| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,411,645 | 9722 bp→A | yhdJ–[yhdY] | yhdJ, yhdU, envR, acrE, acrF, yhdV, yhdX, [yhdY] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3411645 | 3421366 | 9722 | 36 [0] | [2] 39 | yhdJ–[yhdY] | yhdJ,yhdU,envR,acrE,acrF,yhdV,yhdX,[yhdY] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3411644 | 0 (0.000) | 36 (0.630) +A |
33/488 | 0.4 | 97.3% | intergenic (+77/‑9) | fis/yhdJ | DNA‑binding transcriptional dual regulator Fis/DNA adenine methyltransferase |
| ? | NC_000913 | 3421367 = | 2 (0.030) | coding (43/1104 nt) | yhdY | putative ABC transporter membrane subunit YhdY | |||||
CATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATCGCGATCGTTGAACGCTAAGGAGTCATGATGACAAAAGTATTGCTGTCTCATCCCCCGCGCCCGGCGAGCCATAACTCAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCTTTACCCACACGACCAACGCT > NC_000913/3421117‑3421616 | gaatggtcaggatgtgaatgacctctatgagctggtactggctgaagtagaacagcccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggac > 2:22347‑M2/251‑251 (MQ=255) ggtcaggatgtgaatgacctctatgagctggtactggctgaagtagaacagcccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgttgtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgtttgattaaaaaggcgctacgcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATaa < 2:273649‑M2/5‑1 (MQ=255) ggtcaggatgtgaatgacctctatgagctggtactggctgaagtagaacagcccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATa < 2:339510‑M2/4‑1 (MQ=255) caggatgtgaatgacctctatgagctggtacnggctgaagtagaacagcccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgcctttgttataggtgtcacaaaggaCATAActt < 2:222015‑M2/8‑2 (MQ=255) 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CATCGTCAAAAACTCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATCGCGATCGTTGAACGCTAAGGAGTCATGATGACAAAAGTATTGCTGTCTCATCCCCCGCGCCCGGCGAGCCATAACTCAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCTTTACCCACACGACCAACGCT > NC_000913/3421117‑3421616 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |