| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,498,768 | 9486 bp→CCC | [pyrS]–fryB | [pyrS], pyrR, ypdC, fryA, ypdE, ypdF, fryC, fryB | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2498768 | 2508253 | 9486 | 53 [0] | [0] 52 | [pyrS]–fryB | [pyrS],pyrR,ypdC,fryA,ypdE,ypdF,fryC,fryB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2498767 | 0 (0.000) | 52 (0.340) +CCC |
49/482 | 1.0 | 100% | coding (97/1698 nt) | pyrS | sensor histidine kinase PyrS |
| ? | NC_000913 | 2508254 = | 0 (0.000) | intergenic (‑12/+207) | fryB/glk | putative PTS enzyme IIB component FryB/glucokinase | |||||
ACGTCGCGTGATTCGAAACGTTCGTTATCTTCCGGGGTAACTGCCACGGAGTGGATGATGATGGTCGCTTCGGCGATATCCTGCGCCGTCAGGCGATTCTGGATACCGTCCGCGCCCTGGGTTTCAATTTTCACTTCATAACCGGCTTCTACCGCCGCTTCTTCCAGCGCCTGAGCGGCCATAAAGGTGTGAGCCAGGCCCATCGGGCAGGCACATAAGGCAATCAGTTTCTTACTCATCGTTAATTCCTCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTA > NC_000913/2508004‑2508477 | cagaagtgcattatcaagagatgcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaagtgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttcttcctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccc < 2:597895‑M2/1‑1 (MQ=255) tatcaagagatgcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGAt < 2:440338‑M2/11‑1 (MQ=255) gagatgcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGAc < 1:1167396‑M2/18‑1 (MQ=255) gcattgctaatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctgtctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGt < 1:1006249‑M2/22‑1 (MQ=255) cattcaccatttatctttccagcccctcttaaaatggtggtttttcctcaaaaacggcctgttgggcatcagccttcaggttacctatcatataggttgaatccttatgcagagtcacccgtgcacgaaatattaatcatgctgcaggcggtcttcgaccgtgcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTAt < 2:775729‑M2/30‑1 (MQ=255) aatacaccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATg < 2:37234‑M2/31‑1 (MQ=255) ccaccatttatctatcaacccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagagttttaatccttattcagagtcccccgtgcccgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgccggttctttctcagccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTGGCCGAGTGAAATTATGAAc < 2:1004991‑M2/34‑1 (MQ=255) caccatttatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttaacttcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGCTAGTTGACGAGTGAACTTATGAACg > 2:348303‑M2/217‑251 (MQ=255) tatctatcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCaaa > 1:915450‑M2/210‑250 (MQ=255) atcaatccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAAc < 1:71802‑M2/43‑1 (MQ=255) atccccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGGGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGcc > 1:524917‑M2/201‑251 (MQ=255) ccttttaaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGACATTATGAACGTGCAAAACCAATCGCCGtt > 2:238444‑M2/197‑250 (MQ=255) taaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATTGTTGAc > 2:922713‑M2/192‑209 (MQ=255) taaaattgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGAc < 1:922713‑M2/18‑1 (MQ=255) attgtggtttttccccaaaaccggcctgatggtcaccagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttactcagagtcgcccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcgtcgatcgggcagcgttaatgcttacctgcctgttctttcgcattcgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACaaa < 1:251919‑M2/64‑1 (MQ=255) tgtggtttttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggccttcggtcgggccgcgttaatgcttatctgcccgttctttctcatccgtatccctctgtttcgcgcccCGTTGAAGGATAGTTGCCGAGGGAAATTATGAACGTGCAAAATAAATCGCCGTTACCAGACAaat > 1:735489‑M2/186‑250 (MQ=255) tttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACg > 2:389579‑M2/179‑197 (MQ=255) tttcctcaaaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACg < 1:389579‑M2/19‑1 (MQ=255) aaaacggcctgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTgg > 1:860514‑M2/171‑249 (MQ=255) tgctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATcc > 1:106393‑M2/162‑251 (MQ=255) gctggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcgcccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttcgttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATc < 2:866875‑M2/89‑1 (MQ=255) tggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGc > 1:71331‑M2/159‑251 (MQ=255) ggtcatcagccttcaggttacctatcatagaggttttatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCt < 1:613644‑M2/94‑1 (MQ=255) tcatcagccttcaggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGt > 2:821016‑M2/156‑251 (MQ=255) caggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTa < 1:179473‑M2/29‑1 (MQ=255) caggttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTa > 2:179473‑M2/145‑173 (MQ=255) gttacctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggccgcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACACATCGCCGTTACCAGACAAAAAATGCATTTACTGGCGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGGGTGACg > 2:1196834‑M2/142‑251 (MQ=255) acctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCa < 2:915450‑M2/112‑1 (MQ=255) cctatcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaaagcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACCAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAgg > 1:395416‑M2/138‑251 (MQ=255) atcatagaggtttaatccttattcagagtcacccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTc < 2:106393‑M2/116‑1 (MQ=255) 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ccgtgcacgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcagccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAAt < 1:238444‑M2/149‑1 (MQ=255) acgaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTg < 1:827967‑M2/155‑1 (MQ=255) gaaatattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGt > 1:553054‑M2/95‑250 (MQ=255) atattcaacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTTTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATg > 2:968977‑M2/92‑250 (MQ=255) aacatgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttctctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACCAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGACGTGGGGCCCAGGTCGTCCTTTTGAGGGGGCACCAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTaa > 1:509442‑M2/86‑250 (MQ=255) tgctgctggcggtcttcgatcgggcagcgttaatgcttatctgcctgttctttctcatccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTaaa > 2:317694‑M2/82‑247 (MQ=255) 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catccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCt < 2:263654‑M2/223‑1 (MQ=255) catccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATGTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCt < 1:348303‑M2/223‑1 (MQ=255) atccgtatccgcctgtttcgcgcccCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTa > 2:239015‑M2/26‑249 (MQ=255) | ACGTCGCGTGATTCGAAACGTTCGTTATCTTCCGGGGTAACTGCCACGGAGTGGATGATGATGGTCGCTTCGGCGATATCCTGCGCCGTCAGGCGATTCTGGATACCGTCCGCGCCCTGGGTTTCAATTTTCACTTCATAACCGGCTTCTACCGCCGCTTCTTCCAGCGCCTGAGCGGCCATAAAGGTGTGAGCCAGGCCCATCGGGCAGGCACATAAGGCAATCAGTTTCTTACTCATCGTTAATTCCTCGTTCAGTGATAGTTGACGAGTGAAATTATGAACGTGCAAAACAAATCGCCGTTACCAGACAAATAATGCATTTACTGGAGAATTAATCCCGCTGTACGGAAGTGTGACGCAGGTCGACCTTGTGAGGGGACACAAAGAAAAATTGAATAAACTGTATGATTTAAAAGATTATCGGGAGAGTTACCTCCCGATATAAAAGGAAGGATTTACAGAATGTGACCTA > NC_000913/2508004‑2508477 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |