| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,855,159 | Δ11,170 bp | [yidF]–yidE | [yidF], yidG, yidH, yidI, yidJ, yidK, yidL, glvB, glvC, yidP, yidE | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3855159 | 3866328 | 11170 | 83 [0] | [0] 83 | [yidF]–yidE | [yidF],yidG,yidH,yidI,yidJ,yidK,yidL,glvB,glvC,yidP,yidE |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3855158 | 0 (0.000) | 83 (1.280) | 71/488 | 0.0 | 100% | coding (454/498 nt) | yidF | uncharacterized protein YidF |
| ? | NC_000913 | 3866329 = | 0 (0.000) | intergenic (‑56/+140) | yidE/ibpB | putative transport protein YidE/small heat shock protein IbpB | |||||
CCTGAATAACATGCAGCATATCGCTACTTAATGTCATCCCCGCCTGAGAAACAAAATGGCCGACGATGATCCCACCAAACAGCACGCCGCCAATACCTAATCCTATGCCGCGAAATTTGACGTTGCCGATAAACAAACCGACGACTGCCACCAAAGCCAGAATACTGACCGTTAATGCTATATCACTCATCGTCCATTTCTCTTGAGATAACATTTTAATTGCTACGGATTATGGCTGAATCGGTGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAATTTAACGCATTGTTGAGTAAGTAAGACAAAAAAAGCCCCACCAGAATGGC‑GGGGCAAAGAGAATAGCTAGTTAGCTATTTAACGCGGGACGTTCGCTGATAGCGATACGCTGCGCTGCGATGGGTTCAGGCTCATTACGAATTAAATCAATATGCAGTAAACCGTTTACGAA > NC_000913/3866084‑3866570 | ggcgggcacgtctggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCa < 1:258915‑M2/6‑1 (MQ=255) gcacggctggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGAttt < 2:214291‑M2/11‑1 (MQ=255) gcgcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggtgccggcgggcgggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaatccggtcagggcagcctgggggtgttgatgacctgaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcagggtcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGTAGCAGATTTGCCTtat < 2:366737‑M2/18‑1 (MQ=255) ggcgcgctggtcggcggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgccgcggatgtcgcataaggggccgcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGCTTTGCCTtat > 2:134725‑M2/233‑250 (MQ=255) 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cggtctgcaaaacattggttccggcgtgctggcggcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCAc < 1:82191‑M2/33‑1 (MQ=255) gcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaccgacgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGAACATTATAACGGgaac > 1:390966‑M2/213‑250 (MQ=255) gcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGaaa < 1:194420‑M2/39‑1 (MQ=255) gcaaaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGa < 1:243729‑M2/37‑1 (MQ=255) aaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGa > 1:505728‑M2/210‑250 (MQ=255) aaacattggttccggcgtgctggcgtcgctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcaacaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgaggctgcttGACGCAGCTTTGCCTTTTAGAGCACATTCTCACGGGTAAGa > 1:327749‑M2/210‑250 (MQ=255) 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gctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatggtattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGaa < 1:536155‑M2/69‑1 (MQ=255) gctctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTTCCGAAATATCTTAAACAGTCGaa < 1:250227‑M2/69‑1 (MQ=255) tctctgcgatgttgccgcaaaccggtcagggcagcctggggttgttgatgaccttaatgggattgttgatcgtgctgtgctggctgccgctggcgacgcggatgtcgcatcaggggcagcccgtttaagcgcacgtcaccgcagcatcgtcatcagctccatgggagaacgatgctgcttGAAGCAGATTTGCCTTATAGCGCACATTATCACGGGAAAGAACGTGCCGAAATATCTTAAACAGTCGAAAt > 1:9723‑M2/181‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |