| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,489,242 | Δ19,001 bp | [yfdV]–[fryB] | 17 genes [yfdV], oxc, frc, yfdX, ypdI, yfdY, lpxP, ypdK, alaC, pyrS, pyrR, ypdC, fryA, ypdE, ypdF, fryC, [fryB] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2489242 | 2508242 | 19001 | 39 [0] | [0] 39 | [yfdV]–[fryB] | [yfdV],oxc,frc,yfdX,ypdI,yfdY,lpxP,ypdK,alaC,pyrS,pyrR,ypdC,fryA,ypdE,ypdF,fryC,[fryB] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2489241 | 0 (0.000) | 39 (0.600) | 35/478 | 0.4 | 100% | intergenic (‑73/+1) | yfdE/yfdV | acetyl‑CoA:oxalate CoA‑transferase/putative transport protein YfdV |
| ? | NC_000913 | 2508243 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+218) | fryB/glk | putative PTS enzyme IIB component FryB/glucokinase | |||||
CGTCGCGTGATTCGAAACGTTCGTTATCTTCCGGGGTAACTGCCACGGAGTGGATGATGATGGTCGCTTCGGCGATATCCTGCGCCGTCAGGCGATTCTGGATACCGTCCGCGCCCTGGGTTTCAATTTTCACTTCATAACCGGCTTCTACCGCCGCTTCTTCCAGCGCCTGAGCGGCCATAAAGGTGTGAGCCAGGCCCATCGGGCAGGCACATAAGGCAATCAGTTTCTTACTCATCGTTAATTCCTCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCG > NC_000913/2508005‑2508487 | gggaccaaatgtgcgggtatcatcaccatgacccggcggctcaactttaattacccttgcgcccatattacaaagaagttgagttccgaaaggtccattaaggacatgtgtcatatcgataactaataagccttcaaacggccctttgctttcattatttgtcatttgcttatgccttgaaaaaagccgaaggtgaaaagacacttcggcatttatgtaaaatcaataacatgattaaCGTTAATTCCTCg > 1:431717‑M2/239‑251 (MQ=255) ggaccaaatgtgcgggtatcatcaccatgacccggcggctcaactttaattacccttgcgcccatattacaaagaagttgagttccgaaaggtccattaaggacatgtgtcatatcgataactaataagccttcaaacggccctttgctttcattatttgtcatttgcttatgccttgaaaaaagccgaaggtgaaaagacacttcggcatttatgtaaaatcaataacatgattaaCGTTAATTCCTCGt < 2:383326‑M2/14‑1 (MQ=255) accaaatgtgcgggtatcatcaccatgacccggcggctcaactttaattacccttgcgcccatattacaaagaagttgagttccgaaaggtccattaaggacatgtgtcatatcgataactaataagccttcaaacggccctttgctttcattatttgtcatttgcttatgccttgaaaaaagccgaaggtgaaaagacacttcggcatttatgtaaaatcaataacatgattaaCGTTAATTCCTCGTTc < 1:101978‑M2/16‑1 (MQ=255) gtgcgggtatcatcaccatgacccggcggctcaactttaattacccttgcgcccatattacaaagaagttgagttccgaaaggtccattaaggacatgtgtcatatcgataactaataagccttcaaacggccctttgctttcattatttgtcatttgcttatgccttgaaaaaagccgaaggtgaaaagacacttcggcatttatgtaaaatcaataacatgattaaCGTTAATTCCTCGTTCAGTGAt > 1:99584‑M2/229‑250 (MQ=255) 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2:344903‑M2/58‑1 (MQ=255) attacccttgcgcccatattacaaagaagttgagttccgaaaggtccattaaggacatgtgtcatatcgataactaataagccttcaaacggccctttgctttcattatttgtcatttgcttatgccttgaaaaaagccgaaggtgaaaagacacttcggcatttatgtaaaatcaataacatgattaaCGTTAATTCCTCGTTCAGTGATAGTCGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAGAACAAATCGcc < 2:35542‑M2/62‑1 (MQ=255) catattacaaagaagttgagttccgaaaggtccattaaggacatgtgtcatatcgataactaataagccttcaaacggccctttgctttcattatttgtcatttgcttatgccgtgaaaaaagccgaaggtgaaaagacacttcggcatttatgtaaaatcaataacatgattaaCGTTAATTCCTCGTTCAGTGATAGTCGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAGAACAAATCGCCGTTACCAGACAaat < 2:262636‑M2/76‑1 (MQ=255) attacaaagaagttgagttccgaaaggtccattaaggacatgtgtcatatcgataactaataagccttcaaacggccctttgctttcattatttgtcatttgcttatgccttgaaaaaagccgaaggtgaaaagacacttcggcatttatgtaaaatcaataacatgattaaCGTTAATTCCTCGTTCAGTGATAGTCGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAGAACAAATCGCCGTTACCAGACAaataat > 1:130148‑M2/173‑251 (MQ=255) 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CGTCGCGTGATTCGAAACGTTCGTTATCTTCCGGGGTAACTGCCACGGAGTGGATGATGATGGTCGCTTCGGCGATATCCTGCGCCGTCAGGCGATTCTGGATACCGTCCGCGCCCTGGGTTTCAATTTTCACTTCATAACCGGCTTCTACCGCCGCTTCTTCCAGCGCCTGAGCGGCCATAAAGGTGTGAGCCAGGCCCATCGGGCAGGCACATAAGGCAATCAGTTTCTTACTCATCGTTAATTCCTCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTAAGGTCTGGCG > NC_000913/2508005‑2508487 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |