| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,077,568 | Δ1,832 bp | [cmtA]–cmtB | [cmtA], cmtB | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3077568 | 3079399 | 1832 | 42 [0] | [0] 42 | [cmtA]–cmtB | [cmtA],cmtB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3077567 | 0 (0.000) | 42 (0.580) | 40/490 | 0.4 | 100% | coding (1293/1389 nt) | cmtA | mannitol‑specific PTS enzyme IICB component CmtA |
| ? | NC_000913 | 3079400 = | 0 (0.000) | intergenic (‑70/+244) | cmtB/tktA | mannitol‑specific PTS enzyme IIA component CmtB/transketolase 1 | |||||
TAAACAGACGCTGTCAGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3077337‑3077567‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTTTACCCGAAATGCT > NC_000913/3079400‑3079641 TAAACAGACGCTGTCAGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGAGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCCGGGAAAC > 2:165054/1‑251 AAACAGACGCTGTCAGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGGTCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACC < 1:79401/251‑1 CGCTGTCAGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCTGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGCGCAGGGAAACCGGTGTTT < 2:476863/251‑1 GCTGTCAGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTT > 1:9077/1‑251 GTCAGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCTCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGTAGGGAAACCGGTGTTTTG < 2:477460/249‑1 cGAAACTACACTCACCATTTATTCTTTATCGGTAATTTCTGGCAGGTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCTATCAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCTGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGGCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCTGTGTTTTGAAAAC < 2:550924/250‑1 aaagTACACTCACCAGTAAGTCATTATCGGTCATTTTTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGCACATTCCGCTTGCCATAAATATCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTTCCTCTGTAAACAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGACTAAATAAAGTGTCGAGTTTTTGATTGCTAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCTATTGAGCAGGGAAACTGGTGTTTTGAAAACAG < 1:362113/247‑1 ATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTTAAAACAGTG < 2:163826/251‑1 TACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGAAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTAGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGA > 2:451548/1‑250 TAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGCCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGAAGGGAAAACGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCT > 2:334286/1‑251 CGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATT > 1:338430/1‑251 GCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGAT > 1:551426/1‑250 AAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTG < 2:145551/193‑1 AAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTG > 1:145551/1‑193 AATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAACTAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGAGGTTTATCCGTCACAAAGAAATTGAGCAGGGCAACCGGGGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGCGTTATAGATATAACAAC > 2:429195/1‑250 GACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGCGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGC > 1:228525/1‑250 CATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATA < 2:404235/251‑1 ATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGGTTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAACAAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATATAC‑TTTCGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATAT > 2:576252/1‑251 GCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTG > 2:35661/1‑250 GCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTCATCAGTGTTTATTTTCGGAGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCTTTTTTTGGATCGCCCATATAGTTATTTATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAATGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGC < 2:21482/250‑1 AGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATT > 1:24624/1‑251 TCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCA < 1:334286/250‑1 CATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCAT < 1:5092/250‑1 GTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATAGATTAAATACAGAGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTAACCACGAAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATAACGTGATGTATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTat > 1:21215/1‑249 CAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGAT < 1:444282/247‑1 CAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGAT > 2:444282/1‑247 GTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAA < 1:165054/251‑1 ATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCC > 1:273117/1‑251 TGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCT > 1:142525/1‑251 GTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTT > 2:328319/1‑251 GTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTG > 1:515175/1‑251 AATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTT > 2:16594/1‑251 tTTAAATAAAGGGTCGAGTTTTGGATCTCCAATATATTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAAACGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACCTTGAGTTATAGATATAACAAAAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCc > 2:105604/2‑250 GGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAAT < 1:149559/251‑1 CCAATATAGTTATTAAACAATATCAGTGGTTNATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAA < 2:294062/251‑1 CAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAtg < 1:482181/251‑3 ATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGT > 2:179632/1‑251 AGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCC > 1:221312/1‑251 TAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGC < 2:352232/250‑1 CAATATCAGTGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCT < 1:518449/251‑1 TGGTTTATCCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTTTACCCG > 1:392935/1‑251 CCGTCACAAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTTTACCCGAAATGCT < 2:581013/250‑1 TAAACAGACGCTGTCAGAAATTACACTCACCAGTAATTCATTATCGGTAATTTCTGGCAGTTCAAATACGCGCAGACGGACATCCCGCTTGCCATAAATAGCAGCAACTTTGGTTTTCATTTTTACCTCTGTAATCAGTGTTTATGTTCGGCGGTTAATTGATTAAATAAAGTGTCGAGTTTTGGATCGCCAATATAGTTATTAATCAATATCAGTGGTTTATCCGTCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3077337‑3077567‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aAAGCAATTGAGCAGGGAAACCGGTGTTTTGAAAACAGTGAATTATTAATTTCTTATATA‑ACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATCGTGATGCATATTACATAATTGATATTTATTGCATATAAATATTTGTGATCTACAACACGCCTTATCTATTGCTTGTCCGCAAACGGACATATCAAGGTAATAAAAAAGGTCGCCGAAGCGACCTTTTTACCCGAAATGCT > NC_000913/3079400‑3079641 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |