Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 2,030,451 | Δ10,928 bp | [yedA]–[zinT] | [yedA], [vsr], dcm, yedJ, drpB, rseX, hchA, hprS, hprR, hiuH, msrP, msrQ, [zinT] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 2030451 | 2041378 | 10928 | 42 [0] | [0] 42 | [yedA]–[zinT] | [yedA],[vsr],dcm,yedJ,drpB,rseX,hchA,hprS,hprR,hiuH,msrP,msrQ,[zinT] |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2030450 | 0 (0.000) | 42 (0.730) | 36/490 | 0.3 | 100% | coding (912/921 nt) coding (469/471 nt) |
yedA vsr |
putative transporter YedA DNA mismatch endonuclease Vsr |
? | NC_000913 | 2041379 = | 0 (0.000) | coding (5/651 nt) | zinT | metal‑binding protein ZinT |
CCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAAGCGAGTAAATGAATCCCCTGCGTGTCGATCTGCGCGCTGGCACCTTCGCCGCAGATCCACTCTTCCAGACGCTCGGTAAGCGCTTCATCCGTCAGCTTCTCGCGCCCACGTAACGCGCACTCCCAGACAATCAATACGCGCCAGCCGAGTTCCTGCAAGCGACTGATATCGCGGCGATCGCGCTCAACATTTTTACCTATCTTCTCCAGCCAGAACTCGGTTCGAGTCGCAGGCACTTTAAA > NC_000913/2030215‑2030693 | acaTCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTAAGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGGCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGAACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTTTTACCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttac > 2:201449‑M1/2‑236 (MQ=255) aaTGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttatt > 1:179345‑M1/1‑207 (MQ=255) aGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAATTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagc < 1:59523‑M1/251‑51 (MQ=255) cGCCTCCAGCTACGCTTACGTTAACGCTGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTTTTCGCGGTGGTCATGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCATAGCCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgcttgaggtgtctttattgttagcgctcctgcct < 1:261963‑M1/250‑61 (MQ=255) cGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgcc < 1:79438‑M1/249‑60 (MQ=255) ccaGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgc < 1:116593‑M1/251‑67 (MQ=255) gCTTACGTTAACCCGGTGCTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGACGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtggctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcat > 2:394649‑M1/1‑177 (MQ=255) ggtggtCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGTCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttt < 2:410353‑M1/225‑63 (MQ=255) ggtggtCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttt > 1:410353‑M1/1‑163 (MQ=255) ggtggtCGCGGTCATTCTGGGTCCGGGCCTGGGTGGCGAAACACTGGCGAAGATTGAGTGGCTGGCGCTCGGCGAAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACACGTAGTTGCGCCGGTTAATCGGGACGCATCAcgattcgtctttacaaaatggatgttgcttttggtgtctttattgttagagctcctgccttttcgcatggtcataaatcacacggca > 2:30034‑M1/1‑163 (MQ=255) ggTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtcttt < 1:291176‑M1/195‑42 (MQ=255) ggTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtcttt > 2:291176‑M1/1‑154 (MQ=255) gTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGACGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgatttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaac > 1:270855‑M1/1‑153 (MQ=255) gCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttatttttagcgctcct < 2:184440‑M1/204‑57 (MQ=255) gggTAAGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTGCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtatttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaaacccttaacagaggtcg > 2:31465‑M1/1‑145 (MQ=255) ggACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACCGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcggctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgtt < 2:303155‑M1/185‑48 (MQ=255) ggACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACAGGTCACGTTGGGCAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGCTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgtt > 1:303155‑M1/1‑138 (MQ=255) gggTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAAGGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacgacaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctg < 2:315238‑M1/250‑118 (MQ=255) ggTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgct < 2:179345‑M1/251‑120 (MQ=255) gTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgcta < 1:219229‑M1/251‑121 (MQ=255) gTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgcta < 1:207778‑M1/251‑121 (MQ=255) aaaCACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgcacaaaaagctgctaatggtg > 2:258871‑M1/1‑125 (MQ=255) aTTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgcc < 1:430304‑M1/251‑141 (MQ=255) aTGGCTGGGGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTCCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccgtttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgt < 2:439486‑M1/251‑146 (MQ=255) tggcGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaa > 1:214731‑M1/1‑101 (MQ=255) aCGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatcc > 1:334441‑M1/1‑63 (MQ=255) gggAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTNGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgttt < 2:217015‑M1/250‑193 (MQ=255) gggAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGGAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgttt < 2:336190‑M1/250‑193 (MQ=255) gAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgtttatc > 2:331188‑M1/1‑56 (MQ=255) gAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgatttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcctggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgtttatc > 1:415173‑M1/1‑56 (MQ=255) aaTATCTCTACACGGCAAAACCCGTCGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttcacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgcccagcaactgggaaggaggctggcaagccgtttatcatt > 2:328785‑M1/1‑53 (MQ=255) ctTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgtttatcctttactgc > 2:286431‑M1/1‑46 (MQ=255) tCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgtttatcctttactgca < 1:87697‑M1/249‑206 (MQ=255) ggCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgtttatcctttactgcaaagtgg > 1:139965‑M1/1‑40 (MQ=255) aaCCCTTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATTAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcattgactgggatggagtctggcaatccgtttatcctttactgcaaagtggcaaac < 1:201449‑M1/251‑217 (MQ=255) tGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgtttatcctttactgcaaagtggcaaacttgaccccg < 2:415173‑M1/250‑226 (MQ=255) cAGTTATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgttgatcctttactgcaaagtggcaaactttaccccgtctttc < 2:51108‑M1/251‑232 (MQ=255) tATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgcta > 2:384105‑M1/1‑16 (MQ=255) tATTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgcta < 1:384105‑M1/136‑121 (MQ=255) aTTCAGGACGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgtttatcctttactgcaaagtggcaaacttgaccccgtctttcaga > 1:288768‑M1/1‑15 (MQ=255) cAGGACGCATCTcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtacaaaaccgaacgctcagtgactgggatggagtctggcaatccgtttatcctttactgcaaagtggcaaacttgaccccgtcttgcagaagaa < 2:413326‑M1/250‑239 (MQ=255) aCGCATCAcgattcgtctttacaaactggctgttgctttaggtgtctttattgttagcgctcctgccttttcgcatggtcatcactcacacggcaagcccttaacagaggtcgaacaaaaagctgctaatggtgtttttgatgatgccaatgtgcaaaaccgaacgctcagtgactgggattgagtctggcaatccgtttatcctttactgcaaagtggcaaacttgaccccgtctttcagaagaaagcgg < 1:57496‑M1/251‑244 (MQ=255) | CCATCAACGCTTATATGTATTTAATCCGTAATGTCAGTCCGGCTCTCGCCACCAGCTACGCTTACGTTAACCCGGTGGTCGCGGTCTTGCTGGGTACGGGACTGGGTGGAGAAACACTGTCGAAGATTGAATGGCTGGCGCTCGGCGTAATTGTCTTCGCGGTGGTACTGGTCACGTTGGGAAAATATCTCTTCCCGGCAAAACCCGTAGTTGCGCCAGTTATTCAGGACGCATCAAGCGAGTAAATGAATCCCCTGCGTGTCGATCTGCGCGCTGGCACCTTCGCCGCAGATCCACTCTTCCAGACGCTCGGTAAGCGCTTCATCCGTCAGCTTCTCGCGCCCACGTAACGCGCACTCCCAGACAATCAATACGCGCCAGCCGAGTTCCTGCAAGCGACTGATATCGCGGCGATCGCGCTCAACATTTTTACCTATCTTCTCCAGCCAGAACTCGGTTCGAGTCGCAGGCACTTTAAA > NC_000913/2030215‑2030693 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |