| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 167,401 | Δ5,915 bp | fhuA–[fhuB] | fhuA, fhuC, fhuD, [fhuB] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 167401 | 173315 | 5915 | 56 [0] | [0] 56 | fhuA–[fhuB] | fhuA,fhuC,fhuD,[fhuB] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 167400 | 0 (0.000) | 56 (0.860) | 52/478 | 0.1 | 100% | intergenic (+136/‑84) | mrcB/fhuA | peptidoglycan glycosyltransferase/peptidoglycan DD‑transpeptidase MrcB/ferrichrome outer membrane transporter/phage receptor |
| ? | NC_000913 | 173316 = | 0 (0.000) | coding (1855/1983 nt) | fhuB | iron(III) hydroxamate ABC transporter membrane subunit | |||||
TCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCAATGGCGCGTTCCAAAACTGCTCAGCCAAAACACTCACTGCGTAAAATCGCAGTTGTAGTAGCCACAGCGGTTAGCGGCATGTCTGTTTATGCACAGGCAGCGGTTGAACCGAAAGAAGACACTATCACCGTTACCGCTGCACCTGCGCCGCAAGAAAGCGCAT > NC_000913/167156‑167646 | tCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactg > 1:308450‑M1/1‑245 (MQ=255) 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tCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCTAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggcgctgctgtcaacctttatcggcgcgccatattttatctatttgttgagaaagcagagacgttaatttttccatataacggccctgtacgcctgtcaggataaagcgattacgcgaaaacggattcccgcagcgccgctgtcgcgtcttatc > 2:498278‑M1/1‑35 (MQ=255) cAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCTAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtcaacctttatcgtcgcgccatattttatctatttgttgagaaagcagagccgttaatttttccatataacggccctgtacgcctggacggataaagcggttacgcgaccaaggatgcccgctgcgccgctggcgcgtcttatcg > 2:330523‑M1/1‑34 (MQ=255) ggAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtcaacctttatcggcgcgccatattttatctatttgttgagaaagcagagccggtaatttttccatataacggccctgtacgcctggacggataaagcgtttacgcgacaacggatgcccgatgcgacgctggcgcgtcttatccgg > 2:379205‑M1/1‑32 (MQ=255) aaCGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtcaacctttatcggcgcgccatattttatctatttgttgagaaagcagagccgttaatttttccatataacggccctgtacgcctggaaggataaagcgtttacgcgacaacggatgcccgatgcgccgctggcgcgtcttatcgggcc > 1:86909‑M1/1‑30 (MQ=255) cGCTCCGATTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggcttctgtcaacctttatcggcgcgccatattttatctttttgttgagaaatcagagccgttaatttttccatataacggccctgtacccctgggccgataaaaagtttacgccacaacggatgcccgatgcgacgctggcgcgtcttttcgggact > 1:93178‑M1/1‑28 (MQ=255) aTTGCGTACCGCTTGCGAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtcaacctttatcggcgcgccatattttatctatttgttgagaaagcagagccgttaatttttccctataacggccctgtacgcctggacggaaaaagcgtttacgcgacaacggatgcccgatgcgacgctggcgcggcttatcgggcctacaaacgg > 1:106064‑M1/1‑21 (MQ=255) gAACCttactgctggtgttcgctgactggtgtgggcggatggtgctgtttccattccagatcccggcggggctgctgtcagcctttctcggcgcgccatattttatctatttgttgagaaagcagagccgttaattttttcatataacggccctgtacgcctgggcggataaagcgtttacgcgacaaccgatgcccgatgcgacgctggcccgtcttatcgggcctacaaacggcccccccacgtaaggc > 1:3573‑M1/1‑5 (MQ=255) | TCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGTTTCGAATATTATCTTATCTTTATAATAATCATTCTCGTTTACGTTATCATTCACTTTACATCAGAGATATACCAATGGCGCGTTCCAAAACTGCTCAGCCAAAACACTCACTGCGTAAAATCGCAGTTGTAGTAGCCACAGCGGTTAGCGGCATGTCTGTTTATGCACAGGCAGCGGTTGAACCGAAAGAAGACACTATCACCGTTACCGCTGCACCTGCGCCGCAAGAAAGCGCAT > NC_000913/167156‑167646 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |