Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,745,089 | 0 | A | C | 32.4% | 313.3 / 35.8 | 148 | V84G (GTG→GGG) | trmD | tRNA m(1)G37 methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (78/20); new base C (2/45); total (80/68) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.74e-19 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
GTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTCCCGGAATAAACCGGGAAACGGAGTCAATCAGCGTCATTGCTGGTAACTCACCACCACTGAGAACGTAATCGCCGATTGACCATTCTTCGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCT‑TCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAATTTTTGATTCGTTGCC‑AGTTCGCTGACGCCCGCTTGATCAAGCTTGCGTCCCTG‑TGGT‑GACAGATAAATCACCTTT‑GCGCCTTCACCCGCCGCGGCTTTTGCTGCATGAATGGCGTCCCGCAAGGGTTGCACCATCATTAACATCCCCGGTCCGCCGCCGTAAGGACGATCGTCCACGGTACGGTGCCGGTCATGCGTGAAGTCGCGAGGACTCCAGCTCTGGATGCTCAGCAGGCCATTTTTAACTGCCCGGCCAGTTACCCCGTAATCGGTAATTGCGCGGAACATTTCAGGAAACAGGCTAATTATGCCAATCC > NC_000913/2744840‑2745335 | gTTGCCGAGGCTTCATGTCCCAGTACTCCCGGAATAAACCGGGAAACGGAGTCAATCAGCGTCATTGCTGGTCACTCACCACCACTGAGAACGTAATCGCCGATTGACCATTCTTCGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCT‑TCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAATTTTTGATTCGTTGCC‑AGTTCGCTGACGCCCGCTTGATCAAGCTTGCGTCCCTG‑TGGT‑GACAGATAAATCAc > 2:965913/1‑251 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |