| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,421,374 | C→T | S17L (TCA→TTA) | yhdY → | putative ABC transporter membrane subunit YhdY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,421,374 | 0 | C | T | 98.5% | 233.7 / NA | 67 | S17L (TCA→TTA) | yhdY | putative ABC transporter membrane subunit YhdY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (33/33); minor base G (1/0); total (34/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
TCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATCGCGATCGTTGAACGCTAAGGAGTCATGATGACAAAAGTATTGCTGTCTCATCCCCCGCGCCCGGCGAGCCATAACTCAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCTTTACCCACACGACCAACGCTGGCG > NC_000913/3421130‑3421620 | gtgaatgacctctatgaggtggtactggctgaagtagaacagcccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcctcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcctgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcctggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCcg > 2:411488‑M2/238‑251 (MQ=255)gtgaatgacctctatgagctggtactggctgaagtagaacagaccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatagactatttcaggttagctaactgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCcg > 2:350401‑M2/238‑251 (MQ=255) gacctctatgagctggcactggctgaagtagaacagcccctgttgcacatggtgatgcaatacacccgtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcacccgtggaacgctgcgcaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaactcaggttagctaaatgcttgattaaaaaagcgctactcggcatgggggagcgccttttttttagttttcacaacggcCATAACTTAAGCCGCGCGAt > 2:147100‑M2/232‑251 (MQ=255) gtagaacagcccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTtctc < 1:441938‑M2/47‑1 (MQ=255) tagaacagcccctgttggacatggtgatgcaatacacccgtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgctgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCGGTTCTcc > 2:284299‑M2/204‑251 (MQ=255) agaacagcccctgttggagatggtgatgcaatacacccgtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctaatcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATATGTTCTcc > 2:421114‑M2/203‑250 (MQ=255) tgatgcaatacacccgtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACt > 1:99108‑M2/180‑251 (MQ=255) aatacacccgtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgtgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcctggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCGGACTATTGGc > 2:385515‑M2/174‑251 (MQ=255) acacccgtggtaaccagacccgtgctgcgcggatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGc < 2:293991‑M2/81‑1 (MQ=255) gtggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATACCTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAgctggcgc > 1:223509‑M2/165‑218 (MQ=255) gnggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGc < 2:223509‑M2/57‑1 (MQ=255) ggtaaccagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGtt < 2:62378‑M2/89‑1 (MQ=255) cagacccgtgctgcgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggagctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGAtgtg > 2:76954‑M2/157‑251 (MQ=255) cgctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactcattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCAGCGCGATGGGGTCGGTGCGACAACATCTGTTCTCCAGCTGAAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGGGGGAACTGATccc > 2:166660‑M2/144‑250 (MQ=255) gctgatgatgggcatcaaccgtggtacgctgngtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCAc < 2:216784‑M2/109‑1 (MQ=255) gatgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCg < 1:226743‑M2/111‑1 (MQ=255) atgatgggcatcaaccgtggtacgctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGtt > 1:211681‑M2/139‑251 (MQ=255) gctgcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAgg < 2:372070‑M2/136‑1 (MQ=255) gcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaantaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCt < 2:225213‑M2/138‑1 (MQ=255) gcgtaaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGAGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCt > 1:305491‑M2/113‑250 (MQ=255) taaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCNTTGCTGAAATGGGCCTTTTTGc > 2:249735‑M2/110‑242 (MQ=255) taaaaaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGc < 1:249735‑M2/133‑1 (MQ=255) aaaaattgaaaaaatacgacatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggggtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGGGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTAATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTgg > 2:409769‑M2/108‑251 (MQ=255) aaattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGt < 1:182798‑M2/146‑1 (MQ=255) aattgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGtt < 1:323314‑M2/147‑1 (MQ=255) tgaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTTCTGAACTGGGCCTTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGc > 2:427403‑M2/102‑251 (MQ=255) gaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCt < 1:188423‑M2/151‑1 (MQ=255) gaaaaaatacggcatgaactaagtcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGTGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCGGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGGTTCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGc < 2:431656‑M2/150‑1 (MQ=255) aaaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCt < 2:94833‑M2/151‑1 (MQ=255) aaaaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTc < 1:462509‑M2/152‑1 (MQ=255) aaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTggg < 1:466760‑M2/124‑1 (MQ=255) aaaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTggg > 2:466760‑M2/98‑221 (MQ=255) aaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAAc < 1:350397‑M2/155‑1 (MQ=255) aaatacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctacgcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGAGCCCACCGGTGCTGAACTGGGCAGTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAAc < 2:52408‑M2/155‑1 (MQ=255) atacggcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtaacaacggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAAcgc > 2:316623‑M2/95‑251 (MQ=255) gcatgaactaattcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGcc > 1:347462‑M2/90‑251 (MQ=255) tcaggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACaaa > 1:179090‑M2/78‑250 (MQ=255) caggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggtgaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACaaaa < 1:195772‑M2/174‑1 (MQ=255) ggttagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGcc < 1:167251‑M2/177‑1 (MQ=255) tagctaaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGTTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCgg < 2:476214‑M2/179‑1 (MQ=255) aaatgcttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTg < 2:377898‑M2/185‑1 (MQ=255) ttgattaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCCGGCTAACTGGGTTGGCTCCACGCGTTCCGCCTGCACAAACGCCGGTGCCTGTTGGGt > 2:264363‑M2/61‑251 (MQ=255) ttaaaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgacacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGGTGGTGTGGGAGCGAAACAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGAGCCTGTTGGGTCTTc > 1:411138‑M2/57‑251 (MQ=255) aaaaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATATCCTGCTGACTATTGGCTGCCTATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATc > 1:235708‑M2/54‑251 (MQ=255) aaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCAc > 2:106488‑M2/52‑160 (MQ=255) aaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCAc < 1:106488‑M2/109‑1 (MQ=255) aaggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCa < 2:211681‑M2/200‑1 (MQ=255) aggcgctactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCac < 2:206855‑M2/201‑1 (MQ=255) tactcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCacgaacg > 1:119577‑M2/45‑250 (MQ=255) actcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACTCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGAt < 1:284299‑M2/208‑1 (MQ=255) actcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCacgaacg < 1:401765‑M2/206‑1 (MQ=255) actcggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGAt > 2:163498‑M2/44‑251 (MQ=255) ggcatggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGAGCGAAAAAATCTGTTCTACAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTgg > 1:27242‑M2/40‑251 (MQ=255) tggggaagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTc > 1:190928‑M2/36‑249 (MQ=255) aagcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCCGTTtat > 1:487362‑M2/31‑251 (MQ=255) gcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGtt < 1:224666‑M2/187‑1 (MQ=255) gcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGtt > 2:224666‑M2/29‑215 (MQ=255) gcgccttttttataggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTtatgt < 1:421114‑M2/223‑1 (MQ=255) tttataggtggcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGGTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGGTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCt < 2:375701‑M2/230‑1 (MQ=255) ataggtgtcacaaaggtCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTTCTGACTATTGGCTGCATATGGTGGGTGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGTTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGGCTTCATCCACGAACGATTTGgtcagtttatgtatgatcttta < 1:147100‑M2/233‑8 (MQ=255) aggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCatat > 2:133220‑M2/16‑100 (MQ=255) aggtgtcacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCGGACTATTGGCTGCatat < 1:133220‑M2/85‑1 (MQ=255) cacaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAACAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCTTTacccacccg > 2:139888‑M2/10‑247 (MQ=255) acaaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCTTTACCCACACGAc < 2:68562‑M2/243‑1 (MQ=255) acaggaCATAACTGAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAACTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACGGATCCCACTGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAAAGCGAGCCTACTGCACACAAGCCGGAGCCTGTTGGGTCTTCATCAACGAACGTTTTGGTAAGTTTATGAATTGTCTTTCCCCCCACGaca > 2:320995‑M2/7‑249 (MQ=255) aaaggaCATAACTTAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCTTTACCCACACGAcc > 2:392084‑M2/7‑250 (MQ=255) aaCTTAAGCCGCGCGATGGAGTGGTCGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGCTGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGCTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCCTCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGATTTACCCACACGACCAACGCTGGCg > 2:285476/1‑251 (MQ=255) | TCCTCTCTTGCCGCCGCTATTGGCTATCCCGATATGGTTTCGCTGTTTGCCGGCACCGTGCTGAATCAGACGGGGCAAGCCATCGAGACGATAGCCATGACCATGTCGGTCTATCTGATTATCAGCCTGACTATCTCGCTGCTGATGAATATCTATAACCGCCGCATCGCGATCGTTGAACGCTAAGGAGTCATGATGACAAAAGTATTGCTGTCTCATCCCCCGCGCCCGGCGAGCCATAACTCAAGCCGCGCGATGGTGTGGGTGCGAAAAAATCTGTTCTCCAGCTGGAGCAATAGCCTGCTGACTATTGGCTGCATATGGTTGATGTGGGAACTGATCCCACCGTTGCTGAACTGGGCATTTTTGCAGGCTAACTGGGTTGGCTCAACGCGTGCCGACTGCACAAAAGCCGGTGCCTGTTGGGTCTTCATCCACGAACGATTTGGTCAGTTTATGTATGGGCTTTACCCACACGACCAACGCTGGCG > NC_000913/3421130‑3421620 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |