| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,056,374 | G→A | G45D (GGC→GAC) | fau → | putative 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,056,374 | 0 | G | A | 96.4% | 182.0 / NA | 57 | G45D (GGC→GAC) | fau | putative 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base A (31/23); minor base C (1/1); total (32/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGTTACAGCCTGCGGCGGCATCTCGGAGATTCCCTTCTTATCTGGCACCAGCCATGACGCAACTACCAGAACTCCCACTGACATTATCCCGACAAGAAATCCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACT‑CTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGTGCTGATCACACCGCTGGTCGCCTTTGATGAGT > NC_000913/3056134‑3056607 | ggttACAGCCTGCGGCGGCATCTCGGAGATTCCCTTCTTATCTGGCACCAGCCATGACGCAACTACCAGAACTCCCACTGACATTATCCCGACAAGAAATCCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGACGAACTCGac > 1:341047/1‑251 (MQ=255) aGCCTGCGGCGGCATCTCGGAGATTCCCTTCTTATCTGGCACCAGCCATGACGCAACTACCAGAACTCCCACTGACATTATCCCGACAAGAAATCCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGACGAACTCGACAccc > 1:448139/1‑249 (MQ=255) ggcggcATCTCGGAGATTCCCTTCTTATCTGGCACCAGCCATGACGCAACTACCAGAACTCCCACTGACATTATCCCGACAAGAAATCCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGGGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGACGAACTCGACACCCAGCCACTc > 1:94029/1‑250 (MQ=255) ggcATCTCGGATATTCCCTTCTTATCTTGCACCAGCCATGACGCACCTACCAGAACTCCAACTGACATTATCCCGACAAGAAATCCGCACAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTCTTCCTCTCTTTTGAGGACGAACTCGCCACCCGTCCACTCAt > 2:41787/1‑249 (MQ=255) 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aTACGGTAGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGACGAACTCGACACCCAGCCACTCATCGAACAACT‑CTGGCGCGCCGGTAAGCGAGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTACCCGGGCTGATCACACCGCTGGTc > 2:464583/1‑251 (MQ=255) aCGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGACGAACTCGACACCCCGCCACTCATAGAACAACT‑CTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTCGTGCCGGAAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGTGCTGATCACACCGCTGGTCGc > 2:327157/1‑251 (MQ=255) cGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGACGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACT‑CTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGTGCTGATCACACCGCTGGTCGCCttt < 1:39648/250‑1 (MQ=255) cGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGACGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACT‑CTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGTGCTGATCACACCGCTGGTCGCCTTtg > 1:196161/1‑251 (MQ=255) ttCCTCTCTTTTGTTGCCGCACTCGGCACCNAGCCCCTCATTGAACAACT‑CTTGCGCGCCTGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCGTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTTGCATCCTCAAAGCGAACTGGTGATGTACAGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAAGTGGATGTGCGTGGCGTGCTGCCCTTTTCGCGATTAGACGTGCTGATCACACCACTGGTCGCCTTTGATGAGt < 2:265500/250‑1 (MQ=255) | GGTTACAGCCTGCGGCGGCATCTCGGAGATTCCCTTCTTATCTGGCACCAGCCATGACGCAACTACCAGAACTCCCACTGACATTATCCCGACAAGAAATCCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACT‑CTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGAGCCAAAATTGGATGTGCGTGACGTGCTACCCCTTTCCCGATTAGACGTGCTGATCACACCGCTGGTCGCCTTTGATGAGT > NC_000913/3056134‑3056607 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |