| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 890,913 | Δ18,382 bp | [ybjC]–[ltaE] | 21 genes [ybjC], nfsA, rimK, ybjN, potF, potG, potH, potI, ybjO, rlmC, artJ, artM, artQ, artI, artP, ybjP, ybjQ, amiD, ybjS, ybjT, [ltaE] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 890913 | 909294 | 18382 | 58 [0] | [0] 58 | [ybjC]–[ltaE] | [ybjC],nfsA,rimK,ybjN,potF,potG,potH,potI,ybjO,rlmC,artJ,artM,artQ,artI,artP,ybjP,ybjQ,amiD,ybjS,ybjT,[ltaE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 890912 | 0 (0.000) | 58 (0.890) | 51/488 | 0.1 | 100% | intergenic (‑159/‑1) | grxA/ybjC | reduced glutaredoxin 1/DUF1418 domain‑containing protein YbjC |
| ? | NC_000913 | 909295 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+36) | ltaE/poxB | low‑specificity L‑threonine aldolase/pyruvate oxidase | |||||
TGCGCGGCCTGACCGACAATATACTCTTCGCCGCGTTCGCAGTGACTGAGCAGAGCGACCAGGTTGGCCTGAGTGCCGGTAGGCAGAAAAATGGCGGCTTCTTTACCGGAAAGCTCTGCTGCGTAGTCCTGCAGAGCATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGGTATCACTGCGTAAATCAATCATGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAACACCGGACCGTCGATGGAGAAGGCGCGTTGCAGGGCTTCATCAACTTCAGACGC > NC_000913/909047‑909540 | acatcgcgttcattgctcaatttcgcagccagatcttttgcacgcacacagtaagggcaacccgaacgaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgagcacgctaaaatgtagtcgctgaaaggaggtttaacctgtttcattaattgctaaaagctataactgtcaagcacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcatagggaagcgtGGc < 2:78268‑M2/3‑1 (MQ=255) cgttcattgctcaatttcgcagccagatcttttgcacgcacacagtaagggcaacccgaacgaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTcc > 2:449319‑M2/243‑251 (MQ=255) ttcattgctcaatttctcagccagatcttttgcacgcacacagtaagggcaacccgaacgaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcaagctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGACCtt > 1:507769‑M2/241‑251 (MQ=255) tgctcaatttcacagccagatcttttgcacgcacacagtaagggcaacccaaacgaccaaaaatatcggtgtgcattatttctctcctcatagatttatgccagtaatgatcacgctaaattttattcgctgaacgtaggtttaacctgttgcattacttgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagtattagactgatgtctcactttgaagagagaagcgtAGCATTGccttattct > 2:441043‑M2/236‑249 (MQ=255) gctcaatttctcagccagatcttttgcacgcacacagtaagggcaacccgaacgaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTtattat < 2:124261‑M2/16‑1 (MQ=255) ctcaatttctcagccagatcttttgcacgcacacagtaagggcaaccagaacaagcaaaaataacggtttgcattctttctcacctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaacgtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaacgttttagactgaaggctcactttgaagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATg > 1:21347‑M2/234‑250 (MQ=255) ccagatcttttgcaagcacacagtaagggcaccccgaacgaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgctttaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCGTATTATGACGGGAAATGCCAc > 2:322107‑M2/221‑251 (MQ=255) gatcttttgcacgcacacagtaagggcaacccgaacgaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCt > 1:142764‑M2/218‑251 (MQ=255) cacgcacacagtaagggcaacccgaacgaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtatgcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaagcacaatacagtgaaaagttttagacggaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCtt < 1:57454‑M2/43‑1 (MQ=255) agcagacagtaagggcaaccctaacgaccaaaaagaacggtttgcagtatttctctcctcatagatttatgactgtaatgatcacgctaaaatgtatgcgcggaaaggagggttaacctggtgcagtaattgctaaaagctataactggtaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCtt < 2:178942‑M2/43‑1 (MQ=255) acacagtaagggcaacccgaacgaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGcc > 1:363046‑M2/204‑250 (MQ=255) gtaagggcaacccgaacgaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACTTTAGCCagtttt > 2:17104‑M2/199‑250 (MQ=255) aagggcaacccgaacgaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaattcagtgaaaagttttagactgaaggctcacttggcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAgtttgtt < 2:486330‑M2/55‑1 (MQ=255) aagggcaacccgaacgaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAgttcgtt > 1:397653‑M2/197‑251 (MQ=255) gggcaacccgaacgaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGtttt < 1:351063‑M2/57‑1 (MQ=255) gggcaacccgaacgaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCGTTTTACCTTAGCCAGTTTGtttt < 2:221748‑M2/57‑1 (MQ=255) gaccaaaaataacggtttgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagatggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCAAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATc < 1:495777‑M2/70‑1 (MQ=255) gaaaaaaaataaaggattgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATc > 1:459939‑M2/182‑251 (MQ=255) aacggattgcattatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTAATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCAc > 2:156280‑M2/172‑251 (MQ=255) attatttctctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCt > 1:491340‑M2/162‑251 (MQ=255) tctcctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTg > 1:219264‑M2/154‑251 (MQ=255) ctcatagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTgcgcg > 1:158499‑M2/150‑251 (MQ=255) catagatttatgcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagcgggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGTTCACTTCATAACATCGTCCGATGATGATTgcgcgc > 2:189641‑M2/148‑250 (MQ=255) gcctgtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAg < 1:493977‑M2/114‑1 (MQ=255) gtaatgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTg < 1:484782‑M2/118‑1 (MQ=255) atgatcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAAc > 1:23460‑M2/130‑251 (MQ=255) atcacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgccgagggaagagtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCAAGTTCGATCACTTCTTAACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCtt > 2:54918‑M2/127‑251 (MQ=255) cacgctaaaatgtattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGACCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCAAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCACGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAAACTTTg > 1:501372‑M2/125‑251 (MQ=255) tattcgctgaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGt > 2:420766‑M2/113‑251 (MQ=255) tctctgaaatgtggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatggagttaaaagtttgagaatgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTAGTATGACGGGAAATGCCACCATGTTTACCTTAGCCAGTCTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATAACCTCGTCCGCTTATGATTGCGCGTAGCATATACAGGCTGAAACCATTGGCCTGTTCTAGttt < 2:153642‑M2/141‑1 (MQ=255) gaaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCt < 2:474197‑M2/146‑1 (MQ=255) aaagtaggtttaacctgttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGc > 2:372328‑M2/104‑251 (MQ=255) aagtaggtttaacctggtgcattaattgataaaagctataactgttaaacaaaatacagtgaaaagttttagactgaaggatcactttgcagagggaagcgtGGAATGACATTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCAAATACAGGCTGAAACCTCTGGCCTGATAGAGTTTGATCTGCg > 2:47627‑M2/103‑251 (MQ=255) aggtttaaccttttgcattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTgg < 2:55361‑M2/153‑1 (MQ=255) cattaattgctaaaagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGCTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACtcttc > 2:126743‑M2/84‑251 (MQ=255) aagctataactgttaaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGaccacc > 1:438629‑M2/71‑251 (MQ=255) ataactgttaaacacaatgcagtgaaaagttttagactgaaggctcacgttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTTTTACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTTATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGTCTGTTCGTGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATc < 1:486482‑M2/186‑1 (MQ=255) ataactgttaaacacaatacagtgaaaaggtttagactgaaggctcactttgcagcgggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCAACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGCCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGACTGCAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTTCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATc > 1:486739‑M2/66‑251 (MQ=255) taaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAac > 1:1505‑M2/58‑250 (MQ=255) aaacacaatacagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAacac > 1:129118‑M2/57‑251 (MQ=255) aaacacaatacagggaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGAAGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAAGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGAGCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTTGAGACCACCACATCCCCCAacac > 2:287397‑M2/57‑251 (MQ=255) acagtgaaaagttttagactgaaggctccctttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCTCCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAACACCGGACCGt < 1:344837‑M2/203‑1 (MQ=255) cagtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGACACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAACACCGGACCGTCg > 1:482684‑M2/47‑251 (MQ=255) gtgaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATAACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGAGACCACCAAATCCACCAACACCGGACCGtcgct > 2:17681‑M2/45‑249 (MQ=255) gaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAACACCGGACCGt < 2:293682‑M2/203‑1 (MQ=255) gaaaagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTACTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAACACCGGACCGt > 1:293682‑M2/43‑245 (MQ=255) aagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCtgatg < 1:28455‑M2/94‑1 (MQ=255) aagttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTAGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCtgatg > 2:28455‑M2/40‑133 (MQ=255) agttttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAACACCGGACCGTCGATGgaga > 1:209450‑M2/39‑250 (MQ=255) tttagactgaatgctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAACACCGGACCGTCGATGGAGAAgg < 1:441043‑M2/215‑1 (MQ=255) tttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAACACCGGACCGTCGATGGAGAAGgc > 1:495850‑M2/36‑251 (MQ=255) gttagactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTCCCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCTCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTTTTCGAGTTTGAGCTGCGGTGTAATGGCTAATTCTTCTGTGGCGGCCACCACCGCGACCAACACCGGACCGTCGATGGAGAAgg < 2:497332‑M2/215‑1 (MQ=255) agactgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCNCCAACACCGGACCGTCGATGGAGaaggctcg > 2:272764‑M2/33‑248 (MQ=255) agactgaaggctcactttgcagagggaagcgcGGCATGTACTTATTATGACGGGAAATGCGACCCTCTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGCCCGCTGATGATTGCGCGCAGTATATACAGGCTGAAACCTTTGACCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGAGGAATGGCTAACTCGTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAACACCGGACCgtcgatggagacggtgcg > 1:236806‑M2/33‑244 (MQ=255) ctgaaggctcactttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAACACCGGACCGTCGATGGAGAAGGCGCGTTg > 2:164310‑M2/30‑251 (MQ=255) ttgcagagggaagcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAACCCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAACACCGGACCGTCGATGGAGAAGGCGCGTTGCAGGGCTtcat < 1:278177‑M2/233‑1 (MQ=255) gcagagggaagcgtGGCATGGCCTTATTATGNCGGTAAATGCCCCCCGTTTTACCTTAGCCATTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACAGCCACCAACACCGGACCGTCGATGGAGAAGGCGCGTTGCAGGGCTTCATCAAc < 2:237825‑M2/237‑1 (MQ=255) agcgtGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAACACCGGACCGTCGATGGAGAAGGCGCGTTGCATGGCTTCATCAACTTCAGACGc < 1:137190‑M2/246‑1 (MQ=255) | TGCGCGGCCTGACCGACAATATACTCTTCGCCGCGTTCGCAGTGACTGAGCAGAGCGACCAGGTTGGCCTGAGTGCCGGTAGGCAGAAAAATGGCGGCTTCTTTACCGGAAAGCTCTGCTGCGTAGTCCTGCAGAGCATTAACGGTAGGGTCGTCTCCGTAAACGTCGTCCCCAACCGGGGCGGCCATCATCGCTTCGAGCATGGCGCGGCTTGGTCGGGTAACGGTATCACTGCGTAAATCAATCATGGCATGTCCTTATTATGACGGGAAATGCCACCCTTTTTACCTTAGCCAGTTTGTTTTCGCCAGTTCGATCACTTCATCACCGCGTCCGCTGATGATTGCGCGCAGCATATACAGGCTGAAACCTTTGGCCTGTTCGAGTTTGATCTGCGGTGGAATGGCTAACTCTTCTTTGGCGACCACCACATCCACCAACACCGGACCGTCGATGGAGAAGGCGCGTTGCAGGGCTTCATCAACTTCAGACGC > NC_000913/909047‑909540 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |