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ccGCGTTATATGGCTGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGG‑GGTCTTCCTGTTCAAAATGTACGTTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGC‑TCTCTGCTAAACCAGAA‑AACCGC‑GCGAAAGTGGGCGG‑TATTATGATCTCCGCGTCGC‑TGACCT‑CGTTCCTGACCGGTATCCCCGAGCCGATCGAG‑TTCTCCTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGcc < 1:216801/250‑1 (MQ=255) cgcgTTATATGGCGGGTGACCCGGCTGCGGGGAAACTGTCTGG‑TGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGC‑ACTCTGCTAAAACAGAA‑AACCGC‑GGGAAAGTGGGCGG‑TATTATGATCTCCGCGGCGC‑TGAACT‑CGTTCCTGACCGGGATCAACGAGCCGATAGAG‑GTCTCCTTCATGTTCGTTGCGCCGGTCCTGTACATCATCCACGCGGTTCTGGCAGGCCTg > 1:409012/1‑251 (MQ=255) cgTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGG‑GGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGGCTGCCCGCTGCCGCAATTGCTATCTGGC‑ACTCTGCTAAACCAGAA‑AACCGC‑GCGAAAGTGGGCGG‑GATTATGATCTCCGCGGCGC‑TGACCT‑CGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGATCGCG‑TTCTCCTTCCTGTTCGTTGCGCCGCTCCTGTACATCATCCACCCGATTCTGGCAGGCCTGGc > 2:159384/1‑251 (MQ=255) 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cGACTGCGGGTAAACTGTCTGG‑TGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGC‑ACTCTGCTAAACCAGAA‑AACCGC‑GCGAAAGTGGGCGG‑TATTATGATCTCCGCGGCGC‑TGACCT‑CGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGATCGAG‑TTCTCCTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTAttctt < 1:130120/251‑1 (MQ=255) gACTGCGGGTAAACTGTCTGG‑TGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGC‑ACTCTGCTAAACCAGAA‑AACCGC‑GCGAACGTGGGCGG‑TATTATGATCTCCGCGGCGC‑TGACCT‑CGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGATCGAG‑TTCTCCTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTCttcttc > 2:528136/1‑251 (MQ=255) tGCGGGTAAACTGTCTGG‑TGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGC‑ACTCTGCTAAACCAGAC‑AACCGC‑GCGAAAGTGGGCGG‑TATTATGATCTCCGCGGCGC‑TGACCT‑CGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGATCGAG‑TTCTCCTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCNGGCCTGGCATTCCCAATCTGTAttactctgg > 2:260899/1‑244 (MQ=255) gCGGGTAAACTGTCTGG‑TGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGC‑ACTCTGCTAAACCAGAA‑AACCGC‑GCGAAAGTGGGCGG‑TATTATGATCTCCGCGGCGC‑TGACCT‑CGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGATCGAG‑TTCTCCTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTg < 1:213120/249‑1 (MQ=255) cGGGTAAACTGTCTGG‑TGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGC‑ACGCTGCTAAACCAGAA‑AACCGC‑GCGAAAGTGGGCGG‑TATTATGATCTCCGCGGCGC‑TGACCT‑CGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGATCGAG‑TTCTCCTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTgggg < 1:57745/251‑1 (MQ=255) aaCTGTCTGG‑TGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGC‑ACTCTGCTAAACCAGAA‑AACCGC‑GCGAAAGTGGGCGG‑TATTATGATCTCCGCGGCGC‑TGACCT‑CGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGATCGAG‑TTCTCCTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGt > 1:175333/1‑251 (MQ=255) tGTCTGG‑TAGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGACAGCTGCCGCACTTGCTATCTGGC‑ACTCTGATAAACCAGAA‑AACCGC‑GCGAAAGCGGGCGG‑TATTATGATCTCCGCGGCGC‑TGACAT‑CGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGATCGCG‑TTCTCCTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTTTATTCTTCTGGGGTTGTGTGAc > 2:398263/1‑251 (MQ=255) | CATTTGGCCGCCGATTGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTA‑CCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGG‑TGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGC‑ACTCTGCTAAACCAGAA‑AACCGC‑GCGAAAGTGGGCGG‑TATTATGATCTCCGCGGCGC‑TGACCT‑CGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGATCGAG‑TTCTCCTTCATGTTCGTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGAC > NC_000913/1158378‑1158867 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |