| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,361,226 | Δ9,811 bp | [gltF]–[nanE] | [gltF], yhcA, yhcD, yhcE, insH10, yhcE, yhcF, yhcG, nanQ, nanK, [nanE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3361226 | 3371036 | 9811 | 40 [0] | [0] 39 | [gltF]–[nanE] | [gltF],yhcA,yhcD,yhcE,insH10,yhcE,yhcF,yhcG,nanQ,nanK,[nanE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3361225 | 0 (0.000) | 39 (0.440) | 35/492 | 1.0 | 100% | coding (50/765 nt) | gltF | periplasmic protein GltF |
| ? | NC_000913 | 3371037 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+47) | nanE/nanT | putative N‑acetylmannosamine‑6‑phosphate 2‑epimerase/N‑acetylneuraminate:H(+) symporter | |||||
GTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGCACATTAAATATAACCTGCACAGCACCAACGCTAATTGCTGTAACCTCCA > NC_000913/3360975‑3361467 | gTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTc < 1:444356/251‑1 (MQ=255) ataatTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATATATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAATGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATAGATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATCTGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatctt > 1:701832‑M1/1‑244 (MQ=255) cattATCACCACAAACCACCTCACTAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGGGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATCTGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcc > 2:147446‑M1/2‑242 (MQ=255) caccTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccg > 1:349416‑M1/1‑226 (MQ=255) caccTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccg > 2:689808‑M1/1‑226 (MQ=255) ccTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgg > 1:647850‑M1/1‑213 (MQ=255) ccatGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggatt < 2:150104‑M1/250‑50 (MQ=255) aTGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAACTACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACTTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggatta > 2:451000‑M1/1‑200 (MQ=255) tCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGCGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGCACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattaacttt > 1:563194‑M1/1‑196 (MQ=255) cGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattaacttt < 1:442813‑M1/250‑56 (MQ=255) 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aTTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattaacttttggttttgactaaatcgtttttggcgctgccaaacggcacggcaccc > 2:583457‑M1/1‑149 (MQ=255) tCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCGCTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccggtcaacaggattaacttttggttttgactaaagcgtgtttggcgctgccaaccggcgcggcaccgct < 2:668070‑M1/250‑105 (MQ=255) cTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattaacttttggttttgactaaatcgtttttggcgctgccaaacggcacggcaccgctg > 1:360984‑M1/1‑145 (MQ=255) caAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattaacttttggttttgactaaatcgtttttggcgctgccaaacggcacggcaccgctgaatggtttaccgtcgatagcgtcatga < 1:190964‑M1/251‑133 (MQ=255) gATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattaacttttggttttgactaaatcgtttttggcgctgccaaacggcacggcaccgctgaatggtttaccgtcgatagcgtcatgagtacgc > 1:578387‑M1/1‑113 (MQ=255) atatataCTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattaacttttggttttgactaaatcgtttttggcgctgccaaacggcacggcaccgctgaatggtttaccgtcgatagcgtcatgagtacgcaac < 1:65155‑M1/251‑142 (MQ=255) 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(MQ=255) ataaatTTGTTATTAAGGCTATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattaacttttggttttgactaaatcgtttttggcgctgccaaacggcacggcaccgctgaatggtttaccgtcgatagcgtcatgagtacgcaacgcttccgggcgcaaccaacgctgaacgcggg > 2:483344‑M1/1‑78 (MQ=255) acggatATGTTCATATGTTTTTCAAAACGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattcacttttggttttgactaaatcgtttttggcgctgccaaacggcacggcaccgctgaatggtttaccgtcgatagcgtcctgagtacgcaacgctgcagggcgcaaccaacgctgaacgcgagaaggcagatccagcc > 2:516317‑M1/3‑64 (MQ=255) aGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattaacttttggttttgactaaatcgtttttggcgctgccaaacggcacggcaccgctgaatggtttaccgtcgatagcgtcatgagtacgcaacgcttccgggcgcaaccaacgctgaacgcgagaaggcatatccagccc > 2:198901‑M1/1‑63 (MQ=255) 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tttCAAAAAGAACCTCCCAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagcccgggcaacaggattaacttttggttttgactaaatcgtttttggcgctgccaaacggcacggcaccgctgaatggtttaccgtcgatagcgtcatgagtacgcaacgcttccgggcgcaaccaacgctgaacgcgagaaggcatatccagcccaatcagcaggatcacca < 2:65138‑M1/250‑206 (MQ=255) aaCCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattaacttttggtttttactaaatcgtttttggcgctgccaaacggctcggcaccgctgaatggtttaccgtcgatagcgtcatgagtacgcaacgcttccgggcgcaaccaacgttgaacgcgagaaggcatatccagcccaatcagcaggatcaccacgaacgtc > 1:412929‑M1/1‑35 (MQ=255) aGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattaacttttggttttgactaaatcgtttttggcgctgccaaacggcacggcaccgctgaatggtttaccgtcgatagcgtcatgagtacgcaacgcttccgggcgcaaccaacgctgaacgcgagaaggcatatccagcccaatcagcaggatcaccacgaacgtcagactgaacgag > 1:113456‑M1/1‑24 (MQ=255) gtgCAGCACTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattaacttttggttttgactaaatcgtttttggcgctgccaaacggcacggcaccgctgaatggtttaccgtcgatagcgtcatgagtacgcaacgcttccgggcgcaaccaacgctgaacgcgagaaggcatatccagcccaatcagcaggatcaccacgaacgtcagactgaacgagagcgatgccagcg > 1:389738‑M1/1‑13 (MQ=255) agcaCTTTCacatcttcccttagcgaaaggcccggtacatagaccgggcaacaggattaacttttggttttgcctaaatcgtttttggcgctgccaaacggcacggcaccgctgaatggtttaccgtcgatagcgtcatgagtacgcaacgcttccgggcgcaaccaacgctgaacgcgagaaggcatatccagcccaaccagcaggctcaccacgaacgtcagactgaacgagagcgatcacagcgcagt > 2:647641‑M1/1‑9 (MQ=255) | GTAATGAATAATTATCACCACAAACCACCTCACCAGCACCTTATTATTCACATGATCGTAACTATAAAATTCATTAAATAAATACATCCCAGCAAGTTGGCTATTTCTGAACGAGTTATTTATTTACATTCACAAACAGATATATATACTGCTTCAGCTTTTTATTTTAAAAAATAAATTTGTTATTAAGGATATGTTCATATGTTTTTCAAAAAGAACCTCACAACAGCTGCTATTTGTGCAGCACTTTCTGTTGCAGCATTCAGTGCCATGGCAACAGATTCAACTGATACAGAATTAACTATCATCGGCGAGTATACCCCTGGTGCATGTACCCCAGTTGTTACGGGCGGCGGCATTGTTGACTATGGGAAACATCATAACAGTGCGCTGAATCCGACCGGTAAAAGTAATAAACTGGTTCAACTGGGCCGCAAAAACAGCACATTAAATATAACCTGCACAGCACCAACGCTAATTGCTGTAACCTCCA > NC_000913/3360975‑3361467 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |