| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,252,464 | T→C | I54T (ATC→ACC) | yhaH → | putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,252,464 | 0 | T | C | 96.4% | 182.3 / NA | 55 | I54T (ATC→ACC) | yhaH | putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (27/26); minor base A (1/1); total (28/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 | |||||||||||
GAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTTGCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTAAAAAATTATGTCGGTTTCCGGGGTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGC‑GAAAACCGCTTTGGACCAGATCCAAAACTGGAACCTTAAAACAAATCTGCTCGCCGGATGTCTGACTCATCCGGCTTT > NC_000913/3252219‑3252708 | gAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTTGCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTAAAAAATTATGTCGGTTTCCGGGGTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCACCCTg > 1:259480/1‑250 (MQ=255) atatTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTTGCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTAAAAAATTATGTCGGTTTCCGGGGTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCACCCTGACGACa > 2:137764/1‑250 (MQ=255) atTTACTTCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTTGCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTAAAAAATTATGTCGGTTTCCGGGGTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCACCCTGACGACAAt < 1:298166/250‑1 (MQ=255) atTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTTGATGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTAAAAAATTATGTCGGTTTCCGTGGTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTCCGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCACACTGACGACAAt < 1:53583/250‑1 (MQ=255) 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GAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTTGCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTAAAAAATTATGTCGGTTTCCGGGGTCGTGCGCGGCGCAAAGAGTACTGGATGTTTATTCTGGTCAACATCATCTTTACGTTCGTGCTGGGGCTGCTGGATAAAATGTTAGGCTGGCAACGCGCTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCGGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGC‑GAAAACCGCTTTGGACCAGATCCAAAACTGGAACCTTAAAACAAATCTGCTCGCCGGATGTCTGACTCATCCGGCTTT > NC_000913/3252219‑3252708 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |