| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,066,152 | Δ12,778 bp | insH6–[yoeF] | insH6, yoeA, insD3, insC3, yoeA, isrC, flu, yeeR, yeeS, yeeT, cbeA, cbtA, yeeW, [yoeF] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2066152 | 2078929 | 12778 | 41 [0] | [0] 39 | insH6–[yoeF] | insH6,yoeA,insD3,insC3,yoeA,isrC,flu,yeeR,yeeS,yeeT,cbeA,cbtA,yeeW,[yoeF] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2066151 | 0 (0.000) | 39 (0.680) | 34/488 | 0.4 | 100% | intergenic (‑387/+154) | cobU/insH6 | cobinamide‑P guanylyltransferase/cobinamide kinase/IS5 family transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | 2078930 = | 0 (0.000) | coding (356/357 nt) | yoeF | putative uncharacterized protein YoeF | |||||
CGAAATAAGATGGCATTACGGAATAGCCAGACTTTCTCGTGTTAACGTCCGACAAAATGCGTCATTGACAGCGGTTTCTGTGGATTGACACATTTCATTCAGATAATGAATTAATGCTACTGCCGGAACAACCAGCAAACGGGCATTGTGTTCTGAAATCCAGGCTATTGATTCAACGTCAGCGACAGATCTGCGCTGTAAAAGAACTTGTAAAACAACGTAATAGAATTATCCGGAATGGTGGCGACTATGCACTAGGGAAGGTGCGAATAAGTGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTTTTTAGTGAGATCTCTCCCACTGACGTATCATTTGGTCCGCCCGAAACAGGTTGGCCAGCGTGAATAACATCGCCAG > NC_000913/2065901‑2066379 | cGAAATAAGATGGCATTACGGAATAGCCAGACTTTCTCGTGTTAACGTCCGACAAAATGCGTCATTGACAGCGGTTTCTGTGGATTGACACATTTCATTCAGATAATGAATTAATGCTACTGCCGGAACAACCAGCAAACGGGCATTGTGTTCTGAAATCCAGGCTATTGATTCAACGTCAGCGACAGATCTGCGCTGTAAAAGAACTTGTAAAACAACGTAATAGAATTATCCGGAATGGTGGCGACTAt < 1:440604/251‑1 (MQ=255) gAAATAAGATGGCATTACGGAATAGCCAGACTTTCTCGTGTTAACGTCCGACAAAATGCGTCATTGACAGCGGTTTCTGTGGATTGACACATTTCATTAAGATAATGAATTAATGCTACAGCCGGAACAACCAGCAAACGGGCATTGTGTTCTGAAATCCAGGCCATTGATTCAACGTCAGCGACAGATCTGCGCTGTAAAAGAACTTGTAAAACAACGTAATAGAATTCTCCGGACTGGTGGCGACTAt > 1:178083/1‑250 (MQ=255) aGATGGCATTACGGAATAGCCAGACTTTCTCGTGTTAACGTCCGACAAAATGCGTCATTGACAGCGGTTTCTGTGGATTGACACATTTCATTCAGATAATGAATTAATGCTACTGCCGGAACAACCAGCAAACGGGCATTGTGTTCTGAAATCCAGGCTATTGATTCAACGTCAGCGACAGATCTGCGCTGTAAAAGAACTTGTAAAACAACGTAATAGAATTATCCGGAATGGTGTCGACTATaatttcg > 1:329278‑M1/1‑244 (MQ=255) ggCATTACGGAAGAGCCAGACTTTCTCGTGTTAACGGCCGACAAAATGCGTCATTGACATCGGTTTCTGTGGAGTGACACAATTCATTCAGATAATGAATTAATGCTACTGCCGGAACAACCAGCAAACGGTCATTGTGTTCTGAAATCCAGGCTATTGATTCAACGTTAGCTACCGATCTGCGCTGTAAAAGAACTTGTAAAACAACGTAATAGAATTATCCGGAATGGTGGCGGCTATaatttcgagtg < 2:461449‑M1/251‑12 (MQ=255) 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aGATAATGAATTAATGCTACTGCCGGAACAACCAGCAAACGGGCATTGTGTTCTGAAATCCAGGCTATTGATTCAACGTCAGCGACAGATCTGCGCTGTAAAAGAACTTGTAAAACAACGTAATAGAATTATCCGGAATGGTGGCGACTATaatttcgattggttctcggatgaggatgatgacggtgatacacagataagaatcaatgagcaatgagggttgccgggcaaccctcattgaataaaacggg > 1:290731‑M1/1‑151 (MQ=255) aTAATGAATTAATGCTACTGCCGGAACAACCAGCAAACGGGCATTGTGTTCTGAAATCCAGGCTATTGATTCAACGTCAGCGACAGATCTGCGCTGTAAAAGAACTTGTAAAACAACGTAATAGAATTATCCGGAATGGTGGCGACTATaatttcgattggttctcggatgaggatgatgacggtgatacacagataagaatcaatgagcaatgagggttgccgggcaaccctcattgaataaaacggga > 1:169176‑M1/1‑149 (MQ=255) gCTACTGCCGGAACAACCAGCAAACGGGCATTGTGTTCTGAAATCCAGGCTATTGATTCAACGTCAGCGACAGATCTGCGCTGTAAAAGAACTTGTAAAACAACGTAATAGAATTATCCGGAATGGTGGCGACTATaatttcgattggttctcggatgaggatgatgacggtgatacacagataagaatcaatgagcaatgagggttgccgggcaaccctcattgaataaaacgggaattacttcgcttc < 1:184820‑M1/250‑115 (MQ=255) 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tATCCGGAATGGTGGCGACTATaatttcgattggttctcggatgaggatgatgacggtgatacacagataagaatcaatgagcaatgagggttgccgggcaaccctcattgaataaaacgggaattacttcgcttcgccgtttttcatttcgcccatagctttcagctttttggagatatcgcggcgttctttggagagctcggcatttttgatgatgtaatcgtcaacgcgatcttcatagtcaccttt < 2:117010‑M1/250‑229 (MQ=255) | CGAAATAAGATGGCATTACGGAATAGCCAGACTTTCTCGTGTTAACGTCCGACAAAATGCGTCATTGACAGCGGTTTCTGTGGATTGACACATTTCATTCAGATAATGAATTAATGCTACTGCCGGAACAACCAGCAAACGGGCATTGTGTTCTGAAATCCAGGCTATTGATTCAACGTCAGCGACAGATCTGCGCTGTAAAAGAACTTGTAAAACAACGTAATAGAATTATCCGGAATGGTGGCGACTATGCACTAGGGAAGGTGCGAATAAGTGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTTTTTAGTGAGATCTCTCCCACTGACGTATCATTTGGTCCGCCCGAAACAGGTTGGCCAGCGTGAATAACATCGCCAG > NC_000913/2065901‑2066379 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |