New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 2929131 = | 138 (1.540) | 3 (0.030) | 3/492 | 6.7 | 2.6% | coding (903/1290 nt) | sdaC | L‑serine:H(+) symporter SdaC |
? | NC_000913 | = 3511404 | 85 (0.950) | coding (19/363 nt) | yhfY | PRD domain‑containing protein YhfY | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
GTGTTCTCGTTCAACCACTCTCCGATCATCTCTTCTTTCGCCGTTGCGAAGCGTGAAGAGTACGGCGATATGGCAGAACAGAAATGCTCGAAGATCCTGGCATTCGCACACATCATGATGGTGCTGACCGTAATGTTCTTCGTCTTCAGCTGTGTACTGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATGGCTCCGATTATCGCGATTATCGCTATCACCAAATCCTTCCTCGGTCACTACCTGGGCGCACGTGAAGGCTTCAACGGTATGGTGATTAAATCTCTGCGTGGTAAAGGTAAGTCTATCGAAATCAACAAGCTGAACCGTATCACTGCGCTGTTCATGCTGGTAACGACCTGGATTGTTGCCACCCTGAACCCGAGCATCCTGGGTATGATTGAAACCCTGGGCGGTCCAATCATCGCGATG > NC_000913/2928883‑2929380 | gTTCAACCACTCTCCGATCATCTCTTCTTTCGCCGTTGCGACGCGTGAAGAGTACGGCGATATGGCAGAACAGAAATGCTCGAAGATCCTGGCATTCGCACACATCATGATGGTGCTGACCGTAATGTTCTTCGTCTTCAGCTGTGTACTGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATgg > 2:661460/1‑251 (MQ=255) 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aCCACTCTCCGATCAGCTCTTCTTTCGCCGTTGCGAAGCGTGAAGAGTACGGCGATATGGCAGAACAGAAATGCTCGAAGATCCTGGCATTCGCACACATCATGATGGTGCTGACCGTAATGTTCTTCGTCTTCAGCTGTGTACTGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATGGCTCcg < 2:640983/251‑1 (MQ=255) cctctCCGATCATCTCTTCTTTCGCCGTTGCGAAGCGTGAAGAGTACGGCGATATGGCAGAACAGAAATGCTCGAAGATCCTGGCATTCGCACACATCATGATGGTGCTGACCGTAATGTTCTTCGTCTTCAGCTGTGTACTGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAAGAGCAGAACATCTCGATTCTGTCTTACCTGGCTAACCACTTTAACGCACCGGTTATCGCGTGGATGGCTCcgatt < 1:384240/250‑1 (MQ=255) aCTCTCCGAGCATCGCTTCTTTCGCCGTTGCGAAGCGTGAAGAGTACGGCGATATGGCAGAACAGAACTGACCGAAGATCCTGGCATTCGCACACATCATGATGGTGCTGACCGTAATGTTCTTCGTCTTCAGCTGTGTACTGAGCCTGACTCCGGCAGACCTGGCTGCGGCTAAGGGGCATAACATCGCGATTCTGTCTTACCTGGCTACCCACTTTAACACACCGGTTATCGCGGGGATGGCTCcgatt > 2:475950/1‑251 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |