Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 867,553 | Δ15,836 bp | [gsiA]–[ybjG] | [gsiA], gsiB, gsiC, gsiD, pdeI, dgcI, rimO, bssR, yliI, gstB, dacC, deoR, [ybjG] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 867553 | 883388 | 15836 | 75 [0] | [1] 79 | [gsiA]–[ybjG] | [gsiA],gsiB,gsiC,gsiD,pdeI,dgcI,rimO,bssR,yliI,gstB,dacC,deoR,[ybjG] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 867552 | 0 (0.000) | 75 (0.850) | 68/488 | 0.1 | 100% | coding (33/1872 nt) | gsiA | glutathione ABC transporter ATP binding subunit GsiA |
? | NC_000913 | 883389 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/‑284) | ybjG/mdfA | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase/multidrug efflux pump MdfA/Na(+):H(+) antiporter/K(+):H(+) antiporter |
GTCGTGCGGAAAAAGATGTCCCATCGTCCAGGACACAAACAGGCTGACCGCCAGCGCGATAGCGATTTTTATCACCAGTTGCCGTTGTGCTGTAAGCCCCCACAACCAAAGTACCACGGCCAGCAACGGCACCACGGTAATCAAATCTTTAGCAATAAAAATCGCCAACGAGATCATCCACGGAGCCGAGTCTGGCGTCGCGTTAATAAGAGAGAATAGAGAGAGATTCAAATTTTCCAGCATAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAA > NC_000913/883146‑883639 | taatggattacggcggattaagtctcgcggaagcctgcgagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTcc < 1:176497‑M2/7‑1 (MQ=255) gattacggcggattaagtctcgcggaagcctgcgagcggggagtaatggaaaaactccctgcgcttggcgggagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctccgcaggcggtacgccaaccaacggtatctaccggggaaaaggggacaccgtttccacacagggatggaattgatgccggtaatAACTTCCCGAcgg > 1:232954‑M2/239‑250 (MQ=255) ttcgggggattaagtctcgcggaagcgtgcgagcgggtagtaatgtaaaaacgccctgctcttgtcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacacggaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaagggactccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCaa < 2:621773‑M2/15‑1 (MQ=255) cggcggattaagtctcgcggaagcctgcgagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGt < 1:597977‑M2/18‑1 (MQ=255) ggcggattaagtctcgcggaagcctgcgagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTg > 1:599302‑M2/233‑251 (MQ=255) gcggattaagtctcgcggaagcctgcgagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacaccgtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAaaggg > 2:413029‑M2/232‑248 (MQ=255) ggattaaggctcgcggaagcctgcgagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGAtt < 2:11202‑M2/22‑1 (MQ=255) attaagtctcgcggaagcctgcgagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTaa < 1:451457‑M2/24‑1 (MQ=255) taagtctcgcggaagccggcgagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggtttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaagtaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgcctcacagtgatgaacttgaggcgggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTaaa < 1:617309‑M2/25‑1 (MQ=255) ctcgcggaagcctgcgagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAggg > 1:57895‑M2/221‑249 (MQ=255) cgcggaagcctgcgagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAg < 1:156630‑M2/31‑1 (MQ=255) cgcggaagcctgcgagcgggtagtaatggaaaaactcccggcgcttggcgggagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATT‑AAAGGGAGcc < 2:386530‑M2/32‑1 (MQ=255) gcggaagcctgcgagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAAATTCCCGACGCAAAGGGATTAAAAGGGAGcc > 2:238489‑M2/218‑250 (MQ=255) cggaagcctgcgagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCaa < 1:637054‑M2/35‑1 (MQ=255) gaagcctgcgagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATa < 1:126680‑M2/37‑1 (MQ=255) cgagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAg < 1:473519‑M2/45‑1 (MQ=255) gagcgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGt > 1:76460‑M2/206‑251 (MQ=255) cgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGt > 1:136978‑M2/203‑251 (MQ=255) cgggtagtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGt < 2:171773‑M2/49‑1 (MQ=255) agtaatggaaaaactccctgcgcttggcggtcgcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccgggatctaccgggaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGCTTAAAAGGGAGCCAATACAGGCCAgtcgtagcg > 2:54378‑M2/198‑246 (MQ=255) gaaaaactccctgcgcttggcggtagcggtgncttaatcgcgatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGt < 2:321505‑M2/61‑1 (MQ=255) caccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccattgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGt > 2:387620‑M2/185‑251 (MQ=255) ccccggcgctttgcggtagcggtggcttaagcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacgccgaaggaatgtatcgggcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacattgatgaacttgatgccggtaagAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGAAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGtt < 2:261621‑M2/68‑1 (MQ=255) ccctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGt < 2:243546‑M2/67‑1 (MQ=255) cctgcgctgggcggtggcggtggcttaatcgctatcgaccaggaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTaa < 2:168959‑M2/70‑1 (MQ=255) ctgcgcttggcggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgcaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaacaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTtaac > 1:223515‑M2/181‑250 (MQ=255) ggtagcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaacgaaggaatgtatcgcgcctggggctccgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacaaagtgatgaacttgatgacggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGAGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGc > 1:102498‑M2/170‑251 (MQ=255) agcggtggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGc > 1:389407‑M2/167‑251 (MQ=255) gaggtggcttaatctatatcgaccaggaagggaatgacacgctaccgtttaacaacgaaggaatttatcgcgcctggggctaagcaggcgagacgccaaccaacggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCCAAGGGATTAAAAGGGAGACAATACAGGAAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTACATTGGTTAAAGAGGc > 2:583446‑M2/166‑250 (MQ=255) ggcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTc < 1:566559‑M2/91‑1 (MQ=255) gcttaatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCt < 1:479431‑M2/92‑1 (MQ=255) aatcgctatcgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTAt < 1:29017‑M2/95‑1 (MQ=255) cgaccatgaagggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAg < 2:76460‑M2/105‑1 (MQ=255) gaccatgacgggaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACCGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAagg > 2:142608‑M2/146‑250 (MQ=255) ccatgaaggtcatgccgctctaccgtttaaanccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgctacgccagccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgatctttatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCCTTGAGAATAAAGTGCAGGGTAAACTGGGTAAACCGGCATCGTCTTAGTTCCCTCAAGCgg < 2:334535‑M2/108‑1 (MQ=255) gaatgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgagaaaaaggggaaaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGCTTAACAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGAAGGTTAAACTGGGTAAAACGGCATCGTCTTATTTCCCTCACGCGGCCTGTTTAc > 2:422655‑M2/135‑251 (MQ=255) atgtcgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACgg > 1:217296‑M2/133‑251 (MQ=255) gtcgcgctcccgtttaacacctaaggactgtntcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacaaagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACggtg < 2:331125‑M2/121‑1 (MQ=255) cgcgctaccgtttaacaccgaaggaatgtatcgagcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACggtggg > 2:652779‑M2/129‑251 (MQ=255) cgctaccgtttaacgccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctgccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacattgttgaacttgatgccggtaatAACTGCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACggtgggtg < 2:396755‑M2/125‑1 (MQ=255) ttaacaccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAAc < 1:428777‑M2/133‑1 (MQ=255) acaccgaaggaaggtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtagctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGc < 2:57895‑M2/137‑1 (MQ=255) caccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGACTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGc > 1:486484‑M2/114‑250 (MQ=255) accgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaacggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCAt > 2:143475‑M2/113‑251 (MQ=255) ccgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGGGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCAt > 1:597493‑M2/112‑250 (MQ=255) ccgaaggaatgtatcgagcctggggctacgcnggagatacgccaaccgccggtatctaccgtgaaaaaggggacgccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATa < 2:372644‑M2/140‑1 (MQ=255) cgaaggattgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAATCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAg < 2:176169‑M2/141‑1 (MQ=255) cgaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgaaacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgcaggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAGCTGGGTACAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAGGCGGCCTGTTTACGGCGGGCGATTGTCACGGGcatcg > 1:594980‑M2/111‑249 (MQ=255) gaaggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctacagtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAgg > 1:323060‑M2/110‑251 (MQ=255) aggaatgtatcgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGtt < 1:676035‑M2/144‑1 (MQ=255) cgcgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATACAACt > 1:73740‑M2/98‑251 (MQ=255) cgcctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGGNGTTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACtt > 2:339987‑M2/96‑250 (MQ=255) cctggggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacgcagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTGCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTaaa < 1:423242‑M2/158‑1 (MQ=255) ccgggggatacggcggcgataagccaaccaccggtatctaccgggaaaaaggggacaccgtggccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTGCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGCGCCAATACAGGCAAGGCGTTGATAATAAAGTGCAGGTTAAACTTGGTAAAGCGTCATCGTCTTAGTTCCCACAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTTATTGTAACGGGCATAGGTCAAATAAAACTtaag < 2:109714‑M2/158‑2 (MQ=255) ggctacgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTaaagaaag < 1:54378‑M2/163‑1 (MQ=255) gctccccaggcgatccgccaaccacccgtatctaccgggaaaaaggggacagcgtttccacacagtgatgaacgtgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGTGCCAATGCAGTCAAGTCGTTGAGAGGAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCAACGTCTTATTTCCCTCAAGCTGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGc < 1:415671‑M2/164‑1 (MQ=255) acgcaggcgatacgccaaccaccggtatctaccgggaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGt < 2:536319‑M2/166‑1 (MQ=255) caggcgatacgccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCt > 2:102128‑M2/82‑251 (MQ=255) actccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCg < 1:199268‑M2/177‑1 (MQ=255) acgccaaccaccgggatctaacgtgaaaaaggggacaccgttgacacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATCCTCGt > 2:464071‑M2/74‑251 (MQ=255) ccaaccaccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgcaggtacaAACTTCCCGACGCACAGTGATTAAAAGTGAGCCAATACAGGCCAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGGTCAACTGGGTAAAGCAGAATCGTCTTATTTCACTCCAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATCGGTTCAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTAAACTCGtaat > 2:134973‑M2/71‑251 (MQ=255) ccggtatctaccgtgaaaaaggggaccccgtngccaaacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACTCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGGCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTaa < 2:357146‑M2/188‑1 (MQ=255) ccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTaa < 1:647537‑M2/188‑1 (MQ=255) ccggtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTaa < 1:531215‑M2/188‑1 (MQ=255) gtatctaccgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTTAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGaa < 2:66050‑M2/191‑1 (MQ=255) accgtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaccttgatgccggtaatAACGTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGATAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCt < 2:105302‑M2/197‑1 (MQ=255) gtgaaaaaggggacaccgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTa > 1:432681‑M2/52‑250 (MQ=255) gtgaaaaaggggacaacgtagccaaacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGACAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACGTGGTAAAGCGGCATCGTCGTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACTGGCATAGGTTAAATAAAACTTTAAGAAAGCGTAGATATACGCGTAATAATGTAAGAATGTgcttca < 2:693980‑M2/200‑3 (MQ=255) accgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCt > 2:300969‑M2/38‑251 (MQ=255) accgttgccacacagtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCt < 1:97182‑M2/214‑1 (MQ=255) ccgttgccacacagtgatgatcttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTa < 1:460198‑M2/215‑1 (MQ=255) ccacacagggatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTAcaaaag < 2:57158‑M2/221‑2 (MQ=255) gtgatgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCttt < 1:610847‑M2/228‑1 (MQ=255) atgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCCATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTAttt > 1:665272‑M2/21‑117 (MQ=255) atgaacttgatgccggtaatAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTAttt < 2:665272‑M2/97‑1 (MQ=255) aTAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTttatt < 1:102128/251‑1 (MQ=255) aaCTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTttatta < 1:378402/250‑1 (MQ=255) aaCTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTaa < 1:339987/251‑1 (MQ=255) aaCTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGGAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTaa < 1:302819/251‑1 (MQ=255) | GTCGTGCGGAAAAAGATGTCCCATCGTCCAGGACACAAACAGGCTGACCGCCAGCGCGATAGCGATTTTTATCACCAGTTGCCGTTGTGCTGTAAGCCCCCACAACCAAAGTACCACGGCCAGCAACGGCACCACGGTAATCAAATCTTTAGCAATAAAAATCGCCAACGAGATCATCCACGGAGCCGAGTCTGGCGTCGCGTTAATAAGAGAGAATAGAGAGAGATTCAAATTTTCCAGCATAACTTCCCGACGCAAAGTGATTAAAAGGGAGCCAATACAGGCAAGTCGTTGAGAATAAAGTGCAGGTTAAACTGGGTAAAGCGGCATCGTCTTATTTCCCTCAAGCGGCCTGTTTACGGTGGGTGATTGTAACGGGCATAGGTTAAATAAAACTTAAAGAAAGCGTAGCTATACTCGTAATAATGTAAGAATGTGCTTAACCGTGGTTTCAGCTACAAAATTCGCTTTCTCGTTAGCTGCGCTTTTATTAA > NC_000913/883146‑883639 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |