| New junction evidence | |||||||||||
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AGCGGCAGCTGCGGCAGCAAAAGTGTTCAGATCGGCAACAGCAACAAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCATATATTATCACTTACTGGCGGCTCATACTGAGCTGGTTAATGCTGTGCACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTG‑CACTAAAAAAGCGACTCACATTGTTCCGTTATAATGCCTGAAGTAGATCACAGAATATATCTTCAGGGATCGCATATCTATTAAGTTACTCACTCTTTTCTATTTATGACATGCGCGTGTTTGTATAAATGTAAATGTGAGTCCTTGTTCCACTCTCGTGCAGCATCGCTGGTCATACGCGAACACGTACCAACAGCAATGGTGAGGCGGCATCAAGAGCAGGGATCCGTCATTTATCCGAGCATTTTACCCCAAAAA > NC_000913/2406540‑2407033 | aGCGGCAGCTGCGGCAGCAAAAGTGTTCAGATCGGCAACAGCAACAAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCATATATTATCACTTACTGGCGGCTCATACTGAGCTGGTTAATGCTGTGCACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTG‑CACTAAAAAAGCggt < 1:107822‑M2/251‑4 (MQ=255) 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cagcaAAAGTGTTCAGATCGGCAACAGCAACAAATGTTCTCAGCAGATCGAGGTCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCATATATTATCACTTACTGGCGGCTCATACTGAGCTGGTTAATGCTGTGCACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTG‑CACTAAAAAAGCggtaatgactccaactt > 1:484750‑M2/1‑234 (MQ=255) aaaaGTGTTCAGATCGGCAACAGCAACAAATGTTCTCAGCAGATCGAGGCCGAGGTTAATTATCGGACGATTTGCACTTATCATATATTATCACTTACTGGCGGCTCATACTGAGCTGGTTAATGCTGTGCACACACATACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCATCCCCGGCAGTTTCCTCCGGAACCCGGACGAAAGGAAAAATGCATATGAGTTG‑CACTAAAAAAGCggtaatgactcaaacttattg < 1:234899‑M2/251‑22 (MQ=255) aaaGTGGTCAGATAGGCAACAGCAACAAATGTTCGCAACAGAACGAGGTCGAGGTTAATTAGCGGACGATTTGCACTTATCATATATTATCACTTACTGGCGGCTCATACTGAGCTGGGTAATACTTTGCACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGACCCCGGACGAAAGGAAAAATGCATATGAGTTG‑CACTAAAAAAGCggtcatacctccaaattattg < 2:93308‑M2/250‑22 (MQ=255) 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aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTG‑CACTAATAAAGCgttaatgacccctacctattgatagtgtgttatgttcagataatgcccgatgattttgtcatgcagcgctaccgatcttgagaacgacagcgctttctgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagatttaggttatgctgctcaattcgctgcgtatatcgctggctgattacttgccgctttcccttcaggcgggattcatacag > 2:42161‑M2/1‑44 (MQ=255) cccGGACGAAAGGAAAAAGGCATATGAGTTG‑NACTAAAAAAGCgggattgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgtctttgtcatgcagctcctccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgtgattcatacagc > 2:234899‑M2/1‑43 (MQ=255) gagcgaaAGTACAAATGGATATGATTTGTCA‑TAAAAAAGAtgtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtgcagataatgcccgatgcctttgtcatgcagctacccggattttgagaacgacagcgtcttccgtcccagccttgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattaagtgcagctgtccctgcaggcgggattcatacagcggc > 2:56074‑M2/4‑40 (MQ=255) aaGTAAAAATGCATATGAGTTG‑CACTAAAAAAGCggtaatgactccaacttattgatagtgtttcatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgcttacgtgcagctttcccttcaggcgggattcataccgcggccagccc < 2:477695‑M2/251‑218 (MQ=255) aTGCATATGAGTTG‑CACTAAAAAAGCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcat < 1:465013‑M2/251‑226 (MQ=255) gTTG‑CACTAAAAAAGCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcacc < 1:431804‑M2/251‑236 (MQ=255) tG‑CACTAAAAAAGCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccac < 2:36203‑M2/251‑238 (MQ=255) g‑CACTAAAAAAGCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacg < 1:290169‑M2/251‑239 (MQ=255) g‑CACTAAAAAAGCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacg < 1:309172‑M2/251‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |