| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,498,768 | 9486 bp→CCC | [pyrS]–fryB | [pyrS], pyrR, ypdC, fryA, ypdE, ypdF, fryC, fryB | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2498768 | 2508253 | 9486 | 66 [0] | [0] 67 | [pyrS]–fryB | [pyrS],pyrR,ypdC,fryA,ypdE,ypdF,fryC,fryB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2498767 | 0 (0.000) | 66 (0.750) +CCC |
58/486 | 0.2 | 100% | coding (97/1698 nt) | pyrS | sensor histidine kinase PyrS |
| ? | NC_000913 | 2508254 = | 0 (0.000) | intergenic (‑12/+207) | fryB/glk | putative PTS enzyme IIB component FryB/glucokinase | |||||
TCGCGTGATTCGAAACGTTCGTTATCTTCCGGGGTAACTGCCACGGAGTGGATGATGATGGTCGCTTCGGCGATATCCTGCGCCGTCAGGCGATTCTGGATACCGTCCGCGCCCTGGGTTTCAATTTTCACTTCATAACCGGCTTCTACCGCCGCTTCTTCCAGCGCCTGAGCGGCCATAAAGGTGTGAGCCAGGCCCATCGGGCAGGCACATAAGGCAATCAGTTTCTTACTCATCGTTAATTCCTCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCGTAAATGTGCACCGG > NC_000913/2508007‑2508501 | aagtgcattatcaagagatgcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcctcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcctccgtatccgcctgtttcgcgcccCGtt > 2:650311‑M2/248‑251 (MQ=255) gcattatcaagagatgcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatcctcctgtttcgcgcccCGTTCAGt > 1:30805‑M2/244‑251 (MQ=255) cattatcaagagatgcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaaatcttatcttcctgttctttctcctccgtatccgcccgtttcacgcccCGTTCAGTg > 1:546923‑M2/243‑251 (MQ=255) aagagttgcttttttaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctgttcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcataggcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttttcatccttatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTg < 2:122728‑M2/16‑1 (MQ=255) 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attgctaatacaccattaatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgatggcggtcttcgatcgggcagcgttaaagcttatctgcctgttttttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGCTCCGtgatagttgccaggtgc > 1:433182‑M2/227‑242 (MQ=255) gctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctacctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAAtt < 1:354090‑M2/28‑1 (MQ=255) taatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATTGTTGACGAGTGACATTAt > 2:150621‑M2/222‑251 (MQ=255) atacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGa < 1:6875‑M2/32‑1 (MQ=255) atacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatatgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTatt > 1:362085‑M2/220‑249 (MQ=255) acaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcattcgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAAc < 1:336005‑M2/34‑1 (MQ=255) ccatttatctatcaatcccctgttaacattttggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccttgcacgaaatatgcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctaatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTGCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTg < 2:290115‑M2/37‑1 (MQ=255) atttatctatcaatccccttttaaaattggggttgtgcctcaaaaacggcctgctggtcttcagccttcatgatacctatcataggggtttaacctgtattcagagacacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggctgtcttcgatcgggcgccgttaatgcttatctgcctgttctttctcaaccggaaccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAAGTATGAACGTg < 2:112013‑M2/37‑1 (MQ=255) aacaaccccctgttaaaattgtggtttttcctcaaaaccggactgttggtcatcagccttcaggttacctatcataaaggttgaatccttattcagagtcacccgtgcgcgaaatattcaacatgcggctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatcttcctgtgctttcccatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACCTGCCAAACAAAt < 2:170585‑M2/47‑1 (MQ=255) aatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgttttgcacccCGTTCAGTGATAGTTGCCGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAAAaaatagc > 2:37588‑M2/202‑248 (MQ=255) atccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggccgcgttaatgcttatcttcctgttctttctcatccctatccgcctgtttctcgcccCGTTCAGTGTTTGTTTACCAGTTACATTCTGAACGTGCAAAACAAATCGcc > 2:246135‑M2/201‑251 (MQ=255) aaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGa < 1:174020‑M2/60‑1 (MQ=255) aaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGAc < 1:719116‑M2/61‑1 (MQ=255) attgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACaa > 1:486456‑M2/188‑250 (MQ=255) tgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGGGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAaat > 1:576318‑M2/186‑250 (MQ=255) ggggttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAaataat < 2:725016‑M2/68‑1 (MQ=255) gtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttccctatcatagaggtttaatccttattcagagtcccccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtgtcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGACTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGGCAAAGAATGc < 2:186970‑M2/70‑1 (MQ=255) gtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGc < 1:395386‑M2/70‑1 (MQ=255) 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cggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttatttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGGGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAACTAATGCATTTACTGGAGAAtt > 2:263079‑M2/167‑251 (MQ=255) ggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAAtt > 1:599246‑M2/166‑250 (MQ=255) ggcctgctggtaatcagccttcagtttacctnacatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTa < 2:339326‑M2/86‑1 (MQ=255) 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tcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCCTTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAagtgg > 1:357695‑M2/146‑250 (MQ=255) tcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcagccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTTCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAgt < 1:455209‑M2/104‑1 (MQ=255) aggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAg < 1:658351‑M2/103‑1 (MQ=255) 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gatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGCTGACGGGAGAAATTATGACCGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGCGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGCGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAAATGTATGCTTTAAAAGATTATCGGGagagtttccc > 1:223838‑M2/65‑247 (MQ=255) tcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACCTcc > 1:415247‑M2/63‑251 (MQ=255) gggcagcgtaaaggcttatctgcctgatctttctcaaccgtatccgactgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAATGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGTCCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACATCCCg < 2:536573‑M2/191‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |