| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1740750 | 85 (1.170) | 3 (0.040) | 3/490 | 5.5 | 4.2% | coding (840/1212 nt) | punC | purine nucleoside transporter PunC |
| ? | NC_000913 | = 4127302 | 51 (0.700) | coding (593/609 nt) | yiiX | putative lipid‑binding hydrolase YiiX | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CGACCTGCTACGTTCTAAAACCTATCGCGGCAACGTGCTGATATACGCAGCCTGTTCAGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCC‑CAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCAC > NC_000913/1740501‑1740998 | cGACCTGCTACGTTCTAAAACCTATCGCGGCAACGTGCTGATATACGCAGCCTGTTCAGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTTCTGTTTGCTGTcc > 2:103886/1‑250 (MQ=255)cGACCGGCTACGTTCTACAACCTATCGCGGCAACGTGCTGATATACGCAGCCTAGTCCGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTAACCGTTCATCCTTCGTGAACTGGTCTACAACCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCACGCTACCGCGTTTCTGATTGGTGGTTCTTGCTTTCGCGCCGAGCTGCCGAAAAGGCAAGGCGAGCAGGTTTTCCCTTGGTTTCTTGTGCTGATTGCAGTcg > 2:457094/1‑250 (MQ=255) gACCTGCTACGTTCTAAAACCTATCGCGGCAACGTGCTGATATACGCAGCCTGTTCAGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTc > 1:124998/1‑249 (MQ=255) gctcagTTCTAAAACCTACCGCGGCAACGTGCCGATATACGCAGCCTGTCCAGCCAGTTTGTTTGCATGGCTGACCGGTTTACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTAGTGGTTTAAGTTATGCCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGt < 1:457094/244‑1 (MQ=255) cTACGTTCTAAAACCTATCGCGGCAACGTGCTGATATACGCAGCCTGTTCAGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGCAATGGCAAGGCAAGCAGGTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGACAt > 2:141638/1‑251 (MQ=255) cTAAAACCTATCGCGGCAACGTGCTGATATACGCAGCCTGTTCAGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGGTATTACCGTGGTTGCTGGGGCTGTTTTCTGTCAGCGTCCTTGCGAcc > 2:505640/1‑251 (MQ=255) ggCAACGTGCTGATATACGCAGCCTGTTCAGCCAGTTTTTATGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTCTTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGGTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGGTATAAACGGTGTTGCTGGGGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCGGAGGGCtt > 2:560196/1‑251 (MQ=255) gATATACGCAGCCTGTTCAGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCa < 1:98131/249‑1 (MQ=255) atatACGCAGCCTGTTCAGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTACCCCGTTTCTGTTTGGTGGTTATGGCTGTTGCCCCCCGTTGCAGAAATGGGCAGGCAGGAAGTTTTTACCGGGGTTGCGGGTGTTTTTTGCTGTCAGGGTCATTGGGACCTGGGTGGCGGGCTTCAttgcccttgt > 2:483730/1‑243 (MQ=255) atatACGCAGCCTGTTCAGCCAGTTTTGTTGCATGGCGGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATGTCCGTGGTTGCGGGTGCGGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCAtgt < 1:519872/251‑1 (MQ=255) aCGCAGCCTGTTCAGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTCCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGGTTGCTGTCAGCGTCCTTGCGACCTGGGCGGCGGGCGTCATTAGCCAcgtgacg > 2:525539/1‑248 (MQ=255) cgtcgCCTGTTCAGCCAGTTTTTTTGCCTGTCTTACCGGTTCTCCTTTCATCTGTAGTGAAATGGGCTCCAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTGATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTTTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGTCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTTATGTGTGCTGTCAGCGTCATTGCTACCTGGGCTGCGGGCTTCATGAGCCATGGGTCg < 2:339737/246‑1 (MQ=255) gCAGCCTGTTCAGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCt < 2:159414/251‑1 (MQ=255) tGTTCAGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGGTATGGCTGTCCCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTTTTACCGTGGGTGCTGGGGCCGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTTGCCATGTGTCGCTgggcg > 2:90401/1‑247 (MQ=255) cAGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCACGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCCTTGCAACCTGGGCTGCGGNCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGCAATc > 2:290500/1‑251 (MQ=255) cAGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAAt < 2:112746/250‑1 (MQ=255) aGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATcc > 1:307314/1‑251 (MQ=255) aGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATcc > 1:30632/1‑251 (MQ=255) tttGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCTGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCAt < 2:463344/250‑1 (MQ=255) gCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGcc < 1:299973/217‑1 (MQ=255) gCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAATCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCATCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGGAATCCTGATCCCATTCTGTGTGa < 1:498253/251‑1 (MQ=255) gCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGCGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCtgtgtgt > 1:265133/1‑250 (MQ=255) tGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCCAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCCCGGCAAGCAGTTATTACCGTGGGTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATg > 1:469160/1‑251 (MQ=255) ggTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGTCCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGAt < 1:521139/251‑1 (MQ=255) ggTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGAt < 1:74774/251‑1 (MQ=255) gTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGAtt < 2:114459/251‑1 (MQ=255) caaccTTAGTGGAATGGGCTACAGCCCGGGAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGgcg < 1:483730/248‑1 (MQ=255) aGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCt > 1:120604/1‑250 (MQ=255) 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cAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGCGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCCGACACGGCAAGGCCAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCCGGGCGGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGGAATCCTGATCCCATTCTGTGTGCTGGAGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGGTGTCg > 2:337800/1‑251 (MQ=255) aGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGGGGTTGCTGGGGCTGTTTGCTGTCCGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGGGATGGCGATTGGCAATGGCCCGCTCATCCCTCTTGTTGTCGc > 2:230252/1‑251 (MQ=255) gCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGcc > 1:137086/1‑251 (MQ=255) 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CGACCTGCTACGTTCTAAAACCTATCGCGGCAACGTGCTGATATACGCAGCCTGTTCAGCCAGTTTTTTTGCATGGCTGACCGGTTCACCGTTCATCCTTAGTGAAATGGGCTACAGCCCGGCAGTTATTGGTTTAAGTTATGTCCCGCAAACTATCGCGTTTCTGATTGGTGGTTATGGCTGTCGCGCCGCGCTGCAGAAATGGCAAGGCAAGCAGTTATTACCGTGGTTGCTGGTGCTGTTTGCTGTCAGCGTCATTGCGACCTGGGCTGCGGGCTTCATTAGCCATGTGTCGCTGGTCGAAATCCTGATCCCATTCTGTGTGATGGCGATTGCCAATGGCGCGATCTACCCTATTGTTGTCGCC‑CAGGCGCTGCGTCCCTTCCCACACGCAACTGGTCGCGCCGCAGCGTTGCAGAACACTCTTCAACTGGGTCTGTGCTTCCTCGCAAGTCTGGTAGTTTCCTGGCTGATCAGTATCAGCACGCCATTGCTCAC > NC_000913/1740501‑1740998 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |