| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,985,842 | Δ47,769 bp | yqeG–[idi] | 39 genes yqeG, yqeH, yqeI, yqeJ, yqeL, yqeK, ygeG, ygeH, ygeI, insD4, insC4, ygeQ, glyU, actS, xdhA, xdhB, xdhC, ygeV, ygeW, ygeX, ygeY, hyuA, yqeA, yqeB, yqeC, mocA, ygfK, ssnA, ygfM, xdhD, xanQ, guaD, ghxQ, ygfS, ygfT, uacT, yqfG, yqfH, [idi] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2985842 | 3033610 | 47769 | 40 [0] | [0] 41 | yqeG–[idi] | yqeG,yqeH,yqeI,yqeJ,yqeL,yqeK,ygeG,ygeH,ygeI,insD4,insC4,ygeQ,glyU,actS,xdhA,xdhB,xdhC,ygeV,ygeW,ygeX,ygeY,hyuA,yqeA,yqeB,yqeC,mocA,ygfK,ssnA,ygfM,xdhD,xanQ,guaD,ghxQ,ygfS,ygfT,uacT,yqfG,yqfH,[idi] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2985841 | 0 (0.000) | 40 (0.690) | 39/490 | 0.2 | 100% | intergenic (‑249/‑6) | yqeF/yqeG | putative acyltransferase/putative transporter YqeG |
| ? | NC_000913 | 3033611 = | 0 (0.000) | coding (547/549 nt) | idi | isopentenyl‑diphosphate Delta‑isomerase | |||||
CGCTACCGCGCCACCGATCCGAGTGGCATTGTGGAAAATGAAGTGTGTCCGGTATTTGCCGCACGCACCACTAGTGCGTTACAGATCAATGATGATGAAGTGATGGATTATCAATGGTGTGATTTAGCAGATGTATTACACGGTATTGATGCCACGCCGTGGGCGTTCAGTCCGTGGATGGTGATGCAGGCGACAAATCGCGAAGCCAGAAAACGATTATCTGCATTTACCCAGCTTAAATAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCATCGCCGGGAACAGAATAACGTCGCGGATGGTATGGCTGTTGGTGAACAGCATTACCATACGGTCGATACCAATTCCCAGACCTGCTGTCGGCGGTAAGCCATGTTCCAGTGCGGTGACGTAATCTTCATCGTAGAACATCGCTTCGTCGTCACCTGCGTCTTTCGCGGCAACCTGATCCAGGAAGC > NC_000913/3033371‑3033859 | gcaccaattaacagtgcaatagtaaatgattgttaattacagttatctttattgtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAAccc > 1:253584‑M2/241‑251 (MQ=255) caattaacagtgcaatagtaaatgattgttaattacagttatcttaattgtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggcagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGAc > 1:57527‑M2/237‑251 (MQ=255) atgattgttaattacagttatcttaattgtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCAt > 1:380469‑M2/216‑251 (MQ=255) gattgttaattacagttatcttaattgtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATaa < 1:446004‑M2/38‑1 (MQ=255) gattgttaattacagttatcttaattgtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATa < 1:317165‑M2/37‑1 (MQ=255) gttatcttaattgattaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgtgcagcagtcagagacataactggcacgtacggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttcatctcccatacttaacctggtttatgggaaattgccctccattctgtttaatttgatgatgatacgttcAAAAAAATCCCCGACATTTACCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTAttt > 2:60459‑M2/200‑251 (MQ=255) attgtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACg > 1:304898‑M2/191‑251 (MQ=255) attgtttaaaaaaagtgatttttatcaaaaaggaaatatgactgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaataaaggggtcgatagggcgttaatctaccatacataacctggtttatggtaaaatgccctacattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGGGCATAACGTCATGCTTATTTTACCGGacc > 2:401323‑M2/191‑250 (MQ=255) ttgtttcaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacgtagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGc > 2:141416‑M2/190‑251 (MQ=255) gtttaaaaaaagtgatttttatcacaaaggaaatatgcctgagcagcagtcagagacataactggcacggagggtttgcaaccactaacccaccaatagaggggtagatagggcgttaatctcccatacttaacctggtttatggtaaattgccctccattctgtttaatttgtagatgatacgttcTAAAAAAACCCCGACATTTGCCGGGGTTGTGAGCATAACGTAATGCTTATTTTACCGGACGCAt < 1:13932‑M2/64‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |