| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,453,509 | Δ16,346 bp | [gspB]–chiA | 17 genes [gspB], gspA, gspC, gspD, gspE, gspF, gspG, gspH, gspI, gspJ, gspK, gspL, gspM, gspO, bfr, bfd, chiA |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3453509 | 3469854 | 16346 | 58 [0] | [0] 57 | [gspB]–chiA | [gspB],gspA,gspC,gspD,gspE,gspF,gspG,gspH,gspI,gspJ,gspK,gspL,gspM,gspO,bfr,bfd,chiA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3453508 | 0 (0.000) | 57 (0.640) | 52/490 | 0.3 | 100% | coding (420/420 nt) | gspB | putative general secretion pathway protein B |
| ? | NC_000913 | 3469855 = | 0 (0.000) | intergenic (‑2/+290) | chiA/tufA | endochitinase/translation elongation factor Tu 1 | |||||
GTTCTGCATGAGACCAGAGCTCCAATTATTTTATAAACGAAAATGATTACTCCTCAGACCCATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3453262‑3453508‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGC > NC_000913/3469855‑3470103 GTTCTGCATGAGACCAGAGCTCCAATTATTTTATCAACGACAATGATTACTCCTCAGACCCATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGATCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATA > 1:275660/1‑250 ATGAGACCAGAGCTCCAATTATTTTATAACCGAAAATGATTACTCCTCAGACCCATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACTCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTG > 2:35631/1‑251 GACCAGAGCTCCAATTATTTTATAAACGAAAATGATTACTCCTCAGACCCATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGAC < 1:548685/251‑1 ACCAGAGCTCCAATTATTTTATAAACGAAAATGATTACTCCTCAGACCCATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACG < 1:367674/251‑1 CTCCAATTTTTTTATAAACGAAAATGATTACTCCTCAGACCCATTACTAATGATGGAAGAGAGTAACCGTTCTTCCGTAGCTCCCAGATTGGGAGCATAGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTAAACTACGCCAAGCCCGCGCATTATACATACTAAAGCACAGAACGCAAGAGTATTGCAAGTAAAGTCAACAGCATTCGGGCATAATCCCTTGTGACGTAAAca > 2:158793/1‑248 TCCAATTATTTTATAAACGAAAATGATTACTCCTCAGACCCATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACT > 1:276118/1‑251 TTTTATAAACGAAAATGATTACTCCTCAGACCCATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGAGACGTCAAAACTGCAAAAC > 2:493725/1‑250 ATAAACGAAAATGATTACTCCTCAGACCCATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAG < 2:49132/251‑1 CGAAAATGATTACTCCTCAGACCCATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCT > 1:226012/1‑250 ATGATTACTCCTCAGACCCATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGC > 1:85804/1‑249 gacaCCTCAGACCCATTACGATTGATGTGAGAGTGTAACCGTTCTTTCGTAGCTCCCCGTTTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGATAACGGAGGTTCAGATTGAACCGGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCGACGCAGGAAT < 2:672334/246‑1 CAGACCCATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTA < 1:497498/249‑1 GACCCATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCAGATTGTGAGCATAGTTAGGTAGCCCAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCAGCTGTCAACTACGAACAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAACCGTATTGCTAGTACAGTAAACAGCCTTCGGGACTACTCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACACAAGTCCTAAGCAGGAATTATTTACGat > 2:395289/1‑249 CCATTACGATGGATGGGATAGTGTAACGGTTCTTACGGAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGATCCTGCTGTCAACTACGTCAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCGAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTTTGACGTAAAAACGGCAAAACAAAAGTCCTGCGCAGGAATTATTTACGTTTTA < 2:685859/251‑1 CATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTAC < 1:327192/251‑1 ATTGATGGTAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGTTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCATCTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCGCCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCGTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACC < 2:451581/251‑1 TTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAACCAAATTCGGCTAACTGAGGGTCAGATTGAACATGCTGTCAACTACGACAAGCACGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAACGTATTGCTCGAAAAGAAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGAGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTAAAGTTTACGAGAACCC > 2:453234/1‑251 GATGGGAGAGTGTACCCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTT < 1:494901/251‑1 GATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCGCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCATTCAGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTT < 2:211070/251‑1 ATGGGAGAGTGTTACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGTGAGCAGTGTTAGGTAGTCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTTAACCTGCTGTCAACTACTACAAGCCCGCGCATTATACATCCTTAACCACCGAACGCATGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGTGTATAATCCCTTGTGTCGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATGATTTACGTTTTACGAGAACCCTT < 2:82574/250‑1 GTGTAATCGTTCTTAAGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAATCCCGCGCCTTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTCTAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAAactga > 2:640468/1‑245 GTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAAT < 2:716061/250‑1 AACCGGTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCAGTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAA < 2:700428/251‑1 CCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAAT < 1:356017/251‑1 TCTTACGTAGCTCCGCGATTGGGAGCAGTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTGAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTAC < 2:626728/250‑1 CTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTTCGG > 1:538464/1‑251 ACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCA < 2:572200/250‑1 agaATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATAAATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCATCCGGGTATAATACCTTGTGACGTAAAAACATCAAAACAAAAGTCCTACTCAGGAATTATTTACGTTTTACGCGAACCCTTCAATATGAATTACATTACGTCATTAAAAATAAGAAAAAAccc > 2:3465/4‑248 GCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTGTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCA < 1:93114/251‑1 AAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGACCCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTT > 1:581354/1‑251 AATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCACTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCATTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTT > 1:108607/1‑251 AACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATGTTAAAAACAG < 1:218442/250‑1 ggTCAGATTGAACCTGCTGACAACTACGACAAGCCAGCGCATGATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCTGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTGCAATATGAATTAAATGACGGCATGAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAATAGAAACATTC < 2:217474/249‑1 GTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATCCTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTC > 1:395199/1‑251 GTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTC < 1:655823/251‑1 CAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATA < 1:493725/251‑1 GATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATT < 1:453234/251‑1 GATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATT > 1:609387/1‑251 ATTGAAACTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGAATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTCAAAATAAGAAAAAAGCATGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTAATATTT > 2:571682/1‑251 GAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGAGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATACCTTGTAACGTAAAAACTGCAAACCAACAGTCATCCGCAGGAATTCTTTACGTTTTACGCGAACCCTTCAATATGACTTAAATTACGGCATTAAAATTAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAANCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAA > 2:352043/1‑250 AACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTG > 1:77332/1‑250 TACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATT > 1:426987/1‑251 CCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCACGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTA > 2:223052/1‑250 ATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATG > 1:433296/1‑250 TATACATCCTTAACCACCGAACGCAAGCGTAATGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTATGAGAACCCTTCAATATTAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATGCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATtaa < 2:452095/250‑4 TATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAA < 1:476190/250‑1 ATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAAT > 1:224787/1‑250 ATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTT > 2:15642/1‑251 AACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGT > 2:132333/1‑251 CGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGT > 1:673927/1‑250 AAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACG > 1:338957/1‑250 GCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAAT > 1:17765/1‑251 TAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGC > 1:254198/1‑251 TAAACAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAAC > 1:592961/1‑250 CAGCCTTCGGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATG > 1:695926/1‑251 GGGTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACCGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGG > 2:556468/1‑251 GTATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGC < 2:216464/251‑1 GTTCTGCATGAGACCAGAGCTCCAATTATTTTATAAACGAAAATGATTACTCCTCAGACCCATTACGATTGATGGGAGAGTGTAACCGTTCTTACGTAGCTCCCCGATTGGGAGCATTGTTAGGTAGCCAAATTCGGCTAACTGAGGTTCAGATTGAACCTGCTGTCAACTACGACAAGCCCGCGCATTATACATACTTAACCACCGAACGCAAGCGTATTGCTAGTAAAGTAAACAGCCTTCGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3453262‑3453508‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tATAATCCCTTGTGACGTAAAAACTGCAAAACAAAAGTCCTACGCAGGAATTATTTACGTTTTACGAGAACCCTTCAATATGAATTAAATTACGGCATTAAAAATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGC > NC_000913/3469855‑3470103 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |