| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,417,058 | Δ10,734 bp | yfcC–[argT] | yfcC, yfcD, yfcE, yfcF, yfcG, folX, yfcH, rpnB, hisP, hisM, hisQ, hisJ, [argT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2417058 | 2427791 | 10734 | 41 [0] | [0] 41 | yfcC–[argT] | yfcC,yfcD,yfcE,yfcF,yfcG,folX,yfcH,rpnB,hisP,hisM,hisQ,hisJ,[argT] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2417057 | 0 (0.000) | 40 (0.700) | 38/488 | 0.3 | 100% | intergenic (+166/‑24) | pta/yfcC | phosphate acetyltransferase/putative transporter YfcC |
| ? | NC_000913 | 2427792 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+265) | argT/ubiX | lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic binding protein/flavin prenyltransferase | |||||
TGAGGGGATCAGCGCGTCAAAGTCACTGGCAACCCAGGTACATTTCACCTGCATCCGTTTGCACATCTCGTTACCGAGATCGATATCAAAGCCAACAAAATCACCTTTAGCATCTTTCGATGAGAACGGTGCGTAGGTGGTATCGGTTCCGATACGTACCGTCTCCGGTAGCGCCGCATAGCTGGAAGCCGCTGTGGAGAGACCGACTAACAAAGACAGAGCGAGAATCGACTTCTTCATACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCGAGGATTTGATCGCGGTTGCAAAATTGCCCTGAAAC > NC_000913/2427552‑2428041 | cccgtggcgcactggttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcgtaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTc < 1:210003‑M2/11‑1 (MQ=255) ttgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCtt > 2:57446‑M2/226‑251 (MQ=255) tgacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagcttcgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCtt < 2:424965‑M2/26‑1 (MQ=255) gacgatatcgtctacaccatcgcgctgactgcgattcagtctgcacagcagcagtaatctcgtcatcatccgcagctttgcgctgcggatatctgaaccggaaataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCttt < 1:150623‑M2/27‑1 (MQ=255) 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1:124701‑M2/121‑151 (MQ=255) ataatcactatttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTa < 2:124701‑M2/31‑1 (MQ=255) atttccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTATGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATCCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCatt < 2:1517‑M2/138‑1 (MQ=255) tccggttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattagcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTg < 2:184216‑M2/142‑1 (MQ=255) ttttttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTg > 1:103651‑M2/104‑250 (MQ=255) ttattctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAACTGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCCACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGtt > 2:397447‑M2/100‑251 (MQ=255) attctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTg > 1:242183‑M2/98‑250 (MQ=255) attctcttaatttgcatgaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTg < 1:450948‑M2/153‑1 (MQ=255) tctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTCTGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTATTAAGACGTTGCATTATTGTCATGAAGTTGa > 2:149820‑M2/96‑249 (MQ=255) tctcttaatttgcattaatcctttctgattatcttgcttaactgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTa < 1:377350‑M2/114‑1 (MQ=255) 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ctgcgctgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAAt > 2:117386‑M2/55‑251 (MQ=255) tgcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGc > 1:457192‑M2/49‑248 (MQ=255) gcatcaatgaattgcgccatctcactttgcatacttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGATTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATTCCATCTTGCCGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATCTGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGACGTTGGAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGa > 2:198831‑M2/48‑250 (MQ=255) tgcgccatctcactttgcattcttcccactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCg < 2:245268‑M2/215‑1 (MQ=255) cactttgttACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCGAGGATTTGATCGCGGTTGCAAAATTGc > 2:458482‑M2/10‑251 (MQ=255) acataACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGAGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCGAGGATTTGATCGCGGTTGCAAAATTGCCCTGaaaa > 2:284835/1‑249 (MQ=255) | TGAGGGGATCAGCGCGTCAAAGTCACTGGCAACCCAGGTACATTTCACCTGCATCCGTTTGCACATCTCGTTACCGAGATCGATATCAAAGCCAACAAAATCACCTTTAGCATCTTTCGATGAGAACGGTGCGTAGGTGGTATCGGTTCCGATACGTACCGTCTCCGGTAGCGCCGCATAGCTGGAAGCCGCTGTGGAGAGACCGACTAACAAAGACAGAGCGAGAATCGACTTCTTCATACATAACCCTCAAGTGAAAATGGCTTTTTTATGTTGTGTATTGTGTTGTGTGTTTGCAGGCTCTTTCATGCAGGTCTTATGCCATCTTGACGACAACAGTAACATTCAACGTTAAATATGTTAATAAGACGTTGCATTATTGTCCTGAAGTTGAAGATAGCAGGTATAGCGGTTGAATCGCAGCGTTTCGATTGAATGGCAGAAACAAAATGTCGAGGATTTGATCGCGGTTGCAAAATTGCCCTGAAAC > NC_000913/2427552‑2428041 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |