| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,708,172 | 0 | A | . | 94.6% | 235.4 / 6.1 | 56 | intergenic (‑467/+444) | dppA/proK | dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein/tRNA‑Pro |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base . (29/24); total (31/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
CACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATA‑TTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTAT‑GCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGAT‑ATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACGTCGAGTCGAACCTCCCTGCCCCCGGAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCT > NC_000913/3707926‑3708422 | cacCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATA‑TTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTAT‑GCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGAT‑ATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAA‑GAttt < 2:340828/251‑1 (MQ=255) 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acacacaAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATA‑TTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTAT‑GCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGAT‑ATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAA‑GATTTAAGCAAATATAAAAAAAg < 1:260144/251‑1 (MQ=255) cacacaAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATA‑TTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTAT‑GCATTTAATGACAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGAT‑ATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAA‑GATTTAAGCAAATATaaaaaa > 1:204468/1‑248 (MQ=255) cacaAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATA‑TTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTAT‑GCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGAT‑ATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAA‑GATTTAAGCAAATATAAAAAAAGAc > 1:98742/1‑250 (MQ=255) 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aaGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACCATGGCCGGCACATTTGCCTGCTGCGACCCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACGTCGAGTCCACCCTCCCCGCCCCCCCAGGTTCTCCTCCTCCTGAGCCGCCGATGCCAAAAAGcc > 2:67088/1‑251 (MQ=255) aGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACGTCGAGTCGAACCTCCCTGCCCCCGGAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCt < 1:353463/251‑1 (MQ=255) | CACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATA‑TTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTAT‑GCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGAT‑ATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGATAGTGAGATATGGGGCGCAAATTTGGCAGGGAAATGTGTGTCGTGTAGGTCGAATAAGGCGGTCGCGCCGCATCCGACAATGGCCGGCACATTTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACGTCGAGTCGAACCTCCCTGCCCCCGGAGGTTCTCATCCTCATGAGCTGCAGATGCAAAAAAGCCT > NC_000913/3707926‑3708422 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |