Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_000913 | 4,060,444 | Δ19,761 bp | yihL–yiiF | 19 genes yihL, yihM, yihN, ompL, yihO, yihP, yihQ, yihR, yihS, yihT, yihU, yihV, csqR, yihX, yihY, dtd, fabY, yiiE, yiiF |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 4060444 | 4080204 | 19761 | 70 [0] | [0] 72 | yihL–yiiF | yihL,yihM,yihN,ompL,yihO,yihP,yihQ,yihR,yihS,yihT,yihU,yihV,csqR,yihX,yihY,dtd,fabY,yiiE,yiiF |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4060443 | 0 (0.000) | 70 (1.080) | 62/488 | 0.0 | 100% | intergenic (+213/‑4) | bipA/yihL | 50S ribosomal subunit assembly factor BipA/putative DNA‑binding transcriptional regulator YihL |
? | NC_000913 | 4080205 = | 0 (0.000) | intergenic (+236/+94) | yiiF/fdhE | protein YiiF/formate dehydrogenase formation protein |
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CGTTAATTGCTTGCTTTTTTGGCGGAAGTGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCAGTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCG < 2:278069/251‑1 GTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCGGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGGCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTACAGTACCAGAGAGGCGA < 2:286818/251‑1 ttCTTTCTGTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGGTTAAACCAAAAGGATGAATCTTGCTGTGGTAACGCGGAATACGAGAGACGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGTCGACCTGCGCCACCCGGCAAACGTCAGATATTACTCTCATTCCCCCGGAAACAGGAACGGGGTGATGGAACTGCGGGCATAATCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCA < 2:514827/248‑1 CTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAATGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCAGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCCCCCGGAAACAGGAACGGGGTGATGGAACTGGGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGCGGTCATCTGCTt > 2:372290/1‑250 CTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGCACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCCTCTGCT > 2:20405/1‑250 TTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGATGTCATCTGCT < 1:395033/248‑1 TTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACG > 2:518353/1‑251 TTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCT < 1:434463/248‑1 TTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAACAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCCCACCCTATGAGCTGTCATCCGGGCGACCTGAGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCT > 2:207836/1‑251 TTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGC < 1:330251/250‑1 TTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGACATCTGCTACGGCT > 2:94166/1‑251 TGGCGTAAGCGTAAGTTGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCATGAGGCGGTAACGCGGAATACGAAAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGAGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGCTGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTAGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTT > 2:72865/1‑251 GTAAGAGTAAGATGCTTCATCTGGTTTATACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGGCTCACCCTATGAGTTGTAATCCGGGCTACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGTATAGCCTTCTGGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGAT < 1:211046/251‑1 TAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATCGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGGGGCGAGGCCATCTGCTACGTCTTCGATT > 2:124717/1‑251 AAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGAGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGCCAGAGATTACTCTACTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGTGCCTAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGAGTCCAGTACAAGAGAGGCGAGGTCATCTGCGACGGtctcgatct > 2:231259/1‑242 GCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGATTTTT > 1:481597/1‑251 CGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGATTTTTG > 1:52071/1‑251 AAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGATTTTTGGAT > 1:426570/1‑251 ATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGATTTTTGGATCTT > 2:372887/1‑251 TTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGGCGTCACACCCTATGAGCTGTAAGCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGTTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCT < 2:300525/171‑1 TTTAAACCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGACGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCT > 1:300525/1‑171 AACCAAAAGGCTTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGCGGTCATCTGCTACGGCTTCGATTTTTGGATCTTTTTCCTGATAGAGAATT > 2:469365/1‑251 CCAAAAGGATTAAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGATTTTTGGATCTTTTTCCTGATAGAGACTTTT > 1:507164/1‑251 AAAAGGATTAAGCTTGAGGAGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGATTTTTGGATCTTTTTCCTGATAGAGAATTTTC > 2:317709/1‑250 AAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTGTGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGACAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGATTTTTGGCTCNTTTTCCTGATAGAGAATTTTCAGGTAAGTGT > 2:242672/1‑251 AAGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGGGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGATTTTTGGATCTTTTTCCTGATAGAGAATTTTCAGGTAAGTGg > 2:393117/1‑250 CGTCGCCGCGCCAACCGCGCACCGAAAGACGATTAATTTCGTTTTTTAGTCATAAAAAACCTGCC‑AGCGATGGCAGGTTTTTTTTT‑GCCTGTCGTGAGCGCACACCAATGCGAGTATCTCCCTTATAAGTCTGTGGTTACGTCAATAGAGAGCTTTGTCACAATTATCTGCAAAGTCATACGCCGTTAATTGCTTTCTTTTTTGGCGTAAGCGTAAGATGCTTCATCTGGTTTAAACCAAAAGGATTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4060195‑4060443 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGCTTGAGGTGGTAACGCGGAATACGAGAGATGGTGTCGTCACACCCTATGAGCTGTAATCCGGGCGACCTGCGCCACCCGGAAAACGTCAGAGATTACTCTCCTTCACCCGGAAACAGGAACGGGTTGATGGAACTGCGGGCATAGCCTTCTTGCTCCATTCGTGCGTCCAGTACCAGAGAGGCGAGGTCATCTGCTACGGCTTCGATTTTTGGATCTTTTTCCTGATAGAGAATTTTCAGGTAAGTGT > NC_000913/4080205‑4080453 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |