New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3984447 = | 131 (0.860) | 3 (0.020) | 3/478 | 5.8 | 1.9% | coding (1561/1656 nt) | aslA | putative sulfatase AslA |
? | NC_000913 | = 4266676 | 182 (1.210) | coding (895/1080 nt) | alr | alanine racemase 1 | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
TGGCGTCTCGCCGCTGGAAGATCGCTCCACCGGTGCCGATTTTGGCTGTCAGCCAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATGATCTGCGTAGACTTAGGTCCACAGGCGCAGGACAAAGCCGGGGATCCGGTCATTTTATGGGGCGAAGGTTTGCCCGTAGAACGTATCGCTGAAATGACGAAAGTAAGCGCTTACGAACTTATTACGCGCCTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAAT > NC_000913/4266426‑4266926 | tGGCGTCTCGCCGCTGGAAGATCGCTCCACCGGTGCCGATTTTGGCTGTCAGCCAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCg > 1:710402/1‑251 (MQ=255) cGTCTCGCCGCTGGAAGATCGCTCCACCGGTGCCGATTTTGGCTGTCAGCCAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGgc < 1:493235/251‑1 (MQ=255) cgcgccgcTGGAAGATCGCTCCACCGGTGCCGATTTTGGCTGTCAGCCAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGGGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGgcgc < 2:595387/248‑1 (MQ=255) gccgcTGGAAGATCGCGCCACCGGTGCCGATTTTGGCTGTCAGCCAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAGGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGGGGAACCTGGGTAAGCGAGCGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTgg < 1:433355/251‑1 (MQ=255) ccgcTGGAAGATCGCTCCACCGGTGCCGATTTTGGCTGTCAGCCAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGc > 2:110845/1‑251 (MQ=255) tGGAAGATCGCTCCACCGGTGCCGATTTTGGCTGTCAGCCAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAA‑GCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTTGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGGTTGTCGGGCGCGGGGCGATgg > 2:1077107/1‑251 (MQ=255) aaGATCGCTCCACCGGTGCCGATTTTGGCTGTCAGCCAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGat < 1:443512/251‑1 (MQ=255) aaGATCGCTCCACCGGTGCCGATTTTGGCTGTCAGCCAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGat > 2:181688/1‑251 (MQ=255) aGATCGCTCCACCGGTGCCGATTTTGGCTGTCAGCCAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGata < 2:830965/251‑1 (MQ=255) aTCGCTCCACCGGTGCCGATTTTGGCTGTCAGCCAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGGGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATg < 1:291813/251‑1 (MQ=255) 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ggCTGTCAGCCAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATGATCTGCGTAGACTTAGGTCcac > 1:119260/1‑250 (MQ=255) ccAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATGATCTGCGTAGCCTTAg > 2:517647/1‑235 (MQ=255) ccAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATGATCTGCGTAGACTTAg < 1:517647/235‑1 (MQ=255) aGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGGTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATGATCTGCGGAGACTTAGGTCCACAGGCGCAGGAc > 1:333034/1‑250 (MQ=255) gATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATGATCTGCGTAGACTTAGGTCCACAGGCGCAGGACaaa < 2:262005/250‑1 (MQ=255) gATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATGATCTGCGTAGACTTAGGTCCACAGGCGCAGGACaaa < 1:567632/250‑1 (MQ=255) tGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATGATCTGCGGAGCCTTAGGTCAACAGGCGCAGGCCAAAGcc > 2:125026/1‑251 (MQ=255) aCCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATGATCTGCGTAGACTTAGGTCCACAGGCGCAGGACAAAGCCGGGGATcc < 1:1038022/251‑1 (MQ=255) cTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGgc > 1:224991/1‑185 (MQ=255) 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> 1:739001/1‑164 (MQ=255) gAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATGATCTGCGTAGACTTAGGTCCACAGGCGCAGGACAAAGCCGGGGATCCGGTCATTTTATGGGGCGAAGGttt > 1:199098/1‑251 (MQ=255) gAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATGATCTGCGTAGACTTAGGTCCACAGGCGCAGGACAAAGCCGGGGATCCGGTCATTTTATGGGGCGAAGGttt < 1:336028/251‑1 (MQ=255) gAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATGATCTGCGTAGACTTAGGTCCACAGGCGCAGGACAAAGCCGGGGATCCGGTCATTTTATGGGGCGAAGGtt < 1:718360/250‑1 (MQ=255) 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TGGCGTCTCGCCGCTGGAAGATCGCTCCACCGGTGCCGATTTTGGCTGTCAGCCAGTGATGTCACTAACCTCCAGCCTGATTGCCGTGCGTGAGCATAAAGCCGGAGAGCCTGTTGGTTATGGTGGAACCTGGGTAAGCGAACGTGATACCCGTCTTGGCGTAGTCGCGATGGGCTATGGCGATGGTTATCCGCGCGCCGCGCCGTCCGGTACGCCAGTGCTGGTGAACGGTCGCGAAGTACCGATTGTCGGGCGCGTGGCGATGGATATGATCTGCGTAGACTTAGGTCCACAGGCGCAGGACAAAGCCGGGGATCCGGTCATTTTATGGGGCGAAGGTTTGCCCGTAGAACGTATCGCTGAAATGACGAAAGTAAGCGCTTACGAACTTATTACGCGCCTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAAT > NC_000913/4266426‑4266926 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |