| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,139,288 | C→T | D141N (GAC→AAC) | fsaB ← | fructose‑6‑phosphate aldolase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,139,288 | 0 | C | T | 97.3% | 250.0 / NA | 73 | D141N (GAC→AAC) | fsaB | fructose‑6‑phosphate aldolase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (39/32); minor base G (0/2); total (39/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCTTTAGAGATGAGTAGTGCCAAATGCGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCCCTGCGCGTCGCGGCTCATGGTCTG > NC_000913/4139043‑4139534 | ccTTTAGAGATGAGTAGTGCCAAATGCGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGc > 1:581462/1‑251 (MQ=255) gAGTAGTGCCAAATGCGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGATTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCt > 1:479131/1‑251 (MQ=255) tGCCAAATGCGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGGTTCCGCCCTGGGCATCTACGCgg > 1:84138/1‑251 (MQ=255) aaaTGCGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGAGGTTa > 1:423049/1‑250 (MQ=255) cGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATAc > 1:461069/1‑251 (MQ=255) ggCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCCGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTGAACATACg > 2:255080/1‑251 (MQ=255) cAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAAc > 1:245309/1‑251 (MQ=255) cAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGGGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAAc > 2:615945/1‑251 (MQ=255) gTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACg > 1:623242/1‑250 (MQ=255) gtTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTAtttt > 1:293385/1‑251 (MQ=255) aCTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCt < 1:225162/251‑1 (MQ=255) aCTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGAAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTGTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGccccg < 2:40568/251‑2 (MQ=255) cTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTg > 1:448877/1‑251 (MQ=255) ataGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGc < 1:717848/251‑1 (MQ=255) taGCTGACTCTACAGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCg > 1:155601/1‑251 (MQ=255) gACTCGACCGCAGGGGTGTTGATCGTTTGTTGCGCAACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCCGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGTCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCt < 1:716692/249‑1 (MQ=255) aCCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTTGGCATCTACGCGGTTAACATGCGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAAccc < 1:553764/251‑1 (MQ=255) aCCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAAccc > 1:22648/1‑251 (MQ=255) ccGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCt > 1:634884/1‑251 (MQ=255) aGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTtgtg > 2:41578/1‑251 (MQ=255) aGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTtgtg > 2:310754/1‑251 (MQ=255) aGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTtgtg > 1:227864/1‑251 (MQ=255) ggTGTTGAGCATTTGTTGCTCTACATCTAAGGGCAGGGTTATGTATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGTCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCAGCTCCGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTgcgg < 1:359516/251‑1 (MQ=255) ggTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTgcgg < 1:597125/251‑1 (MQ=255) ggTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGCGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCNCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTgcgg > 2:335755/1‑251 (MQ=255) gtgtTGTGCATTTTGTGCTCTACATCTAAGGGCGGGGTGATGGTTTCACATCCTGCAAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTgcggc < 2:2161/251‑1 (MQ=255) aGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCtat > 2:277934/1‑250 (MQ=255) cATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCtatata < 1:142929/251‑1 (MQ=255) ttgCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATAcagc > 2:446081/1‑249 (MQ=255) tAAGGGCGGGGTGAGGGATTCCCACCCGGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTgta < 2:293385/250‑1 (MQ=255) gggCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTgtagta > 1:535522/1‑250 (MQ=255) ggATGGATTCCCACCCTGCCAGTACACAGTCCTGCGCCTGATGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATTCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTATGCGGTTAACATACTGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCCTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCctct < 2:542747/250‑1 (MQ=255) gATGGATTCCCATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCctct < 1:519546/250‑1 (MQ=255) ggATTCACATCTTGCCAGTAAACAGACCAGCGCCTGCCGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCAAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTACGCCCTGGGCAACTACGCGGTTAACATACGGAGAAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCGTGTGCGGCGCCATCTACAGCAGTCCCACGTGTAGTAATACTCTCtattt > 2:593717/1‑251 (MQ=255) gATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCtttttt < 1:130373/251‑1 (MQ=255) cacaTCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAg < 1:530329/250‑1 (MQ=255) acggCCAGTAAACAGTCAAGCGCCTGACGGGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGAACAATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGGTTGCAGCTCCTGAACAGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCACCGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTGTCAGTAttt < 2:125572/247‑1 (MQ=255) aGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATtgc > 1:201427/1‑251 (MQ=255) gTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATtgct < 1:101437/251‑1 (MQ=255) gTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATtgct > 1:12617/1‑251 (MQ=255) gTAAAAAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAATGCTGGCTGCCAGCACCTTGCTTTCTGTCGCGTGCATTTCTATCAGCGCTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATCCGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATtgct < 2:481296/251‑1 (MQ=255) accAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTTCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCCCCTGAACCGTACGAAGGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGcc < 2:185775/249‑1 (MQ=255) aCAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGcc > 1:82049/1‑250 (MQ=255) aGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTACCAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTAGGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGATAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTCATAACCATTGTGCGGCGCTATATACAGCAGGGCCAAGTGTTGTAAGACNCTCTTTTTTTAGAAtttctattgcagcc > 2:348101/1‑237 (MQ=255) gcggcgTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCAcc < 1:444704/251‑1 (MQ=255) cggcgTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCCAGGGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCg > 2:388564/1‑251 (MQ=255) gcgTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCggg < 1:105585/251‑1 (MQ=255) gTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTGTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGCCCTTCGGAAGTCACCGGGAt < 2:73945/251‑1 (MQ=255) aaaGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTc > 1:652600/1‑250 (MQ=255) aaGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTcac < 1:41578/251‑1 (MQ=255) ctggctgCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTcaccac > 1:140332/1‑251 (MQ=255) gCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATAc < 1:255080/250‑1 (MQ=255) cctGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCGGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCTGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAg < 2:519988/249‑1 (MQ=255) cATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAAt > 1:200916/1‑249 (MQ=255) tGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCg > 2:607344/1‑251 (MQ=255) ggCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCgcgc > 1:383621/1‑249 (MQ=255) gTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGcgct > 1:164494/1‑251 (MQ=255) aTTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGcgcttcgc < 1:351819/251‑1 (MQ=255) tAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATTCCGTTTCCGCCCTGGGCATCAACGAGAATAACATAAGGAGCAAAGTATTTTGCCCCTGCCAGTGAGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATAAAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTTTTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAATCACCGGGCTTTTCACCACAATACCCGGAATAACATAGCGCAGGCGCCTCGcttctt > 2:697636/1‑251 (MQ=255) aCAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTcc < 1:615945/251‑1 (MQ=255) aCAGCGTGTGCAGCTCATGTACCGTACGTATGCCGTGTCCGCCCTGGGCTTCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTGTGCCCCTGCCAGTGCTGCTAATACCCCTTGTTCGGCGCTATATTCAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTGTCAGTATTTTAATTGCGGCCAGACCTTCGGAAGTCGCCGGTATTTTCACCACAATCCCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTcc < 2:244037/251‑1 (MQ=255) gCGTTTGCCGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCGTCGCTTCTGccacc < 2:227864/251‑1 (MQ=255) gCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTccacc < 2:383621/251‑1 (MQ=255) gTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGAGGCGATATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGAACTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCAt > 1:322684/1‑251 (MQ=255) tGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATcc < 1:31857/250‑1 (MQ=255) aGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATccctgc > 1:694359/1‑248 (MQ=255) cggAACCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCTCCATCCC‑TGCGCGTc < 2:82049/249‑1 (MQ=255) aaCCGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCC‑TGCGCGTcgcg > 2:122755/1‑251 (MQ=255) ccGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCC‑TGCGCGTCGCGGc < 2:484858/251‑1 (MQ=255) ccGTACGAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCC‑TGCGCGTCGCGGc < 2:623242/251‑1 (MQ=255) gAATGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCC‑TGCGCGTCGCGGCTCCTgg > 2:674851/1‑251 (MQ=255) aaTGCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCC‑TGCGCGTCGCGGCTCATGGt > 1:43529/1‑251 (MQ=255) gCCGTTTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCC‑TGCGCGTCGCGGCTCATGGTCTg < 1:78024/251‑1 (MQ=255) | CCTTTAGAGATGAGTAGTGCCAAATGCGGCATTCCAGTCGTGTTCGAACTTCTCTATAGCTGACTCTACCGCAGGGGTGTTGAGCATTTGTTGCGCTACATCTAAGGGCAGGGTGATGGATTCACATCCTGCCAGTAAACAGTCCAGCGCCTGACGCGGCGTTTTAAAGCTGGCTGCCAGCACCATGCTTTCTGGCGCGTGCATTTCTAACAGCGTTTGCAGCTCCTGAACCGTACGAATGCCGTCTCCGCCCTGGGCATCTACGCGGTTAACATACGGAGCAACGTATTTTGCCCCTGCCAGTGCGGCTAATAACCCTTGTGCGGCGCTATATACAGCAGTGCCAAGTGTAGTAATACCCTCTTTTTTCAGTATTTTAATTGCTGCCAGACCTTCGGAAGTCACCGGGATTTTCACCACAATACCCGGAATAGCGTCGCGCAGGCGCTTCGCTTCTTCCACCATCCCCTGCGCGTCGCGGCTCATGGTCTG > NC_000913/4139043‑4139534 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |