 (MQ=255) cagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGaa < 1:447876‑M2/140‑1 (MQ=255) agagtcacccatgcacgaaatattcatcatgcttctggcggtcttcgatcggtcatgtttaatgtttatctgccttttctttctcacccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTTATAGTTGACGATGGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCAGTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGTCCTTTTGAGGGGACACAAAGaaa < 2:493350‑M2/141‑1 (MQ=255) aggcacccgtgcacaaaatattcaacaggctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGaaaaa < 1:474670‑M2/143‑1 (MQ=255) 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gtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcttgttctttctcatccatatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGAGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGagag < 2:49165‑M2/181‑1 (MQ=255) tctaccgtgccgctttattgctcatcggcctgtactttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCAGTTACTGGAGTATTAACCCCGCTGTACGGAAGTGTGCCGCAGGTAGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATCAACTGTATGATTTAAAAGAGTATCGTGAGAGtt < 2:374014‑M2/183‑1 (MQ=255) tcgatcgggcagcgttaatgcttatctgccttttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTAAGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGGACGGAAGTGTGACGCAGGTCGGCCTTGTGAGGGGACACACAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGAGTATCTGGAGAGt < 2:396245‑M2/182‑1 (MQ=255) 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cCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAAGCGCCGTTACCAGACAAATAATGCAGTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACCTCCCGATATAAAAGGAAGTATTTACAGAATGTGACCTAAGGGCTGGCGTAAATGTGCACCGGaa < 2:43732‑M2/250‑1 (MQ=255) | GTCGCGTGATTCGAAACGTTCGTTATCTTCCGGGGTAACTGCCACGGAGTGGATGATGATGGTCGCTTCGGCGATATCCTGCGCCGTCAGGCGATTCTGGATACCGTCCGCGCCCTGGGTTTCAATTTTCACTTCATAACCGGCTTCTACCGCCGCTTCTTCCAGCGCCTGAGCGGCCATAAAGGTGTGAGCCAGGCCCATCGGGCAGGCACATAAGGCAATCAGTTTCTTACTCATCGTTAATTCCTCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGGAA > NC_000913/2508006‑2508503 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |