New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 262834 = | 132 (0.860) | 3 (0.020) | 3/486 | 5.8 | 1.7% | intergenic (+78/‑37) | proA/thrW | glutamate‑5‑semialdehyde dehydrogenase/tRNA‑Thr |
? | NC_000913 | 3195663 = | 212 (1.390) | coding (1091/1434 nt) | hldE | fused heptose 7‑phosphate kinase/heptose 1‑phosphate adenyltransferase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CGTCCGCTGTTTACGTTAACGCCTCTACGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGAT > NC_000913/262584‑263072 | cGTCCGCTGTTTACGTTAACGCCTCTACGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTc < 2:577407/251‑1 (MQ=255) gTCCGCTGTTTACGTTAACGCCTCTACGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCCATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCCTTGGGGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCCTCGCCCGGTTAGGTTTAACCTTGTcc > 1:104404/1‑251 (MQ=255) gTCCGCTGTTTACGTTAACGCCTCTACGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTcc < 2:548862/251‑1 (MQ=255) gTTTACGTTAACGCCTCTACGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGt < 1:23916/249‑1 (MQ=255) ttACGTTAACGCCTCTACGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACCCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGGAGCACTGACCACCTACAAATGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGGAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGGAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGTCGCATCGCCCGGTTAGTTTTTACCTTTTcccccctggtt > 2:656373/1‑242 (MQ=255) ttACGTTAACGCCTCTACGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAACACACAAAAACTCCCCGCGCGGGGCCCCATGGGGGTGGAAGCACTGACCACTTACAAGGGGATCGGCATTGGTGGTTACACCAATCGGTG‑GGAAATAAAAACGGGTGAGGCAAAAGAAGCCATTTGATTCACAAAGCCCTTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGCGAtt > 1:141603/1‑251 (MQ=255) tACGTTAACGCCTCTACGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGAtt < 1:661777/250‑1 (MQ=255) tACGTTAACGCCTCTACGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAAGACAAAAAAACACCCCGCGCGAGGCCCAAAGGGGCTGGGAGAACTGACCACTTACAAGGGGCTCGGGCGTGGTGTATATACCATTCG‑TGCGCAAAAAAAACAGGGGGATGCCAAAATACGCATTTGATTCACAAAGCGATTGACGGAATGCCCGGGTTGTTTTAACCTTGTCCACCGTGCTTc > 1:948401/1‑251 (MQ=255) ccgccgcTACGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACACAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCg < 2:378372/250‑1 (MQ=255) cGCCTCTACGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGt < 1:668899/251‑1 (MQ=255) aCGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTGTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGGGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAAc < 2:1009026/248‑1 (MQ=255) aCGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATg < 1:1024892/251‑1 (MQ=255) gcgTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACCCAAAAACTCCACCCGCGTGGCCCCATGGGGCTGGAAGCACTGGCCCCTTACAAAGGGATCGGCCTTGGGGGTTACACCATTCG‑GGCGTAAATAAAACCGGGGGGTGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTTGTTTTTACCTTGTCCACCCTGGTTTACGTTCGTGAACATGTc > 2:395751/1‑251 (MQ=255) ggtttACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCTCGTTCGTGAACATGTCCt < 2:897378/249‑1 (MQ=255) tttACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTTAACATGTCCtt < 2:141603/250‑1 (MQ=255) ttACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGAGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCCATTGGGCTGGAAGCACTGGACACTTTCAAGTGGATCGGGCTTGGGGATTACACCCTTCG‑TGCGGGAATAAAACCCGGGGATTCCAAAGTAGCCATTTGATTTACAAAGCCATTGACGCATCGCCCGGGTAGTTTTAATCTTGTCCCCCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCtttt > 1:595354/1‑250 (MQ=255) cggcggCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCCCGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGGAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGGTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCg > 1:545490/1‑251 (MQ=255) cggcCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGGAAACACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCCATGGGGCTGGGAGCACCGACCCCTTACAAGTGGGTCGGCCTTGGTGGTTTCACCCTTTG‑TGCGTAAATAAAAACGGGGGGTGCAAAAATAGCCATTTTATTCACAAGGCCATTGACGCCTCCGCCGGTTAGTTTTTACCTTGTCCACCCTGATTTCCGTTCGTTGACATGTCCTTTCAAGGCCggt > 2:314567/1‑248 (MQ=255) gcCAGTTTGGGCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCAGCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGAtata < 2:1000329/251‑1 (MQ=255) ccAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTGCGGGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAg < 2:489875/251‑1 (MQ=255) cAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGGTATAGc > 1:836976/1‑251 (MQ=255) cAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGc < 1:953116/251‑1 (MQ=255) gTTTGGGCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTc < 2:860088/251‑1 (MQ=255) ggTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGtt < 1:957372/251‑1 (MQ=255) gggTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTgg < 1:1139300/248‑1 (MQ=255) gggTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTgg < 1:948489/248‑1 (MQ=255) ggCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGagc < 2:545490/250‑1 (MQ=255) gCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGagc < 1:673470/250‑1 (MQ=255) 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CGTCCGCTGTTTACGTTAACGCCTCTACGCGTTTTACCGACGGCGGCCAGTTTGGTCTGGGTGCGGAAGTGGCGGTAAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTGGCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACTTACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCG‑TGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGAT > NC_000913/262584‑263072 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |