Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,876,015 | 0 | A | G | 26.2% | 179.6 / 12.8 | 83 | I115V (ATT→GTT) | nimT | 2‑nitroimidazole exporter |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.10e-11 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACTGGATACGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGG‑TGGG‑ATTG‑CATTAGGCAA‑TGTCTTACTGCC‑AGGATTAATTAAACGCG‑ATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCG‑CATATT‑CCCTGACAA‑TGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGC‑TTTGAAC‑GG‑TTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAGTGGCGAAGTCAACAACATGCAA > NC_000913/1875780‑1876255 | aCTGGATACGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGG‑GGGG‑GTTT‑CATTTAGCAA‑Tg > 1:601056/1‑251 (MQ=255) 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ACTGGATACGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGG‑TGGG‑ATTG‑CATTAGGCAA‑TGTCTTACTGCC‑AGGATTAATTAAACGCG‑ATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCG‑CATATT‑CCCTGACAA‑TGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGGC‑TTTGAAC‑GG‑TTTTGGCTGGCAAGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAGTGGCGAAGTCAACAACATGCAA > NC_000913/1875780‑1876255 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |