| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,985,726 | A→G | intergenic (‑134/‑121) | yqeF ← / → yqeG | putative acyltransferase/putative transporter YqeG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,985,726 | 0 | A | G | 99.0% | 375.4 / ‑2.8 | 98 | intergenic (‑134/‑121) | yqeF/yqeG | putative acyltransferase/putative transporter YqeG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (51/46); minor base . (0/1); total (51/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.86e-01 | |||||||||||
TAACGCTTTCACGACCAGACTACCAAGTTCCACGGCGGAATGACCCGCTAACGCAC‑CACGAAAGCAGCCGATAGGTGTCCGTAACGCCCCGACAATCACAACGTCTTTCATCACAACCTCGCACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAAGGTTTG‑CAACCACTAACCCACCAATAGAGGGGTAGATAGGGCGTTAATCTCCCATACTTAACCTGGTTTATGGTAAATTGCCCTCCATTTTGTTTAATTTGTAGATGATACGTTCAGATAATGTCTAATATTTGGTCTAAAGAAGAAACTCTGTGGAGTTTCGCGCTCTACGGCACAGCCGTTGGTGCAGGCACGCTCTTCCTTCCTATTCAGTTAGGTTCGGCAGGGGCTGTGGTCCTGTTT > NC_000913/2985482‑2985969 | tAACGCTTTCACGACCAGACTACCAAGTTCCACGGCGGAATGACCCGCTAACGCAC‑CACGAAAGCAGCCGATAGGTGTCCGTAACGCCCCGACAATCACAACGTCTTTCATCACAACCTCGCACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGttt < 2:273554/250‑1 (MQ=255) cACGACCAGACTACCAAGTTCCACGGCGGAATGACCCGCTAACGCAC‑CACGAAAGCAGCCGATAGGTGTCCGTAACGCCCCGACAATCACAACGTCTTTCATCACAACCTCGCACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCGGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTG‑CAACCACTa < 1:89506/251‑1 (MQ=255) cGACCAGACTACCAAGTTCCACGGCGGAATGACCCGCTAACGCAC‑CACGAAAGCAGCCGATAGGTGTCCGTAACGCCCCGACAATCACAACGTCTTTCATCACAACCTCGCACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTG‑CAACCACTAAc > 1:407876/1‑251 (MQ=255) cccAGACTACCAAGGTCACCGGCGGAATGACCCGCTACCG‑ACACACTAAAGCAGCCGATAGGTGTTCGTAACGCCACGACAATCACAACGTCTTTCATCAAAACCTCGCACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGTCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGACACGTA‑GGTTTGGCACCCAATAAccc < 2:610536/250‑1 (MQ=255) aGACTACCAAGTTCCACGGCGGAATGACCCGCTAACGCAC‑CACGAAAGCAGCCGATAGGTGTCCGTAACGCCCCGACAATCACAACGTCTTTCATCACAACCTCGCACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTG‑CAACCACTAACccacc > 2:169819/1‑251 (MQ=255) aGACTACCAAGTTCCACGGCGGAATGACCCGCTAACGCAC‑CACGAAAGCAGCCGATAGGTGTCCGTAACGCCCCGACAATCACAACGTCTTTCATCACAACCTCGCACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTG‑CAACCACTAACccacc > 1:808739/1‑251 (MQ=255) aGACTACCAAGTTCCACGGCGGAATGACCCGCTAACGCAC‑CACGAAAGCAGCCGATAGGTGTCCGTAACGCCCCGACAATCACAACGTCTTTCATCACAACCTCGCACCAATTAACAGTGCAATAGTAAATGATTGTTAATTACAGTTATCTTAATTGTTTAAAAAAAGTGATTTTTATCACAAAGGAAATATGCCTGAGCAGCAGTCAGAGACATAACTGGCACGTAGGGTTTG‑CAACCACTAACccacc > 2:377750/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |