| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,466,540 | 9636 bp→ACCC | intS–[ypdJ] | 15 genes intS, yfdG, yfdH, yfdI, yodE, yfdK, yfdM, yfdN, yfdO, yfdP, yfdQ, yfdR, yfdS, [yfdT], [ypdJ] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2466540 | 2476175 | 9636 | 60 [0] | [0] 59 | intS–[ypdJ] | intS,yfdG,yfdH,yfdI,yodE,yfdK,yfdM,yfdN,yfdO,yfdP,yfdQ,yfdR,yfdS,[yfdT],[ypdJ] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2466539 | 0 (0.000) | 58 (0.660) +ACCC |
53/484 | 0.3 | 100% | intergenic (+156/‑6) | argW/intS | tRNA‑Arg/prophage CPS‑53 integrase |
| ? | NC_000913 | 2476176 = | 0 (0.000) | coding (304/306 nt) coding (83/141 nt) |
yfdT ypdJ |
protein YfdT putative uncharacterized protein YpdJ |
|||||
CTAGAGGTTCGAGACGATATTGAGCGCCGTGCTTATGAAATCGCACTCGTATCTCTGGAAGTAGAGCCAGATGAACGCGAAGCCTATGAATTATTCATGGAAAAGCGTTTCGGTGACTTAGTAGATCGTCGGAGAGCAAAAAACGGCGATAACGAATACATGGCATGGGATATGACTCTCGGTTGGATCATCTGGCAGCAACGAGCTGGTATCCATTTTTCAACAATGTCACAACAAGAGGTGAAATAATAGAGCCATACAGCCTCACACTCGATGAGGCCTGTCAGTTTCTTAAAATATCCTGATCTACCATCGCCGTCATAGAGCGTATTTTTATTACCTGATTTGCAGGTTCGATTCCCTATTCGGAGATAGCACTCATGCAACACGAACTACAGCCTGATTCACTGGTTGATTTGAAATTCATCATGGCTGATACTGGCTTTGGTAAAACCTTCATCTATGACCGGATTAAGTCAGGCGACCTGC > NC_000913/2475930‑2476418 | catgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatttatcagttcgctcccatccgtaccagtccgcaaaatcccctgaatatcaagcattccgtagatttacagttcgtcatggttcgcttcagatcgttgacagccgcactccatgacgggtaaaaagtggataaaataattttacccaccggattttacccTAAt < 1:198247‑M2/4‑1 (MQ=255)catgccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatttatcagttcgctcccatccgtaccagtccgcaaaatcccctgaatatcaagcattccgtagatttacagttcgtcatggttcgcttcagatcgttgacagccgcactccatgaaggataaaaagtggataaaataattttacccaccggattttacccTAAt > 1:475589‑M2/247‑250 (MQ=255) gccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatttatcagttcgctcccatccgtaccagtccgcaaaatcccctgaatatcaagcattccgtagatttacagttcgtcatggttcgcttcagatcgttgacagccgcactccatgacgggtaaaaagtggctaaaataattttacccaccggattttacccTAATag > 1:125842‑M2/244‑249 (MQ=255) gccgcattgtcctcttagttaaatggatataacgagcccctcctaagggctaattgcaggttcgattcctgcaggggacaccatttatcagttcgctcccatccgtaccagtccgcaaaatcccctgaatatcaagcattccgtagatttacagttcgtcatggttcgcttcagatcgttgacagccgcactccatgacgggtaaaaagtggataaaataattttacccaccggattttacccTAATaga < 1:456097‑M2/7‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aataattttacccaccggattttacccTAATAGAGCCATACAGCCTCACACTCGATGAGGCCTGTCAGTTTCTTAAAATATCCTGATCTACCATCGCCGTCATAGAGCGTATTTTTATTACCTGATTTGCAGGTTCGATTCCCTATTCGGAGATAGCACTCATGCAACACGAACTACAGCCTGATTCACTGGTTGATTTGAAATTCATCATGGc < 2:155842‑M2/187‑1 (MQ=255) aataattttacccaccggattttacccTAATAGAGCCATACAGCCTCACACTCGATGAGGCCTGTCAGTTTCTTAAAATATCCTGATCTACCATCGCCGTCATAGAGCGTATTTTTATTACCTGATTTGCAGGTTCGATTCCCTATTCGGAGATAGCACTCATGCAACACGAACTACAGCCTGATTCACTGGTTGATTTGAAATTCATCATGGc > 1:155842‑M2/28‑214 (MQ=255) ccctccggattttacccTAATAGAGCCATCCAGCCTCACACTCGATGAGGCCTGTCAGTTTCTTAAAATATCCTGATCTACCATCGCCGTCATAGAGCGTATTTTTATTACCTGATTTGCAGGTTCGATTCCCTATTCGGAGATAGCACTCATGCAACACGAACTACAGCCTGATTCACTGGTTGATTTGAAATTCATCATGGCTGATACTGGCTTTGGTAAAACCTTCATCTATGACCGGATTAAGTCAg < 2:568855‑M2/234‑1 (MQ=255) 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CTAGAGGTTCGAGACGATATTGAGCGCCGTGCTTATGAAATCGCACTCGTATCTCTGGAAGTAGAGCCAGATGAACGCGAAGCCTATGAATTATTCATGGAAAAGCGTTTCGGTGACTTAGTAGATCGTCGGAGAGCAAAAAACGGCGATAACGAATACATGGCATGGGATATGACTCTCGGTTGGATCATCTGGCAGCAACGAGCTGGTATCCATTTTTCAACAATGTCACAACAAGAGGTGAAATAATAGAGCCATACAGCCTCACACTCGATGAGGCCTGTCAGTTTCTTAAAATATCCTGATCTACCATCGCCGTCATAGAGCGTATTTTTATTACCTGATTTGCAGGTTCGATTCCCTATTCGGAGATAGCACTCATGCAACACGAACTACAGCCTGATTCACTGGTTGATTTGAAATTCATCATGGCTGATACTGGCTTTGGTAAAACCTTCATCTATGACCGGATTAAGTCAGGCGACCTGC > NC_000913/2475930‑2476418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |