Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 4,410,081 | 13624 bp→ATGC | yjfI–[ulaF] | 18 genes yjfI, yjfJ, yjfK, yjfL, yjfM, yjfC, aidB, yjfN, bsmA, yjfP, ulaR, ulaG, ulaA, ulaB, ulaC, ulaD, ulaE, [ulaF] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 4410081 | 4423704 | 13624 | 67 [0] | [1] 69 | yjfI–[ulaF] | yjfI,yjfJ,yjfK,yjfL,yjfM,yjfC,aidB,yjfN,bsmA,yjfP,ulaR,ulaG,ulaA,ulaB,ulaC,ulaD,ulaE,[ulaF] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4410080 | 0 (0.000) | 66 (1.030) +ATGC |
61/482 | 0.0 | 99.3% | intergenic (+74/‑53) | rlmB/yjfI | 23S rRNA 2'‑O‑ribose G2251 methyltransferase/DUF2170 domain‑containing protein YjfI |
? | NC_000913 | 4423705 = | 1 (0.020) | coding (6/687 nt) | ulaF | L‑ribulose‑5‑phosphate 4‑epimerase UlaF |
ATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAACAAAATATTGATGTAACAAATAGCGAGAACGCATTAATTATTAAAATGAATGATTATGGCGATTTGCAAATCAATATTCTTTTTACTTCCCGCCAAATGATTATCGAAACCTTTATTTGTCCGGTGAGTAGTATCAGCAATCCAGAT > NC_000913/4409833‑4410330 | aTGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatg < 1:451222‑M1/251‑4 (MQ=255) cGGACGCCTGGAGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTTAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaag < 2:168712‑M1/251‑9 (MQ=255) ggCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGTCTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCTGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTTCGTAatgcaaagctaaaac < 2:115822‑M1/249‑16 (MQ=255) aTGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttg < 1:530001‑M1/251‑28 (MQ=255) gggTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGGCTGCCTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtagttgaa < 2:286792‑M1/251‑30 (MQ=255) gggTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaa < 1:148726‑M1/251‑30 (MQ=255) aaggtgaaggtATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacat < 1:541963‑M1/251‑38 (MQ=255) gtATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgcc < 1:482100‑M1/251‑47 (MQ=255) ggtCGCCTGACTCGTGAACATTGCTATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTTGAAGCTTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaactgcaggtatttgaagccaacctggagctgccgcgct < 2:310076‑M1/250‑52 (MQ=255) gTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCGGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgcta < 1:343982‑M1/251‑53 (MQ=255) gCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgg < 2:358883‑M1/251‑56 (MQ=255) gCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgg > 2:154719‑M1/1‑196 (MQ=255) gACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctg > 1:38813‑M1/1‑192 (MQ=255) gTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgac > 1:519555‑M1/1‑187 (MQ=255) gTGAACATTGCGATGAGTTGAACAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgac < 1:375202‑M1/251‑65 (MQ=255) aCATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgaccttt < 1:369673‑M1/251‑69 (MQ=255) gATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggg < 2:402426‑M1/251‑76 (MQ=255) gATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGGTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggg > 1:298165‑M1/1‑176 (MQ=255) tGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacg < 2:328294‑M1/250‑82 (MQ=255) gCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgc < 1:497889‑M1/251‑89 (MQ=255) cATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgct > 1:124470‑M1/1‑162 (MQ=255) aTCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTACTTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgct > 2:341880‑M1/1‑161 (MQ=255) ggCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccg < 1:243998‑M1/250‑98 (MQ=255) ggCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAAAGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccccgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgacc < 1:296531‑M1/250‑97 (MQ=255) gTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggc < 2:145028‑M1/251‑109 (MQ=255) cttcCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggt > 1:237833‑M1/1‑139 (MQ=255) tcCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggt < 1:159599‑M1/249‑113 (MQ=255) ccTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAaggcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtg < 2:150244‑M1/251‑117 (MQ=255) tGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGGTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagcggccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtgg < 2:71995‑M1/247‑115 (MQ=255) tGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGCTAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtgg > 1:71995‑M1/1‑133 (MQ=255) gAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctt < 1:9515‑M1/199‑68 (MQ=255) gAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctt > 2:9515‑M1/1‑132 (MQ=255) tGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcagcgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcgg < 1:301287‑M1/250‑131 (MQ=255) tGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggc > 1:255745‑M1/1‑120 (MQ=255) cGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcc < 1:80461‑M1/251‑138 (MQ=255) ttGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacga > 1:540739‑M1/1‑108 (MQ=255) tGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaa > 1:126672‑M1/1‑107 (MQ=255) gCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaac < 1:148385‑M1/251‑146 (MQ=255) gCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctgggggtgatcaagcccagcggcggtgcctacggaac > 2:291928‑M1/1‑106 (MQ=255) aTTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatg < 1:154719‑M1/251‑150 (MQ=255) ggTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggcc < 1:72113‑M1/251‑159 (MQ=255) gcgcCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAAGTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccggt > 1:153860‑M1/1‑90 (MQ=255) cgcAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggt < 1:199395‑M1/198‑116 (MQ=255) cgcAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggt > 2:199395‑M1/1‑83 (MQ=255) tAATTTATCAGAAGTATGAAAAGCCTGCCATAGTGTGATGG‑TTTTGTTTTGTCTATAGCTGGTAAGAGAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgcttcgggctgttgccctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggtt < 1:280391‑M1/250‑174 (MQ=255) ttCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcagggatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggcgcaacgtcagcgctatcggccgcgaacgcgggctggtggggatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgctatggtggtggttgacat > 2:360089‑M1/1‑73 (MQ=255) cAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctattgaccg > 1:242252‑M1/1‑69 (MQ=255) cAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctattgaccg < 2:242252‑M1/166‑98 (MQ=255) aTGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagc < 2:425522‑M1/148‑87 (MQ=255) aTGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagc > 1:425522‑M1/1‑62 (MQ=255) aGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGGAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctgggggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtgggggaagggg > 1:101237‑M1/1‑48 (MQ=255) aTTTGGATGGTTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagt > 1:405162‑M1/1‑47 (MQ=255) gATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaagggggtggaaggggagtatcgcc > 1:443967‑M1/1‑41 (MQ=255) ttGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaagggggtggaaggggagtatcgcccatcttccgac > 1:290267‑M1/1‑29 (MQ=255) gTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggatgatatgagcggcaaggtggaggaaggggaggatcgcccatcttccgacact > 2:411883‑M1/1‑27 (MQ=255) cttccgatctgtaagataattACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatcttccgacactg > 1:272735‑M1/11‑26 (MQ=255) ataGCTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatcttccgacactgcg > 1:25145‑M1/1‑23 (MQ=255) cTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatcttccgacactgcgacgc > 1:199400‑M1/1‑19 (MQ=255) cTGGTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatcttccgacactgcgacgc > 1:250987‑M1/1‑19 (MQ=255) gTAAGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatcttccgacactgcgacgcatct > 1:361454‑M1/1‑16 (MQ=255) aaGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatcttccgacactgcgacgcatctc < 1:521888‑M1/250‑237 (MQ=255) aGATAATTACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatcttccgacactgcgacgcatctcg > 1:463905‑M1/1‑13 (MQ=255) tACGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagcccacatggagctgccgcgctacgggatggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctgttggtgatcaagcccatcggacttgcctacgaaaccatgaaagcggccgctatggtggtggttgatatgagcggcaaggtagtgggaggggagtatcgtacatcttccgacaccccgacgcctctcgacccatac > 2:133936‑M1/1‑6 (MQ=255) aCGTAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagagctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggatgatatgagcggcaaggtgggggaaggggagtagcgcccatcttcagacacggcgacgcatctcgaactctacc > 1:393297‑M1/1‑5 (MQ=255) tAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaaggtggtggaaggggagtatcgcccatcttccgacactgcgacgcatctcgaactctaccgtc > 1:343075‑M1/1‑2 (MQ=255) tAatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgctacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgttgcctacgaaaccatgaaagcggccgatatggtggtggttgatatgagcggcaagggggtggaaggggagtatcgcccatcttcngacactgcgacgcatctcgaactctaccgtc > 2:247420‑M1/1‑2 (MQ=255) aatgcaaagctaaaacagcaggtatttgaagccaacatggagctgccgcgcaacgggctggtgacctttacctggggcaacgtcagcgctatcgaccgcgaacgcgggctggtggtgatcaagcccagcggcgtcgcctacgacaccatgaaaacggccgatatgggggtggctgatatgagcggcaaggtggggggaggggagcaacgcccatcttccggcactgcgccgcatcgcgaactctaccggcg > 2:517681‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATGACCGGACGCCTGGCGCTGGTGATGGGTGCGGAAGGTGAAGGTATGCGTCGCCTGACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAACAAAATATTGATGTAACAAATAGCGAGAACGCATTAATTATTAAAATGAATGATTATGGCGATTTGCAAATCAATATTCTTTTTACTTCCCGCCAAATGATTATCGAAACCTTTATTTGTCCGGTGAGTAGTATCAGCAATCCAGAT > NC_000913/4409833‑4410330 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |